-
Nanopore تولۇق ئۇزۇنلۇقتىكى ترانسكرىپسىيە
جانلىقلاردىكى مۇرەككەپ ۋە ئۆزگىرىشچان باشقا ئىزفورلار گېننىڭ ئىپادىلىنىشى ۋە ئاقسىلنىڭ كۆپ خىللىقىنى تەڭشەشتىكى مۇھىم گېن مېخانىزىمى.ترانسكرىپسىيە قۇرۇلمىسىنى توغرا پەرقلەندۈرۈش گېن ئىپادىلەشنى تەڭشەش ئەندىزىسىنى چوڭقۇر تەتقىق قىلىشنىڭ ئاساسى.Nanopore تەرتىپلەش سۇپىسى ترانسكرىپسىيە تەتقىقاتىنى مۇۋەپپەقىيەتلىك ھالدا ئىفورم سەۋىيىسىگە ئېلىپ كەلدى.بۇ ئانالىز سۇپىسى نانوپور سۇپىسىدا ھاسىل قىلىنغان RNA-Seq سانلىق مەلۇماتلىرىنى پايدىلىنىش گېنلىرى ئاساسىدا ئانالىز قىلىش ئۈچۈن لايىھەلەنگەن بولۇپ ، گېن سەۋىيىسى ۋە خاتىرىلەش سەۋىيىسىدە سۈپەت ۋە مىقدار ئانالىزىغا ئېرىشىدۇ.
-
تەدرىجى تەرەققىيات گېنىتىكىسى
نوپۇس ۋە تەدرىجىي تەرەققىيات گېن ئانالىز سۇپىسى BMK R&D گۇرۇپپىسىدا كۆپ يىل توپلانغان غايەت زور تەجرىبە ئاساسىدا قۇرۇلدى.ئۇ بىيو ئۇچۇر تېخنىكىسى كەسپىدە بولمىغان تەتقىقاتچىلار ئۈچۈن ئىشلەتكۈچىلەرگە دوستانە قورال.بۇ سۇپا فىلوگېنتىك دەرەخ ياساش ، ئۇلىنىش كېسەللىكى ئانالىزى ، ئىرسىيەتنىڭ كۆپ خىللىقىنى باھالاش ، تاللاش سۈپۈرۈش ئانالىزى ، تۇغقاندارچىلىق ئانالىزى ، PCA ، نوپۇس قۇرۇلمىسىنى ئانالىز قىلىش قاتارلىق ئاساسلىق تەدرىجىي تەرەققىيات گېنىتىكىغا مۇناسىۋەتلىك ئاساسلىق ئانالىزلارنى تەمىنلەيدۇ.
-
circ-RNA
ئايلانما RNA (circRNA) كودلاشتۇرمايدىغان RNA نىڭ بىر تۈرى بولۇپ ، يېقىندا تەرەققىي قىلىش ، مۇھىتقا قارشى تۇرۇش قاتارلىقلارغا چېتىلىدىغان نازارەت قىلىپ باشقۇرۇش تورىدا موھىم رول ئوينايدىغانلىقى بايقالدى ، مەسىلەن RNA ، lncRNA ، 3 ′ ۋە 5 ′. ئايلانما RNA نىڭ ئۇچى بىرلىشىپ ئايلانما قۇرۇلما ھاسىل قىلىدۇ ، بۇ ئۇلارنى تاشقى ماددىلارنىڭ ھەزىم قىلىشىدىن ساقلاپ قالىدۇ ھەمدە كۆپىنچە سىزىقلىق RNA غا قارىغاندا مۇقىم بولىدۇ.CircRNA نىڭ گېننىڭ ئىپادىلىنىشىنى تەڭشەشتە كۆپ خىل رولى بارلىقى بايقالدى.CircRNA miRNA نى رىقابەت كۈچى بىلەن باغلايدىغان ceRNA رولىنى ئوينايدۇ ، miRNA سپون دەپ ئاتىلىدۇ.CircRNA رەت تەرتىپىنى ئانالىز قىلىش سۇپىسى ئايلانما RNA قۇرۇلمىسى ۋە ئىپادىلەش ئانالىزى ، نىشاننى ئالدىن پەرەز قىلىش ۋە باشقا تىپتىكى RNA مولېكۇلىلىرى بىلەن ئورتاق تەھلىل قىلىش ھوقۇقىنى بېرىدۇ.
