ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಜಾಗತಿಕ ಪ್ರಸರಣ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆ ವಿಕಸನದಲ್ಲಿ ಒಮ್ಮುಖ ಆನುವಂಶಿಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ

ಜಿನೋಮ್ ಎವಲ್ಯೂಷನ್

ಪ್ರಕೃತಿ
ಸಂವಹನಗಳು

ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಜಾಗತಿಕ ಪ್ರಸರಣ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆ ವಿಕಸನದಲ್ಲಿ ಒಮ್ಮುಖ ಆನುವಂಶಿಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ

ಪ್ಯಾಕ್ಬಿಯೊ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್, ಜಿನೋಮ್ ಡಿ ನೊವೊ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಸೇವೆಗಳನ್ನು ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಟೆಕ್ನಾಲಜೀಸ್ ಒದಗಿಸಿದೆ.

ಮುಖ್ಯಾಂಶಗಳು

1.15.5 Mb ನ ಕಾಂಟಿಗ್ N50 ನೊಂದಿಗೆ ಉತ್ತಮ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್-ಲೆವೆಲ್ ಸೀಹಾರ್ಸ್ (ಹಿಪೊಕ್ಯಾಂಪಸ್ ಎರೆಕ್ಟಸ್) ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ.

2.ವಿಶ್ವದಾದ್ಯಂತ 21 ಸಮುದ್ರಕುದುರೆ ಜಾತಿಗಳಿಂದ ಒಟ್ಟು 358 ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ.

3.ಆಲಿಗೋಸೀನ್‌ನ ಕೊನೆಯಲ್ಲಿ ಸಮುದ್ರಕುದುರೆಗಳು ವಿಕಸನಗೊಂಡವು ಮತ್ತು ನಂತರದ ಸರ್ಕಮ್-ಗ್ಲೋಬಲ್ ವಸಾಹತು ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸಾಗರ ಪ್ರವಾಹಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಲಿಯೊಟೆಂಪೊರಲ್ ಸಮುದ್ರಮಾರ್ಗದ ತೆರೆಯುವಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ ಬದಲಾಗುತ್ತಿರುವ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್‌ಗೆ ಲಿಂಕ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ

4.ಮರುಕಳಿಸುವ "ಎಲುಬಿನ ಮುಳ್ಳುಗಳು" ಅಡಾಪ್ಟಿವ್ ಫಿನೋಟೈಪ್‌ನ ಆನುವಂಶಿಕ ಆಧಾರವು ಪ್ರಮುಖ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಜೀನ್‌ನಲ್ಲಿ ಸ್ವತಂತ್ರ ಪರ್ಯಾಯಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿದೆ.

5.ಸಾಗರದ ಪ್ರವಾಹಗಳ ಮೂಲಕ ರಾಫ್ಟಿಂಗ್ ಕಳಪೆ ಪ್ರಸರಣವನ್ನು ಸರಿದೂಗಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಕ್ಷಿಪ್ರ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯು ಹೊಸ ಆವಾಸಸ್ಥಾನಗಳನ್ನು ವಸಾಹತುವನ್ನಾಗಿ ಮಾಡಲು ಅನುಕೂಲವಾಗುತ್ತದೆ

ಸಾಧನೆಗಳು

ಚಿತ್ರ 1 ಆನುವಂಶಿಕ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು 358 ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆ ಮಾದರಿಗಳ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಸಂಬಂಧಗಳು

ಎ22 ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್‌ಗಳಾದ್ಯಂತ 21 ಸಮುದ್ರಕುದುರೆ ಜಾತಿಗಳ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ (π) ಮಾದರಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಮಾದರಿ ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆಗಳಿಗೆ ಭೌಗೋಳಿಕ ಮಾದರಿ ಸ್ಥಳಗಳು.b 358 ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆಗಳ ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ SNP ಗಳೊಂದಿಗೆ ನಿರ್ಮಿಸಲಾದ ನೆರೆಹೊರೆಯ ಮರ.(a) ನಲ್ಲಿನ ಸ್ಥಳ ಪಿನ್ ಚಿಹ್ನೆಗಳು ಮತ್ತು (b) ನಲ್ಲಿನ ಶಾಖೆಯ ಹಿನ್ನೆಲೆ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧಿಸಿರುತ್ತವೆ.

