-
Genaro-kovranta Asocia Analizo
Genaro-kovranta asocio-studo (GWAS) celas identigi genetikajn variaĵojn (genotipo) kiuj asociis kun specifaj trajtoj (fenotipo).GWAS-studo esploras genetikajn signojn transiras tutan genaron de granda nombro da individuoj kaj antaŭdiras gentip-fenotipajn asociojn per statistika analizo sur populacionivelo.Ĝi estis vaste aplikita en esplorado pri homaj malsanoj kaj funkcia gena minado pri kompleksaj trajtoj de bestoj aŭ plantoj.
-
Ununuklea RNA-sekvencado
La antaŭeniĝo en unuĉela kaptado kaj individua biblioteka konstrutekniko kombinanta kun alt-trafia sekvencado permesas genekspresion studojn sur ĉel-post-ĉela bazo.Ĝi ebligas pli profundan kaj kompletan sisteman analizon pri kompleksaj ĉelpopulacioj, en kiuj ĝi plejparte evitas maskadon de ilia heterogeneco per mezumo de ĉiuj ĉeloj.
Tamen, iuj ĉeloj ne taŭgas por esti transformitaj en unuĉelan suspendon, do aliaj specimenaj preparmetodoj - kernekstraktado estas necesa el histoj, tio estas, nukleo estas rekte ĉerpita el histoj aŭ ĉelo kaj preparita en unukernsuspendo por unu-kerno. ĉelsekvenco.
BMK disponigas 10× Genomics ChromiumTM bazitan unuĉelan RNA-sekvencan servon.Ĉi tiu servo estis vaste uzata en studoj pri malsano rilataj studoj, kiel imunĉela diferencigo, tumora heterogeneco, histo-disvolviĝo ktp.
Spaca transkriptompeceto: 10× Genomics
Platformo: Platformo Illumina NovaSeq
-
Planto/Besto Tuta Genaro Sekvencado
Tuta genar-resekvencado, ankaŭ konata kiel WGS, ebligas la riveladon de kaj oftaj kaj maloftaj mutacioj sur la tuta genaro inkluzive de Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure-vario (SV), kaj Copy Number Variation (CNV). ).SVoj konsistigas pli grandan parton de la variadbazo ol SNPoj kaj havas pli grandan efikon al la genaro, kiu havas signifan efikon al vivantaj organismoj.Long-lega resekvencado enkalkulas pli precizan identigon de grandaj fragmentoj kaj komplikajn variojn ĉar longaj legadoj faras multe pli facila al kromosoma krucado super komplikaj regionoj kiel tandemripetoj, GC/AT-riĉaj regionoj, kaj hiper-variaj regionoj.
Platformo: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spaca Transcriptome
Spaca organizo de ĉeloj ludas esencan rolon en diversaj biologiaj procezoj, kiel ekzemple imuninfiltrado, embriodisvolviĝo, ktp. Spaca transcriptome-sekvencado, kiu indikas genesprimprofiladon retenante informojn de spaca pozicio, disponigis grandajn sciojn pri transcriptome-nivela histo-arkitekturo.Kun la evoluo de teknologio, la ultra-klara histomorfologio kaj la reala struktura diferenco de spaca molekula esprimo devas esti studitaj kun pli alta rezolucio.BMKGENE disponigas ampleksan, unu-haltan spacan transkriptoman sekvencan servon de provaĵoj ĝis biologiaj komprenoj.
Spacaj transcriptomics teknologioj rajtigis novajn perspektivojn en diversa esplorareno solvante genesprimprofilon kun spaca enhavo en heterogenaj provaĵoj.
Spaca transcriptomeblato: BMKMANU S1000
Platformo: Platformo Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Visium Spatial Gene Expression estas ĉefa spaca transcriptome-sekvenca teknologio por klasifikado de histo bazita sur totala mRNA.Mapu la tutan transcriptomon kun morfologia kunteksto por malkovri novajn sciojn pri normala evoluo, malsanpatologio kaj klinika traduka esplorado.BMKGENE disponigas ampleksan, unu-haltan spacan transkriptoman sekvencan servon de provaĵoj ĝis biologiaj komprenoj.
Spacaj transkriptomicaj teknologioj rajtigis novajn perspektivojn en diversa esplora areno solvante genesprimprofilon kun spaca enhavo en heterogenaj provaĵoj..
Spaca transcriptomeblato: 10x Genomics Visium
Platformo:Platformo Illumina NovaSeq
-
Plenlonga mRNA Sequencing-Nanopore
RNA-sekvencado estis valorega ilo por ampleksa transkriptomanalizo.Sendube, tradicia mallonglega sekvencado atingis multnombran gravan evoluon ĉi tie.Tamen, ĝi ofte renkontas limigojn en plenlongaj izoformaj identigoj, kvantigado, PCR-biaso.
Nanoporsekvencado distingas sin de aliaj sekvencaj platformoj, en tio ke la nukleotidoj estas legitaj rekte sen DNA-sintezo kaj generas longan legadon je dekoj de kilobazoj.Ĉi tio ebligas rektan legadon kruci plenlongajn transskribaĵojn kaj trakti la defiojn en izoform-nivelaj studoj.
