Reduktita Reprezenta Bisulfita Sekvencado (RRBS)
Specifoj de Servo
Platformo: NovaSeq-platformo, PE150
Biblioteko-tipo: 200-400bp enmeta bisulfite traktita DNA-biblioteko
Sekvenca strategio: Parigita-Fino 150 bp
Rekomendita datuma eligo: 10 Gb krudaj datumoj/specimeno
Ekzemplaj Postuloj
DNA-kvanto: ≥ 2ug
DNA-koncentriĝo: ≥ 20ng/μl.
Pureco: OD260/280 = 1,8 ĝis 2,0 sen degenero aŭ RNA-poluado
Bioinformatika analizo
Serva Laborfluo
Specimena livero
Bibliotekokonstruo
Sekvencado
Analizo de datumoj
Post-vendaj servoj
a.Referenca genara viciga statistiko
Statistiko de mapado legas
Statikoj de sekvenca profundo kaj priraportado de C-ejo
Aamasigita kovrado
Dengesta efikeco de ĉiu specimeno
b.Detekto de metila ejo
Listo de metiligniveloj en C-ejo
BS konvertiĝo
Metiligita citozino
Distribuo de nivelo de metilo
c.Mapo de metilo
Genome-tute
Genoma elemento
d.Komparo de metiligniveloj inter provaĵoj
Paera Korelacio de CG-metiligo
PCA-CG-metiligo
Cbrilado de CG-metiligo
d.Diference metila analizo
Sstatistiko de DMR
DMR-longa distribuo
Hmanĝu mapon
DMR-distribuo en celata regiono
