-
Metatranszkriptom szekvenálás
A metatranszkriptom szekvenálás azonosítja a mikrobák (eukarióták és prokarióták) génexpresszióját természetes környezetben (pl. talajban, vízben, tengerben, ürülékben és bélben). Pontosabban, ez a szolgáltatás lehetővé teszi komplex mikrobiális közösségek teljes génexpressziós profiljának megszerzését, taxonómiai elemzést. fajok, eltérően expresszált gének funkcionális dúsítási elemzése és így tovább.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Gombás genom
A Biomarker Technologies a konkrét kutatási céltól függően biztosítja a gombák genomfelmérését, finom genomját és pene-teljes genomját.A genom szekvenálása, összeállítása és funkcionális annotációja a következő generációs szekvenálás + harmadik generációs szekvenálás kombinálásával érhető el a magas szintű genom összeállítás érdekében.A Hi-C technológia a genom kromoszóma szintű összeállításának megkönnyítésére is használható.
Felület:PacBio folytatása II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq platform
-
Eszközkészletek
A BMKCloud egy vezető bioinformatikai platform, amely egyablakos megoldást kínál a genomikai programokhoz, amelyben széles körben megbíznak a kutatók számos területen, beleértve az orvosi, mezőgazdasági, környezetvédelmi stb. területeket. A BMKCloud elkötelezett amellett, hogy integrált, megbízható és hatékony szolgáltatásokat nyújtson, beleértve a bioinformatikai elemzési platformokat és eszközöket. , számítási erőforrások, nyilvános adatbázis, bioinformatikai online tanfolyamok stb. A BMKCloud számos gyakran használt bioinformatikai eszközzel rendelkezik, beleértve a génannotációt, evolúciós genetikai eszközöket, ncRNS-t, adatminőség-ellenőrzést, összeállítást, igazítást, adatkinyerést, mutációkat, statisztikákat, ábragenerátort, szekvencia elemzés, stb.
-
A baktériumok teljes genomja
A Biomarker Technologies szekvenálási szolgáltatást nyújt a baktériumok teljes genomjának felépítéséhez nulla résekkel.A baktériumok teljes genomépítésének fő munkafolyamata magában foglalja a harmadik generációs szekvenálást, összeállítást, funkcionális annotációt és fejlett bioinformatikai elemzést, amelyek megfelelnek a meghatározott kutatási céloknak.A baktériumok genomjának átfogóbb profilalkotása lehetővé teszi a biológiai folyamataik mögött meghúzódó alapvető mechanizmusok feltárását, amelyek szintén értékes referenciaként szolgálhatnak a magasabb rendű eukarióta fajok genomikai kutatásaihoz.
Felület:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq platform
PacBio folytatása II
-
kis RNS
A kis RNS-ek rövid, nem kódoló RNS-ek, átlagosan 18-30 nt hosszúságúak, beleértve a miRNS-t, az siRNS-t és a piRNS-t.Ezekről a kis RNS-ekről számoltak be arról, hogy tömegesen részt vesznek különböző biológiai folyamatokban, mint például az mRNS lebontásában, a transzláció gátlásában, a heterokromatin képződésében stb. A kis RNS szekvenálási analízist széles körben alkalmazták állati/növényi fejlődéssel, betegséggel, vírussal stb. kapcsolatos vizsgálatokban. Kis RNS A szekvenálás-elemző platform standard elemzésből és fejlett adatbányászatból áll.Az RNS-seq adatok alapján standard elemzéssel miRNS azonosítás és előrejelzés, miRNS célgén előrejelzés, annotáció és expressziós elemzés érhető el.A fejlett elemzés lehetővé teszi a személyre szabott miRNS-keresést és -kinyerést, a Venn-diagram generálását, a miRNS- és a célgénhálózat kiépítését.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Az NGS-WGS egy teljes genom újraszekvenálási elemző platform, amelyet a Biomarker Technologies terén szerzett gazdag tapasztalatok alapján fejlesztettek ki.Ez az egyszerűen használható platform lehetővé teszi az integrált elemzési munkafolyamat gyors benyújtását néhány alapvető paraméter beállításával, amelyek illeszkednek az Illumina platformról és a BGI szekvenáló platformról generált DNS-szekvenálási adatokhoz.Ezt a platformot nagy teljesítményű számítástechnikai szerveren telepítik, amely rendkívül hatékony adatelemzést tesz lehetővé nagyon korlátozott időn belül.A személyre szabott adatbányászat standard elemzés alapján érhető el, beleértve a mutált gén lekérdezést, a PCR primer tervezést stb.
-
mRNS (referencia)
A transzkriptom a kapcsolat a genomi genetikai információ és a biológiai funkció proteomja között.A transzkripciós szintű szabályozás az élőlények legfontosabb és legszélesebb körben vizsgált szabályozási módja.A transzkriptom szekvenálás bármely időpontban vagy bármilyen körülmények között meg tudja szekvenálni a transzkriptumot egyetlen nukleotid pontos felbontással. Dinamikusan tükrözheti a géntranszkripció szintjét, egyidejűleg azonosíthatja és mennyiségileg meghatározhatja a ritka és normál transzkriptumokat, és szerkezeti információkat szolgáltathat minta konkrét átirat.
