-
ພັນທຸ ກຳ ວິວັດທະນາການ
ແພລະຕະຟອມການວິເຄາະທາງພັນທຸກໍາຂອງປະຊາກອນ ແລະວິວັດທະນາການແມ່ນສ້າງຕັ້ງຂຶ້ນບົນພື້ນຖານປະສົບການອັນໃຫຍ່ຫຼວງທີ່ສະສົມພາຍໃນທີມ R&D ຂອງ BMK ເປັນເວລາຫຼາຍປີ.ມັນເປັນເຄື່ອງມືທີ່ເປັນມິດກັບຜູ້ໃຊ້ໂດຍສະເພາະແມ່ນສໍາລັບນັກຄົ້ນຄວ້າທີ່ບໍ່ໄດ້ສໍາຄັນໃນ bioinformatics.ເວທີນີ້ເຮັດໃຫ້ການວິເຄາະພື້ນຖານກ່ຽວກັບພັນທຸກໍາວິວັດທະນາການພື້ນຖານລວມທັງການກໍ່ສ້າງຕົ້ນໄມ້ phylogenetic, ການວິເຄາະຄວາມບໍ່ສົມດຸນຂອງການເຊື່ອມໂຍງ, ການປະເມີນຄວາມຫຼາກຫຼາຍທາງພັນທຸກໍາ, ການວິເຄາະການຄັດເລືອກ, ການວິເຄາະພີ່ນ້ອງ, PCA, ການວິເຄາະໂຄງສ້າງປະຊາກອນ, ແລະອື່ນໆ.
-
circ-RNA
Circular RNA (circRNA) ແມ່ນປະເພດຂອງ RNA ທີ່ບໍ່ມີການເຂົ້າລະຫັດ, ເຊິ່ງໄດ້ຖືກພົບເຫັນວ່າມີບົດບາດສໍາຄັນໃນເຄືອຂ່າຍກົດລະບຽບທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການພັດທະນາ, ການຕໍ່ຕ້ານສິ່ງແວດລ້ອມ, ແລະອື່ນໆ. ແຕກຕ່າງຈາກໂມເລກຸນ RNA ເສັ້ນ, ເຊັ່ນ mRNA, lncRNA, 3′ ແລະ 5′. ປາຍຂອງ circRNA ຖືກລວມເຂົ້າກັນເພື່ອສ້າງເປັນໂຄງສ້າງວົງ, ເຊິ່ງຊ່ວຍປະຢັດພວກມັນຈາກການຍ່ອຍສະຫຼາຍຂອງ exonuclease ແລະມີຄວາມຫມັ້ນຄົງຫຼາຍກ່ວາ RNA ເສັ້ນເກືອບທັງຫມົດ.CircRNA ໄດ້ຖືກພົບເຫັນວ່າມີຫນ້າທີ່ຫຼາກຫຼາຍໃນການຄວບຄຸມການສະແດງອອກຂອງ gene.CircRNA ສາມາດປະຕິບັດເປັນ ceRNA, ເຊິ່ງຜູກມັດ miRNA ແຂ່ງຂັນ, ເອີ້ນວ່າ miRNA sponge.ເວທີການວິເຄາະລໍາດັບ CircRNA ເສີມສ້າງໂຄງສ້າງ circRNA ແລະການວິເຄາະການສະແດງອອກ, ການຄາດຄະເນເປົ້າຫມາຍແລະການວິເຄາະຮ່ວມກັນກັບໂມເລກຸນ RNA ປະເພດອື່ນໆ.
-
BSA
ແພລະຕະຟອມການວິເຄາະ Segregant Bulked ປະກອບດ້ວຍການວິເຄາະມາດຕະຖານຂັ້ນຕອນດຽວແລະການວິເຄາະຂັ້ນສູງດ້ວຍການຕັ້ງຄ່າພາລາມິເຕີທີ່ກໍາຫນົດເອງ.BSA ແມ່ນເຕັກນິກທີ່ໃຊ້ເພື່ອກໍານົດຕົວຊີ້ທາງພັນທຸກໍາທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບ phenotype ຢ່າງໄວວາ.ຂະບວນການເຮັດວຽກຕົ້ນຕໍຂອງ BSA ປະກອບມີ: 1. ການຄັດເລືອກສອງກຸ່ມຂອງບຸກຄົນທີ່ມີ phenotypes ກົງກັນຂ້າມທີ່ສຸດ;2. ການລວມເອົາ DNA, RNA ຫຼື SLAF-seq (ພັດທະນາໂດຍ Biomarker) ຂອງບຸກຄົນທັງໝົດເພື່ອສ້າງເປັນສອງສ່ວນຂອງ DNA;3. ການກໍານົດລໍາດັບຄວາມແຕກຕ່າງຕໍ່ກັບ genome ອ້າງອິງຫຼືໃນລະຫວ່າງ, 4. ຄາດຄະເນພາກພື້ນທີ່ເຊື່ອມຕໍ່ໂດຍ ED ແລະ SNP-index algorithm;5. ການວິເຄາະໜ້າທີ່ ແລະການປັບປຸງພັນທຸກໍາໃນພາກພື້ນຂອງຜູ້ສະໝັກ, ແລະອື່ນໆ. ຍັງມີການຂຸດຄົ້ນຂໍ້ມູນແບບພິເສດຫຼາຍຂຶ້ນ ລວມທັງການກວດຫາເຄື່ອງໝາຍພັນທຸກໍາ ແລະການອອກແບບ primer.
-
ແອມລິຄອນ (16 ວິນາທີ/18ວິ/ITS)
ແພລດຟອມ Amplicon (16S/18S/ITS) ຖືກພັດທະນາດ້ວຍປະສົບການຫຼາຍປີໃນການວິເຄາະໂຄງການຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຈຸລິນຊີ, ເຊິ່ງປະກອບດ້ວຍການວິເຄາະພື້ນຖານມາດຕະຖານ ແລະການວິເຄາະສ່ວນບຸກຄົນ: ການວິເຄາະພື້ນຖານກວມເອົາເນື້ອໃນການວິເຄາະຫຼັກຂອງການຄົ້ນຄວ້າຈຸລິນຊີໃນປະຈຸບັນ, ເນື້ອໃນການວິເຄາະແມ່ນອຸດົມສົມບູນ ແລະສົມບູນແບບ, ແລະຜົນໄດ້ຮັບການວິເຄາະໄດ້ຖືກນໍາສະເຫນີໃນຮູບແບບຂອງບົດລາຍງານໂຄງການ;ເນື້ອໃນຂອງການວິເຄາະສ່ວນບຸກຄົນແມ່ນມີຄວາມຫລາກຫລາຍ.ຕົວຢ່າງສາມາດເລືອກໄດ້ແລະຕົວກໍານົດການສາມາດກໍານົດຄວາມຍືດຫຍຸ່ນຕາມບົດລາຍງານການວິເຄາະພື້ນຖານແລະຈຸດປະສົງການຄົ້ນຄວ້າ, ເພື່ອຮັບຮູ້ຄວາມຕ້ອງການສ່ວນບຸກຄົນ.ລະບົບປະຕິບັດການ Windows, ງ່າຍດາຍແລະໄວ.