ಚಿತ್ರ 2 ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆಗಳ ವಸಾಹತು ಮತ್ತು ಜನಸಂಖ್ಯಾ ಇತಿಹಾಸ

ಎ21 ಸಮುದ್ರಕುದುರೆ ಜಾತಿಗಳಿಗೆ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಟ್ರೀ ಮತ್ತು ಡೈವರ್ಜೆನ್ಸ್ ಸಮಯದ ಅಂದಾಜು.ಶಾಖೆಯ ಸಾಲಿನ ದಪ್ಪವು ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಗಾತ್ರದ ಅಂದಾಜುಗಳಿಗೆ (Ne) ಅನುರೂಪವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಬಣ್ಣಗಳು ವಿಭಿನ್ನ ವಂಶಾವಳಿಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ.I-III ಚಿಹ್ನೆಗಳು ಮಾಪನಾಂಕ ನಿರ್ಣಯ ಬಿಂದುಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ.b-d ಡೈವರ್ಜೆನ್ಸ್ ಸಮಯ, ವಿತರಣೆ, ವಿಕಾರಿಯನ್ಸ್ ಘಟನೆಗಳು ಮತ್ತು ಸಾಗರ ಪ್ರವಾಹಗಳು (ಬಿಳಿ ಬಾಣಗಳು) ಆಧರಿಸಿ ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆಗಳ ವಸಾಹತುಶಾಹಿ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು (ಬಣ್ಣದ ಬಾಣಗಳು) ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ.b ಇಂಡೋ-ಆಸ್ಟ್ರೇಲಿಯನ್ ದ್ವೀಪಸಮೂಹವು ಹಿಪೊಕ್ಯಾಂಪಸ್ ಕುಲದ ಮೂಲದ ಕೇಂದ್ರವಾಗಿತ್ತು (ಕೆಂಪು ಗುರುತು) ಸಮುದ್ರಕುದುರೆಗಳು 18-23 ಮಾ.c ಸಮುದ್ರಕುದುರೆಗಳು ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಅಟ್ಲಾಂಟಿಕ್ ಮಹಾಸಾಗರವನ್ನು ತೆರೆಯುವ ಟೆಥಿಯಾನ್ ಸಮುದ್ರಮಾರ್ಗದ ಮೂಲಕ ವಸಾಹತುವನ್ನಾಗಿ ಮಾಡಿತು, ಅದು ಮುಚ್ಚಿದ ನಂತರ (7-13 ಮಾ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಈವೆಂಟ್), ಈ ಟೆಥಿಯಾನ್ ವಂಶಾವಳಿಯನ್ನು ಅದರ ಹಿಂದೂ ಮಹಾಸಾಗರದ ಸಹೋದರಿ ವಂಶದಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಿತು.ಎರಡನೆಯದು, ತರುವಾಯ ಅರೇಬಿಯನ್ ಸಮುದ್ರದಲ್ಲಿ ವೇಗವಾಗಿ ವೈವಿಧ್ಯಗೊಳಿಸಿತು (ಹಳದಿ ಗುರುತು), ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆ ವೈವಿಧ್ಯೀಕರಣದ ಎರಡನೇ ಕೇಂದ್ರವನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಿತು.d ಅಟ್ಲಾಂಟಿಕ್ ಮಹಾಸಾಗರದ ಎರಡನೇ ಸಮುದ್ರಕುದುರೆ ವಸಾಹತು ಘಟನೆಯು ಹಿಂದೂ ಮಹಾಸಾಗರದಿಂದ ಸುಮಾರು 5Ma ದಕ್ಷಿಣ ಆಫ್ರಿಕಾದ ತುದಿಯನ್ನು ಹಾದುಹೋಗುವ ಮೂಲಕ ಸಂಭವಿಸಿತು ಮತ್ತು ಅಂತಿಮವಾಗಿ ಪೂರ್ವ ಪೆಸಿಫಿಕ್ ಸಾಗರವನ್ನು ಇನ್ನೂ ತೆರೆದಿರುವ ಪನಾಮ ಸಮುದ್ರಮಾರ್ಗದ ಮೂಲಕ ಸುಮಾರು 3.6 Ma.

ಚಿತ್ರ 3 ಜೀನ್ ಹರಿವು ಮತ್ತು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಗಾತ್ರದಲ್ಲಿನ ಏರಿಳಿತಗಳು

ಎದಕ್ಷಿಣ ಅಟ್ಲಾಂಟಿಕ್ ಸಾಗರದಲ್ಲಿ ವಾಸಿಸುವ ಜಾತಿಗಳ ನಡುವೆ ಜೀನ್ ಹರಿವು ಪತ್ತೆಯಾಗಿದೆ.G-PhoCS ನಿಂದ ಕಡಿತಗೊಳಿಸಲಾದ ವಲಸೆಯ ದರದಂತೆ ವಂಶವಾಹಿ ಹರಿವು ಬಿಳಿ ರೇಖೆಗಳ ಬಳಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ.ಬಾಣಗಳ ದಪ್ಪ ಮತ್ತು ದಿಕ್ಕು ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ದರಗಳು ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಹರಿವಿನ ದಿಕ್ಕಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿರುತ್ತವೆ.b PSMC ಯಿಂದ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಗಾತ್ರದಲ್ಲಿ ಏರಿಳಿತಗಳು.x ಅಕ್ಷವು ಪ್ರಸ್ತುತಕ್ಕಿಂತ ಹಿಂದಿನ ವರ್ಷಗಳಲ್ಲಿ ಸಮಯವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ ಆದರೆ y ಅಕ್ಷವು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಗಾತ್ರವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ.ವಿವಿಧ ವಿತರಣಾ ಪ್ರದೇಶಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಜಾತಿಯ ಭೌಗೋಳಿಕ ವಿತರಣೆಯ ಪ್ರಕಾರ ಚಾರ್ಟ್‌ಗಳನ್ನು ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಆಯೋಜಿಸಲಾಗಿದೆ.c ಮೀಟರ್‌ನಲ್ಲಿ ಕಳೆದ 1 ಮಿಲಿಯನ್ ವರ್ಷಗಳಲ್ಲಿ ಸಮುದ್ರ ಮಟ್ಟ ಬದಲಾವಣೆ.ಹಳದಿ ರೇಖೆಯು ಕೊನೆಯ ಜಾಗತಿಕ ಇಂಟರ್ಗ್ಲೇಶಿಯಲ್ ಶಿಖರವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ ಆದರೆ ಸಯಾನ್ ಛಾಯೆಯು ಕೊನೆಯ ಹಿಮನದಿಯ ಗರಿಷ್ಠ ಅವಧಿಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.

ಚಿತ್ರ 4 ಸ್ಪೈನ್ಗಳ ವಿಕಸನ.

