Bakterioen Genoma osoa
Zerbitzu Abantailak
● Sekuentziazio-estrategia anitz eskuragarri ikerketa-helburu desberdinetarako
● Bakterioen genoma osoa 0 Gap bermatuta.
● Bakterioen genomaren muntaketan esperientzia handia, 10.000 genoma oso baino gehiago muntatuta.
● Salmenta osteko laguntza teknikoko talde profesionala, ikerketa-behar zehatzagoak betetzen dituena.
Zerbitzuaren zehaztapenak
| SekuentziazioaEstrategia | Liburutegia | Kalitatea bermatuta | Gutxi gorabeherako epea |
| Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 Hutsunea | 30 Egun |
| PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
Bioinformatikako analisiak
● Datu gordinak kalitate kontrola
● Genomaren muntaia
● Genomaren osagaien analisia
● Gene-funtzioaren oharpena
● Analisi genomiko konparatiboa
Lagin-baldintzak eta entrega
Lagin-baldintzak:
Izan ereDNAren laburpenak:
| Lagin mota | Zenbatekoa | Kontzentrazioa | Garbitasuna |
| DNAren laburpenak | > 2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Ehun laginetarako:
| Lagin mota | Gomendatutako laginaren tratamendua | Laginak biltegiratzea eta bidaltzea |
| Bakterioak | Behatu bakterioak mikroskopioan eta bildu bakterioak beren fase esponentzialean Transferitu bakterioen kultura (gutxi gorabehera 3-4,5e9 zelula dituena) 1,5 edo 2 ml-ko eppendorf batera.(Jarraitu izotzean) Zentrifugatu hodia 1 min 14000 g-tan bakterioak biltzeko eta gainnatzailea kontu handiz kendu Hodia itxi eta bakterioak izoztu nitrogeno likidoan gutxienez 30 minutuz.Gorde hodia -80 ℃ hozkailuan. | Izoztu laginak nitrogeno likidoan 3-4 orduz eta gorde nitrogeno likidoan edo -80 gradu epe luzerako erreserbarako.Laginak izotz lehorrekin bidaltzea beharrezkoa da. |
Zerbitzuaren Lan Fluxua
Laginaren entrega
Liburutegiaren eraikuntza
Sekuentziazioa
Datuen azterketa
Salmenta osteko zerbitzuak
1.Bakterioen genomaren zirkuak
2.Kodeketa geneen aurreikuspena
3.Genomika konparatiboaren analisia: zuhaitz filogenetikoa
