كىچىك RNA تەرتىپى-ئىللۇمىنا
مۇلازىمەت ئەۋزەللىكى
Ø5 نىڭ ئاخىرىدىكى بىرىنچى ئاساسى U نىڭ ئالاھىدە RNA لارغا ئېرىشىشىگە كۈچلۈك ئامراق
ØmiRNA نىشان گېن مۆلچەرى
Øبۇ سانلىق مەلۇمات mRNA بىلەن ئورتاق تەھلىل قىلىشقا ئىشلىتىلىدۇ
ØmiRNA پەرقلىق ئىپادىلەش
ØmiRNA نىشان گېن مۆلچەرى
ØBMKCloud نى ئاساس قىلغان نەتىجىنى يەتكۈزۈش: سۇپادا خاسلاشتۇرۇلغان سانلىق مەلۇمات قېزىش.
Øسېتىلغاندىن كېيىنكى مۇلازىمەت تۈر تاماملانغاندىن كېيىن 3 ئاي كۈچكە ئىگە
ئۈلگە تەلەپ ۋە يەتكۈزۈش
ئەۋرىشكە تەلەپلىرى:
Nucleotides:
| ساپلىق | سەمىمىيەت | بۇلغىنىش | سومما |
| OD260 / 280≥1.7-2.5 ； OD260 / 230≥0.5-2.5 ； | ئۆسۈملۈكلەر ئۈچۈن: RIN≥6.5;ھايۋانلار ئۈچۈن: RIN≥7;28S / 18S≥1.0;ئاساسىي ئېگىزلىكى چەكلىك ياكى يوق | گېلىدا كۆرسىتىلگەن ئاقسىل ياكى DNA نىڭ بۇلغىنىشى چەكلىك ياكى يوق. | Conc.≥300 ng / μl;توم ≥ 10 μl;ئومۇمىي ≥ 3 μg |
توقۇلما: ئېغىرلىقى (قۇرۇق): ≥1 g
* 5 مىللىگىرامدىن كىچىك توقۇلمىلارغا چاقماق توڭلىتىلغان (سۇيۇق ئازوتتا) توقۇلما ئەۋرىشكىسىنى ئەۋەتىشنى تەۋسىيە قىلىمىز.
كاتەكچە ئاسما: ھۈجەيرە سانى = 3 × 107
* توڭلىتىلغان ھۈجەيرە لەيلىسىنى ئەۋەتىشنى تەۋسىيە قىلىمىز.بۇ كاتەكچىنىڭ سانى 5 × 10 دىن كىچىك بولسا5، سۇيۇق ئازوتتا توڭلىتىلغان چاقماق لامپىسى تەۋسىيە قىلىنىدۇ.
قان ئەۋرىشكىسى:
PA × geneBloodRNATube;
6mLTRIzol ۋە 2mL قان (TRIzol: قان = 3: 1)
تەۋسىيە قىلىنغان ئەۋرىشكە يەتكۈزۈش
كونتېينېر:
2 مىللىلېتىر سېنترىفۇگ تۇرۇبىسى (قەلەي ياپقۇچ تەۋسىيە قىلىنمايدۇ)
ئۈلگە بەلگە: گۇرۇپپا + كۆپەيتىش مەسىلەن A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
مال ئەۋەتىش:
1. قۇرغاق مۇز: ئەۋرىشكەلەرنى خالتىغا قاچىلاش ۋە قۇرۇق مۇزغا كۆتۈرۈش كېرەك.
2. RNA تۇراقلىق تۇرۇبا: RNA ئەۋرىشكىسىنى RNA تۇراقلاشتۇرۇش تۇرۇبىسىدا قۇرۇتقىلى بولىدۇ (مەسىلەن RNAstable®) ھەمدە ئۆي تېمپېراتۇرىسىدا توشۇشقا بولىدۇ.
