条形 Banner-03

Aurrealdi

Sekuentziazio metagenomikoa -NGS

图片 62

Metageno bat organismoen komunitate mistoaren material genetiko osoaren bilduma da, hala nola ingurumen eta giza metagenomak. Mikroorganismo laborantzagarrien eta landu gabekoen genomak ditu. Eskopeten sekuentziazio metagenomikoak NGS-rekin batera ingurumen laginetan txertatutako paisaia genomiko korapilatsu hauen azterketa ahalbidetzen du profil taxonomiko baino gehiago emanez, espezieen aniztasunari, ugaritasunen dinamikan eta biztanleria konplexuen egiturei buruzko ikuspegi granularrak emanez. Ikasketa taxonomikoetatik haratago, eskopetaren metagenomikak genomika funtzionalaren ikuspegia ere eskaintzen du, gene kodetuen esplorazioa eta prozesu ekologikoetan eginkizunak esploratzea ahalbidetuz. Azkenik, elementu genetikoen eta ingurumen-faktoreen arteko korrelazio sareek ezartzeak komunitate mikrobioen arteko interakzio korapilatsuaren ulermen holistikoa eta haien aurrekari ekologikoa ditu. Ondorioz, sekuentziazio metagenomikoak mikrobio komunitate desberdinen intlikazio genomikoak argitzeko tresna pibotal gisa kokatzen da, ekosistema konplexu horien barruan genetikaren eta ekologiaren arteko erlazio ugari argituz.

Plataformak: Illumina Novaseq eta DNBSEQ-T7


Zerbitzuaren xehetasunak

Bioinformatika

Demo emaitzak

Nabarmendutako argitalpenak

Zerbitzuaren abantailak

Mikrobioen komunitatearen profiletarako isolamendua eta laborantza gabeko metodoa: Ekualazio organismoetatik material genetikoa sekuentziatzea gaitzea.

Bereizmen handiko: Ingurumen laginetan ugaritasun txikiko espezieak antzeman.

Bioinformatika analisi integrala:Aniztasun taxonomikoan ez ezik, komunitatearen aniztasun funtzionalaren gainera bideratuta dago.

Esperientzia zabala:200.000 lagin baino gehiagotan hainbat metagenomika proiektu metagenomika proiektuetan arrakastaz itxi eta gure taldeak esperientzia ugari dakartza proiektu guztiei.

Zerbitzuaren zehaztapenak

Sekuentziazio plataforma

Sekuentziazio estrategia

Gomendatutako datuak

Kalitatearen kontrola

Illumina novaseq edo dnbseq-t7

Pe150

6-20gb

% 30,85%

Zerbitzuaren baldintzak

Kontzentrazioa (NG / μL)

Zenbateko osoa (ng)

Bolumena (μL)

≥1

≥30

≥20

● Lurzorua / lohia: 2-3g
● Hesteetako edukia-animalia: 0,5-2g
● Hesteetako edukia-intsektua: 0,1-0.25g
● Landarearen azalera (sedimentu aberastua): 0,5-1g
● Hartzidura salda bahitu sedimentua): 0,2-0,5g
● Faiak (animalia handiak): 0,5-2g
● Faiak (sagua): 3-5grains
● Biriketako albeolar fluidoa: iragazki papera
● Baginala Swab: 5-6 swabs
● Larruazala / Genitala Swab / Saliva / Ahozko Ehun biguna / PharynGeal Swab / Rectal Swab: 2-3 swabs
● Gainazaleko mikroorganismoa: 5-6 swabs
● Ura / Aire / biofilm: iragazki papera
● Endofitoak: 2-3g
● Hortzetako plaka: 0,5-1g

Zerbitzuaren lan-fluxua

Laginaren entrega

Laginaren entrega

Liburutegiko prestaketa

Liburutegiko eraikuntza

Sekuentziazio

Sekuentziazio

Datuen azterketa

Datuen azterketa

Salmenta zerbitzuak

Salmenta osteko zerbitzuak


  • Aurrekoa:
  • Hurrengoa:

  • 流程图 贝贝第三版 -01

    Analisi hau barne hartzen du:

    ● Datuen kalitatearen kontrolaren sekuentziazioa

    ● Metagenomaren muntaketa eta genearen iragarpena

    ● Gene oharpena

    ● Alpha aniztasunaren azterketa taxonomikoa

    ● Komunitatearen azterketa funtzionala: funtzio biologikoa, erresistentzia metabolikoa, antibiotiko antibiotikoa

    ● Aniztasun funtzional eta taxonomikoaren azterketa:

    Beta Aniztasunaren Analisia

    Talde arteko analisia

    Korrelazioaren analisia: ingurumen faktoreen eta konposizioaren eta aniztasunaren artean

    Analisi funtzionala: Txartela antibiotikoen erresistentzia

    图片 63

    Kegg bide metabolikoen azterketa diferentziala: bide esanguratsuen heatmap

     

    图片 64

     Alpha banaketa taxonomikoaren aniztasuna: ACE indizea

    图片 65

     

    Beta Banaketa taxonomikoaren aniztasuna: PCOA

    图片 66

    Arakatu BMKGene-ren sekuentziazio zerbitzuek argitalpen bilduma komisario baten bidez.

    Hai, Q. et al. (2023) 'Ortzadar amuarrainaren hesteetako edukien (Oncorhynchus Mykiss) aldaketen azterketa metagenomikoa eta metabolomikoa, nekrosi hematopoietikoko birus kutsatuarekin kutsatuta, kulturaren ur tenperatura desberdinetan ",Mikrobiologian dauden mugak, 14, or. 1275649. DOI: 10.3389 / FMICB.2023.1275649.

    Mao, C. et al. (2023) "Mikrobioen komunitateak, erresistentzia geneak eta erresistentzia arriskuak Estatu trofiko desberdinetako hiri-aintziretan: barne estekak eta kanpoko eraginak",Material arriskutsuen aldizkariak aurrera egiten du, 9, or. 100233. DOI: 10.1016 / J.HAZADV.2023.100233.

    Su, M. et al. (2022) 'Azterketa metagenomikoek konposizio eta funtzioaren desberdintasunak agerian utzi zituzten ardi-errumen likido eta lotutako mikroorganismoen artean ",Mikrobiologian dauden mugak, 13, or. 851567. DOI: 10.3389 / FMICB.2022.851567.

    Yin, J. et al. (2023) 'Ningxiang Pig-eratorritako mikrobiotak carnitina metabolismoa berrantolatzen du gihar gantz azidoen gordailua sustatzeko, lean dly txerrietan ",Berrikuntza, 4 (5), or. 100486. DOI: 10.1016 / J.XINN.2023.100486.

    Zhao, X. et al. (2023) 'Haihe itsasadarraren goiko eta beheko hezkuntzako plastikozko eta plastikorik gabeko hondakinik gabeko arriskuen inguruko ikuspegi metagenomikoak.Ingurune osoaren zientzia, 887, or. 164026. DOI: 10.1016 / J.SCITOTENV.2023.164026.

    Lortu aurrekontua

    Idatzi zure mezua hemen eta bidali iezaguzu

    Bidali zure mezua guri: