-
Нанопор Тулы озынлыктагы транскриптомика
Организмдагы катлаулы һәм үзгәрүчән альтернатив изоформалар ген экспрессиясен һәм протеин төрлелеген көйләү өчен мөһим генетик механизмнар.Транскрипция структураларын төгәл ачыклау ген экспрессиясен көйләү формаларын тирәнтен өйрәнү өчен нигез булып тора.Нанопор эзләү платформасы транскриптомик өйрәнүне изоформ дәрәҗәсенә уңышлы китерде.Бу анализ платформасы Нанопор платформасында барлыкка килгән RNA-Seq мәгълүматларын белешмә геном нигезендә анализлау өчен эшләнгән, бу ген дәрәҗәсендә дә, транскрипция дәрәҗәсендә дә сыйфатлы һәм санлы анализларга ирешә.
-
Эволюцион генетика
Халык һәм эволюцион генетик анализ платформасы еллар дәвамында BMK R&D коллективында тупланган зур тәҗрибә нигезендә төзелгән.Бу аеруча биоинформатика белгечлеге булмаган тикшерүчеләр өчен кулланучының дустанә коралы.Бу платформа филогенетик агач төзелеше, бәйләнеш тигезләнеше анализы, генетик төрлелекне бәяләү, сайлап алу анализы, туганлык анализы, PCA, халык структурасы анализы кебек төп эволюцион генетика белән бәйле төп анализ ясарга мөмкинлек бирә.
-
түгәрәк-РНК
Түгәрәк РНК (циркРНА) - кодсыз РНК төре, күптән түгел үсештә, әйләнә-тирә мохиткә каршы торуда катнашучы көйләү челтәрендә мөһим роль уйный торган сызыклы РНК молекулаларыннан аерылып тора, мәсәлән, mRNA, lncRNA, 3 ′ һәм 5 ′ circRNA очлары бергә кушылып түгәрәк структура формалаштыралар, бу аларны экзонуклазның ашкайнатуыннан саклый һәм күпчелек сызыклы РНКга караганда тотрыклырак.CircRNA ген экспрессиясен көйләүдә төрле функцияләргә ия.CircRNA miRNA белән бәйли торган, miRNA губка дип аталган ceRNA ролен башкара ала.CircRNA эзлекле анализ платформасы circRNA структурасын һәм экспресс-анализны, максатчан фаразлауны һәм башка төр РНК молекулалары белән уртак анализны көчәйтә.
-
BSA
Күпчелек сегрегант анализ платформасы бер этаплы стандарт анализдан һәм параметрлаштырылган параметрлар белән алдынгы анализдан тора.BSA - фенотип белән бәйле генетик маркерларны тиз ачыклау өчен кулланылган техника.BSA-ның төп эш процессы үз эченә ала: 1. бик каршылыклы фенотиплар булган ике төркемне сайлау;2. ДНК, РНК яки SLAF-seq (Биомаркер тарафыннан эшләнгән) ике төп ДНК формалаштыру өчен;3. белешмә геномга каршы дифференциаль эзлеклелекне ачыклау, 4. кандидат белән бәйләнгән төбәкләрне ED һәм SNP-индекс алгоритмы белән фаразлау;5. Кандидат регионнарындагы геннарны функциональ анализлау һәм баету һ.б.
-
Ампликон (16S / 18S / ITS)
Amplicon (16S / 18S / ITS) платформасы микробиаль күптөрлелек проектын анализлау буенча күп еллык тәҗрибәсе белән эшләнгән, анда стандартлаштырылган төп анализ һәм персональ анализ бар: төп анализ хәзерге микробиаль тикшеренүләрнең төп анализ эчтәлеген үз эченә ала, анализ эчтәлеге бай һәм комплекслы, һәм анализ нәтиҗәләре проект докладлары рәвешендә тәкъдим ителә;Персональләштерелгән анализның эчтәлеге төрле.Персональләштерелгән таләпләрне тормышка ашыру өчен, үрнәкләр сайланырга мөмкин, параметрлар төп анализ отчеты һәм тикшеренү максаты буенча сыгылмалы итеп куелырга мөмкин.Windows операцион системасы, гади һәм тиз.
-
Протеомика
Протеомика күзәнәк, тукыманың яки организмның хәзерге эчтәлеген гомуми протеиннарны санлаштыру өчен технологияләр куллануны үз эченә ала.Протеомикага нигезләнгән технологияләр төрле диагностик маркерларны ачыклау, вакцина җитештерүгә кандидатлар, патогенитет механизмнарын аңлау, төрле сигналларга җавап итеп белдерү формаларын үзгәртү һәм төрле авыруларда функциональ белок юлларын аңлату кебек төрле тикшеренүләр өчен төрле куәтләрдә кулланыла.Хәзерге вакытта санлы протеомика технологияләре, нигездә, TMT, Label Free һәм DIA санлы стратегияләргә бүленә.
-
Метаболомика
Метаболома - геномның терминал аскы продукты һәм күзәнәк, тукыма яки организмдагы аз молекуляр авырлыктагы молекулаларның (метаболиталар) тулы комплектыннан тора.Метаболомика физиологик стимул яки авыру шартларында кечкенә молекулаларның киңлеген үлчәргә омтыла.Метаболомика методикасы ике төрле төркемгә бүленә: максатсыз метаболомика, үрнәктә барлык үлчәнә торган аналитикларга комплекслы анализ, GC-MS / LC-MS кулланган химик билгесезлекләр, һәм максатчан метаболомика, химик характеристика төркемнәрен үлчәү һәм биохимик метаболитлар.
-
Genсемлек / Хайваннар Де Ново Геном эзлеклелеге
Яңаэзләү - технологияләр ярдәмендә төрнең бөтен геномын төзүне аңлата, мәсәлән, PacBio, Nanopore, NGS һ.б., белешмә геном булмаганда.Өченче буын эзләү технологияләренең уку озынлыгының искиткеч камилләшүе катлаулы геномнарны җыюда яңа мөмкинлекләр китерде, мәсәлән, югары гетерозигозияле, кабатланучы төбәкләрнең зур өлеше, полиплоидлар һ.б. кабатланучы элементларны, аномаль GC эчтәлеге булган төбәкләрне һәм башка бик катлаулы төбәкләрне чишү.
Платформа ： PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Сәлам-С нигезендә Геном Ассамблеясы
Hi-C - якынлыкка нигезләнгән үзара бәйләнешне һәм югары үткәргеч эзлеклелеген берләштереп хромосома конфигурациясен алу өчен эшләнгән ысул.Бу үзара бәйләнешнең интенсивлыгы хромосомалардагы физик дистанция белән тискәре бәйләнештә дип санала.Шуңа күрә, Hi-C мәгълүматлары кластерларга, заказларга һәм җыелган эзлеклелектә геном проектында юнәлеш бирергә һәм билгеле сандагы хромосомаларга якорь ясарга мөмкин.Бу технология халыкка нигезләнгән генетик карта булмаганда хромосома дәрәҗәсендәге геном җыюны көчәйтә.Everyәрбер геномга Hi-C кирәк.
Платформа ： Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Эволюцион генетика
Эволюцион генетика - SNPs, InDels, SVs һәм CNVларны кертеп, генетик вариацияләр нигезендә бирелгән материалларның эволюцион мәгълүматы турында тулы аңлатма бирү өчен эшләнгән пакетлы эзлекле хезмәт.Ул популяциянең эволюцион үзгәрешләрен һәм генетик үзенчәлекләрен тасвирлау өчен кирәк булган барлык төп анализларны бирә, мәсәлән, халык структурасы, генетик төрлелек, филогения мөнәсәбәтләре һ.б.