-
BSA
توپلاشتۇرۇلغان Segregant ئانالىز سۇپىسى خاسلاشتۇرۇلغان پارامېتىر تەڭشىكى بىلەن بىر باسقۇچلۇق ئۆلچەملىك ئانالىز ۋە ئىلغار ئانالىزدىن تەركىب تاپىدۇ.BSA فېنوت تىپىغا مۇناسىۋەتلىك گېن بەلگىسىنى تېز پەرقلەندۈرۈش ئۈچۈن قوللىنىلىدىغان تېخنىكا.BSA نىڭ ئاساسلىق خىزمەت ئېقىمى تۆۋەندىكىلەرنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ:2. بارلىق شەخسلەرنىڭ DNA ، RNA ياكى SLAF-seq (Biomarker تەرىپىدىن ئىجاد قىلىنغان) نى بىرلەشتۈرۈپ ، ئىككى تۈركۈم DNA ھاسىل قىلىش.3. پايدىلىنىش گېنلىرىغا قارشى پەرقلىق تەرتىپنى پەرقلەندۈرۈش ، 4. ED ۋە SNP كۆرسەتكۈچ ئالگورىزىم ئارقىلىق كاندىدات باغلانغان رايونلارنى مۆلچەرلەش ؛5. كاندىدات رايونلاردىكى گېننى ئىقتىدار ئانالىزى ۋە بېيىتىش قاتارلىقلار گېن بەلگىسىنى تەكشۈرۈش ۋە دەسلەپكى لايىھىلەش قاتارلىق سانلىق مەلۇماتلاردا تېخىمۇ ئىلغار كان ئېچىشقىمۇ بولىدۇ.
-
Amplicon (16S / 18S / ITS)
Amplicon (16S / 18S / ITS) سۇپىسى مىكروبلارنىڭ كۆپ خىللىقى تۈرىنى ئانالىز قىلىشتىكى ئۇزۇن يىللىق تەجرىبىسى بىلەن تەرەققىي قىلغان بولۇپ ، ئۇ ئۆلچەملىك ئاساسىي ئانالىز ۋە خاسلاشتۇرۇلغان تەھلىلنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ: ئاساسىي ئانالىز نۆۋەتتىكى مىكروب تەتقىقاتىنىڭ ئاساسىي ئانالىز مەزمۇنىنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ ، تەھلىل مەزمۇنى مول ۋە ئەتراپلىق ، ۋە ئانالىز نەتىجىسى تۈر دوكلاتى شەكلىدە ئوتتۇرىغا قويۇلدى.خاسلاشتۇرۇلغان تەھلىلنىڭ مەزمۇنى كۆپ خىل.ئەۋرىشكەلەرنى تاللىغىلى ۋە پارامېتىرلارنى ئاساسىي ئانالىز دوكلاتى ۋە تەتقىقات مەقسىتىگە ئاساسەن جانلىق قىلىپ ، خاسلاشتۇرۇلغان تەلەپنى ئەمەلگە ئاشۇرغىلى بولىدۇ.Windows مەشغۇلات سىستېمىسى ، ئاددىي ۋە تېز.
-
Proteomics
ئاقسىل ھۈجەيرىسى ، توقۇلمىلار ياكى جانلىقلارنىڭ تەركىبىدىكى ئومۇمىي ئاقسىلنىڭ مىقدارىنى مىقدارلاشتۇرۇشتا تېخنىكىلارنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ.ئاقسىلنى ئاساس قىلغان تېخنىكىلار ھەر خىل دىئاگنوز قويۇش بەلگىسىنى بايقاش ، ۋاكسىنا ئىشلەپچىقىرىشقا كاندىدات بولۇش ، كېسەللىك قوزغاتقۇچ مېخانىزىمنى چۈشىنىش ، ئوخشىمىغان سىگناللارغا قارىتا ئىپادىلەش ئەندىزىسىنى ئۆزگەرتىش ۋە ئوخشىمىغان كېسەللىكلەردىكى ئاقسىل يولىنى چۈشەندۈرۈش قاتارلىق ئوخشىمىغان تەتقىقات ئورۇنلىرىدا ھەر خىل ئىقتىدارلاردا ئىشلىتىلىدۇ.ھازىر مىقدارلىق ئاقسىل تېخنىكىسى ئاساسلىقى TMT ، Label Free ۋە DIA مىقدار ئىستراتېگىيىسىگە ئايرىلىدۇ.
-
Metabolomics
مېتابولىزم گېننىڭ تېرمىنال تۆۋەن ئېقىمى بولۇپ ، ھۈجەيرە ، توقۇلما ياكى جانلىقلاردىكى تۆۋەن مولېكۇلا ئېغىرلىقتىكى مولېكۇلا (مېتابولىت) نىڭ تولۇق تولۇقلىنىشىدىن تەركىب تاپىدۇ.مېتابولىزم فىزىئولوگىيىلىك غىدىقلاش ياكى كېسەللىك ھالىتى دائىرىسىدە كىچىك مولېكۇلانىڭ كەڭلىكىنى ئۆلچەشنى مەقسەت قىلىدۇ.مېتابولىزم مېتودولوگىيەسى ئوخشىمىغان ئىككى گۇرۇپپىغا بۆلىنىدۇ: نىشانسىز مېتابولىزم ، GC-MS / LC-MS ئارقىلىق خىمىيىلىك نامەلۇملارنى ئۆز ئىچىگە ئالغان ئەۋرىشكە ئىچىدىكى بارلىق ئۆلچەملىك ئانالىزلارنى مەقسەتلىك ئانالىز قىلىش ۋە نىشانلىق مېتابولىزىم ، خىمىيىلىك خاراكتېرگە ئىگە ئېنىقلانغان گۇرۇپپىلارنى ئۆلچەش ۋە بىيوخىمىيىلىك ئىزاھلانغان مېتابولىتلار.
-
ئۆسۈملۈك / ھايۋانات دې نوۋو گېن گۇرۇپپىسىنىڭ تەرتىپى
De novoتەرتىپلەش دېگىنىمىز تەرتىپلەش تېخنىكىسى ئارقىلىق بىر تۈرنىڭ پۈتكۈل گېن گۇرۇپپىسىنى كۆرسىتىدۇ ، مەسىلەن PacBio ، Nanopore ، NGS قاتارلىقلار.ئۈچىنچى ئەۋلاد تەرتىپلەش تېخنىكىسىنىڭ ئوقۇش ئۇزۇنلۇقىنىڭ كۆرۈنەرلىك ياخشىلىنىشى مۇرەككەپ گېنلارنى قۇراشتۇرۇشتا يېڭى پۇرسەت ئېلىپ كەلدى ، مەسىلەن گېنىروزوزوزلىق دەرىجىسى يۇقىرى ، تەكرارلانغان رايونلارنىڭ نىسبىتى يۇقىرى ، پولىپلوئىد قاتارلىقلار. تەكرارلانغان ئېلېمېنتلارنى ھەل قىلىش ، GC مەزمۇنى نورمال بولمىغان رايونلار ۋە باشقا مۇرەككەپ رايونلارنى ھەل قىلىش.
سۇپا ： PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Hi-C نى ئاساس قىلغان گېن گۇرۇپپىسى
Hi-C يېقىن ئارىلىقنى ئاساس قىلغان ئۆز-ئارا تەسىر كۆرسىتىش ۋە يۇقىرى سۈرئەتلىك تەرتىپنى بىرلەشتۈرۈش ئارقىلىق خىروموسوم سەپلىمىسىنى تۇتۇش ئۈچۈن لايىھەلەنگەن ئۇسۇل.بۇ ئۆز-ئارا تەسىرنىڭ كۈچلۈكلۈكى خىروموسومدىكى فىزىكىلىق ئارىلىق بىلەن سەلبىي باغلىنىشلىق دەپ قارىلىدۇ.شۇڭلاشقا ، Hi-C سانلىق مەلۇماتلىرى گېن گۇرۇپپىسىدىكى قۇراشتۇرۇلغان تەرتىپلەرنىڭ توپلىنىشى ، رەتلىنىشى ۋە يۆنىلىشىگە يېتەكچىلىك قىلالايدۇ ھەمدە مەلۇم ساندىكى خروموسومغا چاپلايدۇ.بۇ تېخنىكا نوپۇسنى ئاساس قىلغان گېن خەرىتىسى بولمىغان ئەھۋالدا خروموسوم دەرىجىلىك گېن گۇرۇپپىسىنى كۈچلەندۈرىدۇ.ھەر بىر گېنغا Hi-C لازىم بولىدۇ.
سۇپا ： Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
تەدرىجى تەرەققىيات گېنىتىكىسى
تەدرىجى تەرەققىيات گېنىتىكىسى SNPs ، InDels ، SVs ۋە CNV لارنى ئۆز ئىچىگە ئالغان گېن ئۆزگىرىشىنى ئاساس قىلغان بېرىلگەن ماتېرىياللارنىڭ تەدرىجىي تەرەققىيات ئۇچۇرلىرىنى ئەتراپلىق چۈشەندۈرۈش ئۈچۈن لايىھەلەنگەن يۈرۈشلۈك مۇلازىمەت.ئۇ نوپۇسنىڭ قۇرۇلمىسى ، گېننىڭ كۆپ خىللىقى ، فىلوگېنلىق مۇناسىۋىتى قاتارلىق كىشىلەرنىڭ تەدرىجىي ئۆزگىرىشى ۋە گېن ئالاھىدىلىكىنى تەسۋىرلەشكە ئېھتىياجلىق بولغان بارلىق ئاساسلىق ئانالىزلارنى تەمىنلەيدۇ.