Jelenleg a transzkriptom szekvenálási technológiát széles körben alkalmazzák az agronómiában, az orvostudományban és más kutatási területeken, beleértve az állatok és növények fejlődésének szabályozását, a környezeti alkalmazkodást, az immunkölcsönhatást, a gén lokalizációját, a fajok genetikai evolúcióját, valamint a daganatok és genetikai betegségek kimutatását.
-
Metagenomika (NGS)
Ezt az elemző platformot több éves tapasztalat alapján sörétes metagenomikai adatok elemzésére tervezték.Integrált munkafolyamatból áll, amely különféle általánosan szükséges metagenomikai elemzéseket tartalmaz, beleértve az adatfeldolgozást, a fajszintű vizsgálatokat, a génfunkció-szintű vizsgálatokat, a metagenom binninget stb. Ezen kívül testreszabott adatbányászati eszközök állnak rendelkezésre standard elemzési munkafolyamat során, beleértve a gén- és fajlekérdezést is. , paraméter beállítás, személyre szabott ábra generálás stb.
-
LncRNS
A hosszú, nem kódoló RNS-ek (lncRNS) olyan transzkriptumok, amelyek hossza meghaladja a 200 nt-t, és nem képesek fehérjéket kódolni.A felhalmozott bizonyítékok arra utalnak, hogy a legtöbb lncRNS nagy valószínűséggel működőképes.A nagy áteresztőképességű szekvenálási technológiák és a bioinformatikai elemző eszközök lehetővé teszik számunkra, hogy hatékonyabban tárjuk fel az lncRNS-szekvenciákat és pozícionáló információkat, és elvezetnek bennünket a kulcsfontosságú szabályozó funkciókkal rendelkező lncRNS-ek felfedezéséhez.A BMKCloud büszke arra, hogy ügyfeleink számára lncRNS szekvenálási elemző platformot biztosít a gyors, megbízható és rugalmas lncRNS elemzés eléréséhez.
-
GWAS
A genomszintű asszociációs vizsgálat (GWAS) célja olyan genetikai változatok (genotípus) azonosítása, amelyek specifikus tulajdonságokhoz (fenotípushoz) kapcsolódnak.A GWA vizsgálatok azt vizsgálják, hogy a genetikai markerek nagyszámú egyed teljes genomjában kereszteződnek, és populációs szintű statisztikai elemzéssel előrejelzik a genotípus-fenotípus asszociációkat.A teljes genom újraszekvenálása potenciálisan minden genetikai változatot felfedezhet.A fenotípusos adatokkal összekapcsolva a GWAS feldolgozható a fenotípushoz kapcsolódó SNP-k, QTL-ek és jelölt gének azonosítására, ami erősen támogatja a modern állat-/növénynemesítést.Az SLAF egy saját fejlesztésű egyszerűsített genomszekvenálási stratégia, amely genom-szerte elosztott markereket, SNP-t fedez fel.Ezek az SNP-k, mint molekuláris genetikai markerek, feldolgozhatók a célzott tulajdonságokkal rendelkező asszociációs vizsgálatokhoz.Költséghatékony stratégia az összetett tulajdonságokhoz kapcsolódó genetikai variációk azonosítására.
-
Nanopore Teljes hosszúságú transzkriptomika
Az organizmusok komplex és variábilis alternatív izoformái fontos genetikai mechanizmusok a génexpresszió és a fehérjediverzitás szabályozásában.A transzkriptum struktúrák pontos azonosítása az alapja a génexpressziós szabályozási minták mélyreható tanulmányozásának.A Nanopore szekvenáló platform sikeresen hozta a transzkriptomikus vizsgálatot izoforma-szintre.Ez az elemző platform a Nanopore platformon generált RNS-Seq adatok elemzésére szolgál referencia genom alapján, amely minőségi és kvantitatív elemzéseket tesz lehetővé génszinten és transzkriptum szinten egyaránt.
-
cirk-RNS
A cirkuláris RNS (circRNS) a nem kódoló RNS egy fajtája, amelyről a közelmúltban megállapították, hogy létfontosságú szerepet játszanak a fejlődésben, a környezeti ellenállásban stb. részt vevő szabályozó hálózatokban. Különbözik a lineáris RNS-molekuláktól, pl. A cirRNS végei összekapcsolódnak, és körkörös szerkezetet alkotnak, ami megóvja őket az exonukleáz emésztésétől, és stabilabb, mint a legtöbb lineáris RNS.A CircRNS-ről azt találták, hogy sokféle funkcióval rendelkezik a génexpresszió szabályozásában.A CircRNS ceRNS-ként működhet, amely kompetitíven köti a miRNS-t, amelyet miRNS-szivacsként ismernek.A CircRNA szekvenáló elemző platform lehetővé teszi a cirRNS szerkezet- és expressziós elemzését, a célpont előrejelzését és más típusú RNS-molekulákkal való együttes elemzést
