-
Genetika ebolutiboa
Biztanleria eta analisi genetiko ebolutiboaren plataforma urteetan BMK I+G taldean pilatutako esperientzia masiboan oinarrituta ezarri da.Bereziki bioinformatikan adituak ez diren ikertzaileentzako erabilerraza den tresna da.Plataforma honek oinarrizko genetika ebolutiboari lotutako oinarrizko analisia ahalbidetzen du, besteak beste, zuhaitz filogenetikoa eraikitzea, lotura-desoreka aztertzea, aniztasun genetikoa ebaluatzea, ekorketa selektiboa, ahaidetasun azterketa, PCA, populazioaren egituraren azterketa, etab.
-
zirku-RNA
RNA zirkularra (circRNA) kodetzen ez den RNA mota bat da, eta duela gutxi aurkitu da garapenean, ingurumen-erresistentzian eta abarretan parte hartzen duten erregulazio-sareetan ezinbestekoa dena. RNA linealetatik bereizten dira, adibidez, mRNA, lncRNA, 3′ eta 5′. CirRNAren muturrak elkartzen dira egitura zirkular bat sortzeko, eta horrek exonukleasaren digestiotik salbatzen ditu eta RNA lineal gehienak baino egonkorragoak dira.CircRNA geneen adierazpena erregulatzeko hainbat funtzio dituela aurkitu da.CircRNA ceRNA gisa funtziona dezake, miRNA lehiakor lotzen duena, miRNA belaki bezala ezagutzen dena.CircRNA sekuentziazio-analisi plataformak circRNA egitura eta adierazpenaren analisia, helburuen iragarpena eta RNA molekula mota batzuekin batera analisia ahalbidetzen ditu.
-
BSA
Bulked Segregant Analysis plataforma urrats bakarreko analisi estandarrez eta analisi aurreratuaz osatuta dago, parametroen ezarpen pertsonalizatuarekin.BSA fenotipoarekin lotutako markatzaile genetikoak azkar identifikatzeko erabiltzen den teknika da.BSAren lan-fluxu nagusiak honako hauek ditu: 1. Fenotipo oso kontrajarriak dituzten gizabanako bi talde hautatzea;2. Banako guztien DNA, RNA edo SLAF-seq (Biomarker-ek garatua) batuz, DNAren bi zati osatzeko;3. Erreferentziazko genomaren edo tarteko sekuentzia diferentzialak identifikatzea, 4. Lotutako eskualde hautagaien iragarpena ED eta SNP-indize algoritmoaren bidez;5. Eskualde hautagaietako geneen analisi funtzionala eta aberastea, etab. Markatzaile genetikoen baheketa eta primer diseinua barne dauden datuetan meatzaritza aurreratuagoa ere eskuragarri dago.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) plataforma mikrobioen aniztasunaren proiektuen analisian urteetako esperientziarekin garatzen da, oinarrizko analisi estandarizatua eta analisi pertsonalizatua dituena: oinarrizko analisiak egungo mikrobioen ikerketaren analisi nagusiaren edukia hartzen du, analisiaren edukia aberatsa eta integrala da, eta analisien emaitzak proiektuen txosten moduan aurkezten dira;Analisi pertsonalizatuaren edukia askotarikoa da.Laginak hauta daitezke eta parametroak malgutasunez ezarri daitezke oinarrizko analisi-txostenaren eta ikerketa-helburuaren arabera, eskakizun pertsonalizatuak betetzeko.Windows sistema eragilea, sinplea eta azkarra.
