Tuta genoma bisulfila sekvenco (WGBS)
Tuta genoma bisulfita sekvenco (WGBS) staras kiel la ora norma metodaro por profunda esplorado de DNA-metilado, specife la kvina pozicio en citosino (5-MC), pivota regulilo de gena esprimo kaj ĉela aktiveco. La principo sub la WGBS implikas bisulfitan traktadon, induktante la konvertiĝon de nemetilataj citosinoj al uracilo (C al U), lasante senŝanĝajn citosinojn. Ĉi tiu tekniko ofertas unu-bazan rezolucion, permesante al esploristoj komprene esplori la metilomon kaj malkovri eksternormajn metiladajn ŝablonojn asociitajn kun diversaj kondiĉoj, precipe kancero. Per uzado de WGBS, sciencistoj povas akiri neegalajn komprenojn pri genom-larĝaj metilaj pejzaĝoj, havigante nuancan komprenon pri la epigenetikaj mekanismoj, kiuj baziĝas sur diversaj biologiaj procezoj kaj malsanoj.
Servaj Trajtoj
● Postulas referencan genomon.
● Lambda DNA estas aldonita por monitori bisulfitan konvertan efikecon.
● Sekvenco pri Illumina Novaseq.
Servaj avantaĝoj
●Ora normo por esplorado pri DNA: Ĉi tiu matura metilation -konverta prilaborado -teknologio havas altan precizecon kaj bonan reprodukteblecon.
●Larĝa priraportado kaj unu-baza rezolucio:Detekto de metilaj lokoj ĉe la genoma larĝa nivelo.
●Kompleta platformo:Provizu unufojan bonegan servon de specimeno-prilaborado, biblioteka konstruado, sekvenco al bioinformatika analizo.
●Vasta kompetenteco: Kun WGBS-sekvencaj projektoj sukcese kompletigitaj tra diversa gamo da specioj, BMKGENE alportas pli ol jardekon da sperto, tre lerta analiza teamo, ampleksa enhavo kaj bonega post-venda subteno.
●Ebleco kuniĝi kun transcriptomika analizo: Permesante la integran analizon de WGB-oj kun aliaj OMICS-datumoj kiel RNA-seq.
Specimaj Specifoj
| Biblioteko | Sekvenca Strategio | Rekomendita datuma eligo | Kvalitkontrolo |
| Bisulfito traktita | Illumina PE150 | 30x profundo | Q30 ≥ 85% Bisulfita Konvertiĝo> 99% |
Specimaj postuloj
| Koncentriĝo (ng/µL) | Tuta kvanto (µg) | Pliaj postuloj | |
| Genomika DNA | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Limigita degenero aŭ poluado |
Serva laborfluo
Ekzempla liverado
Eltiro de DNA
Biblioteko -Konstruado
Sekvenco
Datuma Analizo
Liverado de datumoj
Inkluzivas la jenan analizon:
● kruda sekvenca kvalito -kontrolo;
● Mapado al referenca genomo;
● Detekto de 5MC -metilataj bazoj;
● Analizo de metilado -distribuo kaj komentario;
● Analizo de malsame metilataj regionoj (DMRoj);
● Funkcia komentario de genoj asociitaj al DMR -oj.
5MC -metilado -detekto: specoj de metilataj retejoj
METILA MAPO. 5MC Metila Genoma-Larĝa Distribuo
Komentario de tre metilataj regionoj
Malsamaj metilataj regionoj: asociitaj genoj
Malsamaj metilataj regionoj: komentario de asociitaj genoj (gena ontologio)
Esploru la esploradajn progresojn faciligitajn de la tuta genoma bisulfita sekvencado de BMKGENE per prizorgita kolekto de publikaĵoj.
Fan, Y. et al. (2020) 'Analizo de DNA-metilaj profiloj dum ŝaf-skeleta muskola disvolviĝo uzante tut-genoman bisulfitan sekvencon',BMC -Genomiko, 21 (1), pp 1-15. doi: 10.1186/s12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'Romano Deoxiribonuklea acida metilado perturboj en laboristoj elmontritaj al vinilklorido',Toksikologio kaj Industria Sano, 38 (7), pp 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'Rilatoj inter genoma metilado, niveloj de ne-kodantaj RNAoj, mRNAoj kaj metabolitoj en maturiĝanta tomata frukto',La Planta Revuo, 103 (3), pp 980–994. doi: 10.1111/tpj.14778.
