BMKMANU S1000 Spaca Transcriptome
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome Technical Scheme
Avantaĝoj de BMKMANU S1000
1) Subĉela rezolucio: Ĉiu kapta areo enhavis >2 milionojn da spacaj Barkoditaj Makuloj kun diametro de 2.5 µm kaj interspacigo de 5 µm inter punktocentroj, ebligante spacan transcriptoman analizon kun subĉela rezolucio (5 µm).
2) Plurnivela rezolucia analizo: Fleksebla multnivela analizo de 100 μm ĝis 5 μm por solvi diversajn histajn funkciojn ĉe optimuma rezolucio.
3) Ampleksa transcriptome-profilado: Transskribaĵoj kaptitaj de la tuta histoglitado povas esti analizitaj, sen limigo pri nombro da celgenoj kaj cela areo.
Specifoj de Servo
| Biblioteko | Sekvenca strategio | Datuma Eligo rekomendita |
| S1000 cDNA-biblioteko | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Gb/specimeno |
Specimenaj Postuloj
| Specimeno | Numero | Grandeco | RNA-Kvalito |
| OCT enigita histobloko | 2-3 blokoj/ specimeno | Proks.6,8x6,8x6,8 mm3 | RIN≥7 |
Por pliaj detaloj pri specimena prepargvido kaj serva laborfluo, bonvolu paroli kun aBMKGENE fakulo
Serva Laborfluo
Eksperimenta dezajno
Specimena livero
Antaŭeksperimento
Spaca strekkodigo
Bibliotekokonstruo
Sekvencado
Analizo de datumoj
Post-vendaj servoj
La datumoj generitaj de BMKMANU S1000 estas analizitaj per la programaro "BSTMatrix", kiu estas sendepende desegnita de BMKGENE, inkluzive:
1) Gena esprimo matrica generacio
2) HE-bildtraktado
3) Kongrua kun laŭflua triaparta programaro por analizo
4) Enreta "BSTViewer" helpas akiri bildigajn rezultojn je malsamaj rezolucioj.
1.Spot clustering
2.Spaca distribuo
Note: Rezolucionivelo=13 (100 µm, maldekstre); 7 (50 µm, ĝuste)
3.Marker esprimo abundo clustering varmomapo
4.Inter-prova analizo de datumoj