مۇلازىمەت خىزمىتى ئېقىمى
تەجرىبە لايىھىسى
ئۈلگە يەتكۈزۈش
RNA ئېلىش
كۈتۈپخانا قۇرۇلۇشى
تەرتىپلەش
سانلىق مەلۇمات ئانالىزى
سېتىشتىن كېيىنكى مۇلازىمەتلەر
Bioinformatics
 |
1.miRNA پەرقلەندۈرۈش
MiRDeep2 ئالدىن پەرەز قىلغان رومان miRNAs نىڭ ھەر بىر كاندىداتنىڭ ئالدىنئالا قۇرۇلمىسى ۋە تەرتىپ چوڭقۇرلۇقىنى كۆرسىتىپ بېرىدىغان pdf رەسىمى بار.
miRNA ئالدى قۇرۇلما ۋە تەرتىپ چوڭقۇرلۇقى
2.KEGG DE-miRNA نىشانلىق گېننى بېيىتىش
بۇ يىغىندا ، Biomarker ئالدى بىلەن DE-miRNA نىشانلىق گېن بىلەن يوللارنىڭ ھەددىدىن زىيادە تونۇش ياكى ئەمەسلىكىنى تەكشۈردى.يولنىڭ بېيىش دەرىجىسى ۋە ئەھمىيىتىنى بېكىتىشتە بېيىش ئامىللىرى ۋە بېلىقچىلار سىنىقى قوللىنىلدى.تۆۋەندە بېيىش ھېسابلاشنىڭ تەڭلىمىسى كۆرسىتىلدى.
DE-miRNA نىشانلىق گېندىكى KEGG يولىنى بېيىتىش
3. DE-miRNA نىشانلىق گېن ئۈستىدە GO موللاش ئانالىزى
clusterProfiler DE-miRNA نىشانلىق گېن ئۈستىدە GO موللاشتۇرۇش ئانالىزىدا ئىشلىتىلگەن.بۇ ئاتالغۇلارنىڭ قاتلاملىق قۇرۇلمىسىنى كۆرسىتىش ئۈچۈن بېيىغان ئاتالغۇلارنىڭ يۆنىلىشلىك كىسلاتالىق گرافىكى ھاسىل قىلىندى.رەسىمدە ، ئوقنىڭ يۆنىلىشى ئاتالغۇلار ئارىسىدىكى سىغدۇرۇشچان مۇناسىۋەتكە ۋەكىللىك قىلىدۇ ، يەنى تۈگۈنلەر ئۈستۈنكى تۈگۈنلەرگە قارىغاندا تېخىمۇ ئېنىق.DE-miRNA نىشانلىق گېننىڭ يۆنىلىشلىك كىسلاتالىق گرافىكى تۆۋەندىكى رەسىمدە كۆرسىتىلدى.
TopGO DE-miRNA نىشانلىق گېننىڭ كىسلاتالىق گرافىكنى يېتەكلىدى
BMK دېلوسى
گۆش سۈپىتى بىلەن مۇناسىۋەتلىك MiRNA ۋە گېنلارنىڭ ئۇنىۋېرسال ئانالىزى Gga-MiR-140-5p نىڭ توخۇلاردىكى مۇسكۇلنىڭ ياغ قويۇشىغا تەسىر قىلىدىغانلىقىنى ئاشكارىلىدى.
ئېلان قىلىنغان:ھۈجەيرە فىزىئولوگىيىسى ۋە بىئوخېمىيە ，2018
ئاچقۇچلۇق نەتىجىلەر
ئاخىرقى مەزگىلدىكى توخۇلار قۇرامىغا يەتمىگەن توخۇلارغا قارىغاندا miRNAs نىڭ دۇنيا مىقياسىدا ئىپادىلىنىش سەۋىيىسىنى تۆۋەنلەتتى.
گۆش سۈپىتىگە تەسىر كۆرسىتىدىغان mirNA-mrna نىڭ تەڭشەش تورى قۇرۇلدى
gga-miR-140-5p RXRG نى تەڭشەش ئارقىلىق adipocyte پەرقلەندۈرۈشنى ئىلگىرى سۈرىدۇ.
 gga-miR-140-5p RXRG نىڭ 3'UTR نى نىشانلاپ توخۇنىڭ مۇسكۇل مۇسكۇلى ئالدى پەردىسىنى پەرقلەندۈرۈشنى ئىلگىرى سۈرىدۇ. |
پايدىلانما
جاڭ م ، لى DH ، لى F قاتارلىقلار.گۆش سۈپىتى بىلەن مۇناسىۋەتلىك MiRNA ۋە گېنلارنىڭ ئۇنىۋېرسال ئانالىزى Gga-MiR-140-5p نىڭ توخۇلاردىكى مۇسكۇل مۇسكۇلىنىڭ قويۇقلۇقىغا تەسىر قىلىدىغانلىقىنى ئاشكارىلىدى.ھۈجەيرە فىزىئولوگىيىسى ۋە بىئوخېمىيە ، 2018: 2421-2433.DOI ： 10.1159 / 000489649
