-
Nanopore Doly uzynlykdaky transkriptomika
Organizmlerdäki çylşyrymly we üýtgeýän alternatiw izoformlar gen aňlatmasyny we beloklaryň dürlüligini kadalaşdyrmak üçin möhüm genetiki mehanizmlerdir.Transkripsiýa gurluşlaryny takyk kesgitlemek geni aňlatmagyň kadalaşdyryş usullaryny çuňňur öwrenmek üçin esas bolup durýar.Nanopore yzygiderlilik platformasy transkriptomiki gözlegleri izoform derejesine üstünlikli getirdi.Bu seljeriş platformasy, Nanopore platformasynda döredilen gen-geniň esasynda hil we mukdar taýdan analizlere ýetýän RNA-Seq maglumatlary analiz etmek üçin döredildi.
-
Ewolýusiýa genetikasy
Ilat we ewolýusiýa genetiki derňew platformasy BMK R&D toparynyň içinde ençeme ýyllap toplanan uly tejribe esasynda döredilýär.Esasanam bioinformatika bilen meşgullanmaýan gözlegçiler üçin ulanyjy üçin amatly gural.Bu platforma, filogenetiki agaçlaryň gurluşygy, baglanyşyk deňagramlylygy seljermek, genetiki dürlüligi bahalandyrmak, saýlama süpüriş derňewi, garyndaşlyk derňewi, PCA, ilatyň gurluşynyň derňewi we ş.m. ýaly esasy ewolýusiýa genetikasy bilen baglanyşykly esasy derňewi üpjün edýär.
-
tegelek RNA
Tegelek RNK (circRNA), kodlanmadyk RNK görnüşidir, ýaňy-ýakynda ösmekde, daşky gurşawa garşy durmakda we ş.m. gatnaşýan kadalaşdyryjy ulgamlarda möhüm rol oýnaýan RNK, çyzykly RNK molekulalaryndan tapawutly, mysal üçin mRNA, lncRNA, 3 ′ we 5 ′ circRNA-nyň uçlary birleşip, ekzonukleýiň siňdirilmeginden halas edýän we çyzykly RNK-leriň köpüsinden has durnukly tegelek gurluş emele getirýär.CircRNA-nyň gen aňlatmasyny kadalaşdyrmakda dürli funksiýalarynyň bardygy anyklandy.CircRNA, miRNA gubka diýlip atlandyrylýan miRNA-ny bäsdeşlik taýdan baglanyşdyrýan ceRNA hökmünde ýerine ýetirip biler.“CircRNA” yzygiderli derňew platformasy, “circRNA” gurluşyny we aňlatma derňewini, maksatly çaklamany we beýleki RNK molekulalary bilen bilelikdäki derňewi güýçlendirýär.
-
BSA
“Bulked Segregant Analysis” platformasy bir basgançakly standart derňewden we ýöriteleşdirilen parametr sazlamasy bilen ösen derňewden ybarat.BSA fenotip bilen baglanyşykly genetiki bellikleri çalt kesgitlemek üçin ulanylýan usul.BSA-nyň esasy iş prosesi şulary öz içine alýar: 1. aşa garşydaş fenotipleri bolan iki topar topary saýlamak;2. DNK, RNA ýa-da SLAF-seq (Biomarker tarapyndan işlenip düzülen) iki adamyň DNK-syny emele getirmek;3. salgylanma genomyna ýa-da arasynda diferensial yzygiderliligi kesgitlemek, 4. ED we SNP-indeks algoritmi bilen dalaşgärleriň baglanyşdyrylan sebitlerini çaklamak;5. Dalaşgär sebitlerdäki genleri funksional seljermek we baýlaşdyrmak we ş.m. Genetiki markeriň barlagy we deslapky dizaýny ýaly maglumatlary has ösen gazyp almak hem bar.
-
Amplikon (16S / 18S / ITS)
Amplicon (16S / 18S / ITS) platformasy, mikroblaryň dürlüligi taslamasynyň derňewinde köp ýyllyk tejribe toplap, standartlaşdyrylan esasy derňewi we şahsylaşdyrylan derňewi öz içine alýar: esasy derňew häzirki mikrob gözlegleriniň esasy derňew mazmunyny öz içine alýar, derňew mazmuny baý we giňişleýin, we derňew netijeleri taslama hasabatlary görnüşinde berilýär;Şahsylaşdyrylan derňewiň mazmuny dürli-dürli.Nusgalar saýlanyp bilner we şahsylaşdyrylan talaplary durmuşa geçirmek üçin esasy derňew hasabatyna we gözleg maksadyna görä parametrler çeýe düzülip bilner.Windows operasiýa ulgamy, ýönekeý we çalt.