ಎಎಡ, ಜಾತಿಯ ಮರವು ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆಗಳಲ್ಲಿ ಸ್ಪೈನ್ಗಳ ಸ್ವತಂತ್ರ ವಿಕಸನವನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ.ಶಾಖೆಯ ಉದ್ದವು ಪ್ರತಿ ಸೈಟ್‌ಗೆ ಪರ್ಯಾಯಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ನಾಲ್ಕು ಸ್ಪೈನಿ ಸೀಹಾರ್ಸ್ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ನೀಲಿ ಬಣ್ಣದಲ್ಲಿ ಹೈಲೈಟ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ.ದಪ್ಪವಾದ ಶಾಖೆಗಳು bmp3 ಜೀನ್‌ಗೆ ಸಮಾನಾರ್ಥಕವಲ್ಲದ-ಸಮಾನಾರ್ಥಕ ಪರ್ಯಾಯಗಳ (dN/dS) ಹೆಚ್ಚಿನ ದರಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿರುತ್ತವೆ.Bmp3 ಜೀನ್‌ಗಾಗಿ ಅಂಗೀಕೃತ ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯೀಕರಿಸಿದ ಮೆಕ್‌ಡೊನಾಲ್ಡ್ ಮತ್ತು ಕ್ರೆಟ್‌ಮ್ಯಾನ್ ಪರೀಕ್ಷೆ (MKT) ಅನ್ನು ಮೂರು ಜೋಡಿಯಾಗಿ ಸಹೋದರ ಜಾತಿಗಳಿಗೆ ವಿಭಿನ್ನ ಸ್ಪೈನಿ ಮತ್ತು ಸ್ಪೈನಿ ಅಲ್ಲದ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳೊಂದಿಗೆ ಹಿನ್ನೆಲೆ ಬಣ್ಣಗಳಿಂದ ಹೈಲೈಟ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ, ಅದರ ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆಯ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಕ್ರಮವಾಗಿ ನೀಲಿ ಮತ್ತು ಕೆಂಪು ಫಾಂಟ್‌ನೊಂದಿಗೆ p ಮೌಲ್ಯದಿಂದ ಸೂಚಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.ಸರಿ, ಬಿಎಂಪಿ3 ಪ್ರೊಟೀನ್‌ನಲ್ಲಿನ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಪರ್ಯಾಯಗಳ ಹೋಲಿಕೆ, ಸ್ಪೈನಿ ಸೀಹಾರ್ಸ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಪಾಲಿಮಾರ್ಫಿಕ್ ಮತ್ತು ಸ್ಥಿರ ಪರ್ಯಾಯಗಳನ್ನು ಕ್ರಮವಾಗಿ ಕೆಂಪು ಮತ್ತು ನೀಲಿ ವಲಯಗಳೊಂದಿಗೆ ಸೂಚಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.b ಸ್ಪೈನಿ ಅಲ್ಲದ ಜಾತಿಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಸ್ಪೈನಿ ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆಗಳಲ್ಲಿ bmp3 ನಲ್ಲಿ dN/dS ಮೌಲ್ಯಗಳ ವಿತರಣೆ.c ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರದಲ್ಲಿ ಸ್ವತಂತ್ರ ವಿಕಸನವನ್ನು bmp3 ಮೂಲಕ ಎನ್‌ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಾಗಿ ಮರುನಿರ್ಮಿಸಲಾಯಿತು.d ಹಿಪೊಕ್ಯಾಂಪಸ್ ಎರೆಕ್ಟಸ್‌ನಲ್ಲಿ bmp3 ನ ಸಿಟು ಹೈಬ್ರಿಡೈಸೇಶನ್‌ನಲ್ಲಿ ಸಂಪೂರ್ಣ-ಮೌಂಟ್.

ಉಲ್ಲೇಖ

ಲಿ ಸಿ ಮತ್ತು ಇತರರು.ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಜಾಗತಿಕ ಪ್ರಸರಣ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆ ವಿಕಸನದಲ್ಲಿ ಒಮ್ಮುಖ ಆನುವಂಶಿಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ.ನ್ಯಾಟ್ ಕಮ್ಯೂನ್.2021 ಫೆಬ್ರವರಿ 17;12(1):1094.

ಸುದ್ದಿ ಮತ್ತು ಮುಖ್ಯಾಂಶಗಳು ಇತ್ತೀಚಿನ ಯಶಸ್ವಿ ಪ್ರಕರಣಗಳನ್ನು ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಟೆಕ್ನಾಲಜೀಸ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಕಾದಂಬರಿ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಸಾಧನೆಗಳು ಮತ್ತು ಅಧ್ಯಯನದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅನ್ವಯಿಸಲಾದ ಪ್ರಮುಖ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಸೆರೆಹಿಡಿಯುವುದು.

ಪೋಸ್ಟ್ ಸಮಯ: ಜನವರಿ-06-2022