Platformo：Nanopore PromethION
Biblioteko:cDNA-PCR
-
Plenlonga mRNA-sekvencado -PacBio
De novoplenlonga transkriptomsekvencado, ankaŭ konata kielDe novoIso-Seq prenas la avantaĝojn de PacBio-sekvencilo en legolongo, kiu ebligas sekvencadon de plenlongaj cDNA-molekuloj sen iuj paŭzoj.Ĉi tio tute evitas iujn ajn erarojn generitajn en transskribaj asembleaj paŝoj kaj konstruas unigenajn arojn kun izoform-nivela rezolucio.Ĉi tiuj unigenaj aroj disponigas potencajn genetikajn informojn kiel "referenca genaro" ĉe transcriptom-nivelo.Krome, kombinante kun venontgeneraciaj sekvencaj datumoj, ĉi tiu servo rajtigas precizan kvantigon de izoform-nivela esprimo.
Platformo: PacBio Sequel IIBiblioteko: SMRT sonorilbiblioteko -
Eŭkariota mRNA Sequencing-Illumina
mRNA-sekvencado ebligas profiladon de ĉiuj mRNA-oj transskribitaj de ĉeloj sub specifaj kondiĉoj.Ĝi estas potenca teknologio por malkaŝi gen-esprimprofilon, genstrukturojn kaj molekulajn mekanismojn de certaj biologiaj procesoj.Ĝis nun, mRNA-sekvencado estis vaste utiligita en fundamenta esplorado, klinika diagnozo, drogevoluo, ktp.
Platformo: Platformo Illumina NovaSeq
-
Ne-Referenco bazita mRNA Sequencing-Illumina
mRNA-sekvencado adoptas venontgeneracian sekvencteknikon (NGS) por kapti la mesaĝan RNA (mRNA) formon Eŭkarioto ĉe specifa periodo kiun kelkaj specialaj funkcioj aktivigas.La plej longa transskribaĵo splisita estis nomita "Unigene" kaj utiligita kiel la referencsekvenco por posta analizo, kio estas efika rimedo por studi la molekulan mekanismon kaj reguligan reton de la specio sen referenco.
Post transcriptome datumoj asembleo kaj unigene funkcia komentario
(1)SSR-analizo, CDS-prognozo kaj genstrukturo estos antaŭformitaj.
(2) Kvantigo de unigena esprimo en ĉiu specimeno estos farita.
(3) Malsame esprimitaj unigenoj inter specimenoj (aŭ grupoj) estos malkovritaj surbaze de unigena esprimo
(4)Clustering, funkcia komentario kaj riĉiga analizo de diferencige esprimitaj unigenoj estos faritaj
-
Longa ne-koda sekvencado-Illumina
Longaj ne-kodaj RNAoj (lncRNAs) estas speco de RNA-molekuloj kun longo superanta 200 nt, kiuj estas karakterizitaj per ekstreme malalta kodpotencialo.LncRNA, kiel ŝlosila membro en ne-kodaj RNAoj, estas plejparte trovita en nukleo kaj plasmo.La evoluo en sekvenca teknologio kaj bioinformtiko ebligas identigon de multaj novaj lncRNAoj kaj asocii tiujn kun biologiaj funkcioj.Akumulaj indicoj indikas ke lncRNA estas vaste implikita en epigenetika reguligo, transskriba reguligo kaj post-transskriba reguligo.
-
Malgranda RNA-sekvencado-Illumina
Malgranda RNA rilatas al klaso de ne-kodaj RNA-molekuloj kiuj estas kutime malpli ol 200nt en longo, inkluzive de mikro-RNA (miRNA), malgranda interfero-RNA (siRNA), kaj piwi-interaganta RNA (piRNA).
MicroRNA (miRNA) estas klaso de endogena malgranda RNA kun longo de proksimume 20-24nt, kiu ludas diversajn gravajn reguligajn rolojn en ĉeloj.miRNA implikita en multaj vivprocezoj kiuj rivelas histon - specifan kaj etapon - specifan esprimon kaj tre konservitan en malsamaj specioj.
-
circRNA-sekvencado-Illumina
CircRNAoj (Cirklaj RNAoj) estas unu klaso de ne-kodigaj RNA-molekuloj kiuj estas manke de 5′ fina ĉapo kaj 3′ fina poli(A) vosto.CircRNAs elfaras cirklan strukturon per la kovalenta ligo kiu estas statuso kontraŭ RNA-eksonukleazdigestado.circRNA ludas gravan rolon en la kresko kaj evoluo de organismoj kaj ilia rezisto al la ekstera medio.
CircRNA havas multajn funkciojn, kiuj povas konkurencive ligi miRNA, peni la reguligan funkcion de ceRNA, por reguligi genekspresion.En la lastaj jaroj, oni ankaŭ trovis, ke ĝi estas proksime rilata al la apero kaj disvolviĝo de malsanoj, kaj havas grandajn aplikajn perspektivojn en la direkto de malsanoj diagnozaj markiloj kaj tiel plu.