-
Proteomika
Proteomika, öýjügiň, dokumanyň ýa-da organizmiň düzümindäki umumy beloklaryň mukdaryny kesgitlemek üçin tehnologiýalaryň ulanylmagyny öz içine alýar.Proteomika esasly tehnologiýalar dürli anyklaýyş bellikleri, sanjym önümçiligine dalaşgärler, patogen mehanizmlerine düşünmek, dürli signallara jogap hökmünde aňlatma nagyşlaryny üýtgetmek we dürli kesellerde işleýän belok ýollaryny düşündirmek ýaly dürli gözleg sazlamalarynda dürli mümkinçiliklerde ulanylýar.Häzirki wagtda mukdar proteomika tehnologiýalary esasan TMT, Label Free we DIA mukdar strategiýalaryna bölünýär.
-
Metabolomika
Metaboloma genomyň aşaky akymydyr we öýjükde, dokumada ýa-da organizmde pes molekulaly molekulalaryň (metabolitleriň) umumy goşundysyndan durýar.Metabolomika, fiziologiki gyjyndyrma ýa-da kesel ýagdaýlarynda ownuk molekulalaryň giňligini ölçemegi maksat edinýär.Metabolomika usulyýetleri iki aýratyn topara bölünýär: nyşana alynmadyk metabolomika, GC-MS / LC-MS ulanyp himiki näbelli zatlary öz içine alýan bir nusgadaky ähli ölçenip boljak analitikleriň maksatly giňişleýin derňewi we maksatly metabolomika, himiki taýdan häsiýetlendirilen toparlaryň ölçegi we biohimiki taýdan düşündirişli metabolitler.
-
Ösümlik / Haýwan De novo Genom yzygiderliligi
De nowoyzygiderlilik, genomyň ýoklugynda PacBio, Nanopore, NGS we ş.m. yzygiderlilik tehnologiýalaryny ulanyp, bir görnüşiň tutuş genomynyň gurluşygyny aňladýar.Üçünji nesil yzygiderlilik tehnologiýalarynyň okalýan uzynlygyndaky ep-esli gowulaşma, ýokary heterozigozitli, gaýtalanýan sebitleriň ýokary gatnaşygy, poliploidler we ş.m. ýaly çylşyrymly genomlary ýygnamakda täze mümkinçilikler döretdi, onlarça kilobaza derejesinde okalýan uzynlyk bilen bu yzygiderlilik okamaga mümkinçilik berýär. gaýtalanýan elementleri, adaty bolmadyk GC mazmuny bolan sebitleri we beýleki çylşyrymly sebitleri çözmek.
Platforma ： PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Salam-C esasly Genom Assambleýasy
“Hi-C”, ýakynlyga esaslanýan täsirleri we ýokary geçiş yzygiderliligini barlamak arkaly hromosoma konfigurasiýasyny almak üçin döredilen usul.Bu özara täsirleriň intensiwligi, hromosomlardaky fiziki aralyk bilen negatiw baglanyşykda hasaplanýar.Şol sebäpden, “Hi-C” maglumatlary ýygnalan yzygiderliligiň genomyň üstünde jemlenmegine, tertipleşdirilmegine we belli bir mukdarda hromosomlara dakylmagyna ýol görkezip biler.Bu tehnologiýa, ilata esaslanýan genetiki kartanyň ýoklugynda hromosoma derejesindäki gen ýygnamak mümkinçiligini berýär.Her bir genomda “Hi-C” gerek.
Platforma ： Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Ewolýusiýa genetikasy
Ewolýusiýa genetikasy, SNP, InDels, SVs we CNV-ler ýaly genetiki üýtgeşmelere esaslanýan berlen materiallaryň ewolýusiýa maglumatlary barada giňişleýin düşündiriş bermek üçin niýetlenen gaplanan yzygiderli hyzmatdyr.Ilatyň gurluşy, genetiki dürlüligi, filogeniýa gatnaşyklary we ş.m. ýaly ewolýusiýa üýtgeşmelerini we ilatyň genetiki aýratynlyklaryny beýan etmek üçin zerur bolan ähli düýpli derňewleri üpjün edýär.
