-
Метагеномик эзләү (NGS)
Метагеном - организмнарның катнаш җәмгыятенең гомуми генетик материаллары җыелмасын аңлата, мәсәлән, экологик метагенома, кеше метагеномы һ.б. Анда эшкәртелә торган һәм эшкәртелмәгән микроорганизмнарның геномнары бар.Метагеномик эзлеклелек - экологик үрнәкләрдән алынган катнаш геномик материалларны анализлау өчен кулланылган молекуляр корал, ул төрләрнең күптөрлелеге һәм күплеге, халык структурасы, филогенетик бәйләнеш, функциональ геннар һәм корреляция челтәре турында экологик факторлар белән тулы мәгълүмат бирә.
Платформа ：Illumina NovaSeq6000
-
Метагеномик эзләү-Нанопор
Метагеномика - экологик үрнәкләрдән алынган катнаш геномик материалларны анализлау өчен кулланылган молекуляр корал, ул төрләрнең күптөрлелеге һәм муллыгы, халык структурасы, филогенетик бәйләнеш, функциональ геннар һәм экологик факторлар белән корреляция челтәре һ.б. турында тулы мәгълүмат бирә. Нанопор эзләү платформалары күптән түгел кертелгән. метагеномик тикшеренүләргә.Уку озынлыгында аның искиткеч эшләнеше метагеномик анализны, аеруча метагеном җыюны көчәйтте.Уку озынлыгының өстенлекләрен кулланып, Нанопорга нигезләнгән метагеномик өйрәнү мылтыклы метагеномика белән чагыштырганда өзлексез җыюга ирешә ала.Нанопорга нигезләнгән метагеномиканың микробиомалардан тулы һәм ябык бактерия геномнарын уңышлы барлыкка китерүе бастырылды (Moss, EL, һ.б.,Табигать биотехникасы, 2020)
Платформа ：Nanopore PromethION P48
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S һәм 18S rRNAдагы субунит бик сакланган һәм гипер үзгәрүчән төбәкләрне үз эченә алган прокариотик һәм эукариотик организмнарны ачыклау өчен камил молекуляр бармак эзе.Эзләүдән файдаланып, бу ампликоннар сакланган өлешләргә нигезләнеп максатчан булырга мөмкин, һәм гипер-үзгәрүчән төбәкләр микробиаль идентификация өчен тулысынча характерланырга мөмкин, микробиаль төрлелекне анализлау, таксономия, филогения һ.б. ) PacBio платформасының эзлеклелеге тулы озынлыктагы ампликоннарны каплый алырлык югары төгәл озын укулар алырга мөмкинлек бирә (якынча 1,5 Кб).Генетик кырның киңәюе бактерияләрдә яки гөмбәләр җәмгыятендә төрләр аннотациясендә резолюцияне көчәйтте.
Платформа ：PacBio Sequel II
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S / 18S / ITS ампликон эзлеклелеге филогенияне, таксономияне һәм төрләрнең күплеген микробиаль җәмгыятьтә ачыклый, югары продуктлы һәм гипервариаль өлешләрне үз эченә алган генетик маркерларның PCR продуктларын тикшереп.Бу камил молекуляр бармак эзен Woeses et al (1977) кертү изоляциясез микробиом профилен көчәйтә.16S (бактерияләр), 18S (гөмбәләр) һәм эчке транскрипцияләнгән спасер (ITS, гөмбәләр) эзлеклелеге мул төрләрне дә, сирәк һәм билгесез төрләрне дә ачыкларга мөмкинлек бирә.Бу технология киң кулланылган һәм дифференциаль микробиаль составны ачыклау өчен төрле коралга әйләнде, мәсәлән, кеше авызы, эчәклек, зәвык һ.б.
Платформа ：Illumina NovaSeq6000
-
Бактерия һәм гөмбә тулы геномны кабат эзләү
Бактерия һәм гөмбә тулы геномны кабат эзләү - билгеле бактерия һәм гөмбәләрнең геномнарын тулыландыру, шулай ук берничә геномны чагыштыру яки яңа организмнарның геномнарын картина ясау өчен критик корал.Төгәл белешмә геномнар булдыру, микробиаль идентификация һәм башка чагыштырма геном тикшеренүләре ясау өчен, бактерия һәм гөмбәләрнең бөтен геномнарын эзләү бик мөһим.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Гөмбә геномы
Biomarker Technologies конкрет тикшеренү максатына карап геном тикшерүен, нечкә геномны һәм гөмбәнең тулы геномын тәэмин итә.Геном эзлеклелеге, җыю һәм функциональ аннотация Киләсе буын эзлеклелеген + Өченче буын эзлеклелеген берләштереп, югары дәрәҗәдәге геном җыюга ирешергә мөмкин.Хромосома дәрәҗәсендә геном җыюны җиңеләйтү өчен Hi-C технологиясе дә кулланылырга мөмкин.
Платформа ：PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Бактерияләр тулы геном
Biomarker Technologies нуль аермасы булган бактерияләрнең тулы геномын төзү буенча эзлекле хезмәт күрсәтә.Геном төзелешенең бактерияләренең төп эш процессы өченче буын эзлеклелеген, җыюны, функциональ аннотацияне һәм конкрет тикшеренү максатларын үтәгән алдынгы биоинформатик анализны үз эченә ала.Бактерияләр геномының тулырак профиле аларның биологик процесслары нигезендәге төп механизмнарны ачарга ярдәм итә, алар шулай ук югары эукариотик төрләрдә геном тикшеренүләре өчен кыйммәтле белешмәлек бирә ала.
Платформа ：Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
