BMKCloud Log in
条形banner-03

Produktuak

ARNm eukariotoen sekuentziazioa-Illumina

mRNA sekuentziatzeak baldintza zehatzetan zeluletatik transkriptutako mRNA guztien profila ahalbidetzen du.Zenbait prozesu biologikoren gene-adierazpen-profila, gene-egiturak eta mekanismo molekularrak ezagutarazteko teknologia indartsua da.Orain arte, mRNAren sekuentziazioa oso erabilia izan da oinarrizko ikerketan, diagnostiko klinikoan, sendagaien garapenean, etab.

Plataforma: Illumina NovaSeq Plataforma


Zerbitzuaren xehetasunak

Bioinformatika

Demo emaitzak

Abantailak

● Esperientzia handikoa: BMKn 200.000 lagin baino gehiago prozesatu dira hainbat lagin mota biltzen dituztenak, besteak beste, zelula-kultura, ehuna, gorputz-likidoa, etab. eta 7.000 mRNA-Seq proiektu baino gehiago itxi dira hainbat ikerketa-eremu hartzen dituztenak.

● Kalitate-kontrol-sistema zorrotza: oinarrizko kalitate-kontroleko puntuak laginak prestatzea, liburutegia prestatzea, sekuentziazioa eta bioinformatika barne hartzen dituzten urrats guztietan jarraipen zorrotzean daude kalitate handiko emaitzak emateko.

● Datu-base anitz eskuragarri funtzioen oharrak eta aberaste-azterketak egiteko, ikerketa-helburu desberdinak betetzeko.

● Salmenta osteko zerbitzuak: salmenta osteko zerbitzuak 3 hilabeterako balio du proiektua amaitzean, proiektuen jarraipena, arazoak konpontzea, emaitzen galderak eta abar barne.

Lagin-baldintzak eta entrega

Liburutegia Sekuentziazio estrategia Gomendatutako datuak Kalitate kontrola
Poly A aberastua Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85%

Lagin-baldintzak:

Nukleotidoak:

Konk. (ng/μl)

Kantitatea (μg)

Garbitasuna

Osotasuna

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Gelan agertzen da proteina edo DNA kutsadura mugatua edo ez.

Landareetarako: RIN≥6,5;

Animalientzat: RIN≥7,0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

Oinarrizko kota mugatua edo ez

Ehuna: Pisua (lehorra):≥1 g
*5 mg baino txikiagoak diren ehunetarako, izoztutako (nitrogeno likidoan) ehun lagina bidaltzea gomendatzen dugu.

Zelula esekidura:Gelaxka kopurua = 3×106- 1×107
* Izoztutako zelula lisatua bidaltzea gomendatzen dugu.Gelaxka hori 5×105 baino txikiagoa bada.

Odol laginak:Bolumena ≥1 ml

Mikroorganismoa:Masa ≥ 1 g

Laginaren entrega gomendatua

Ontzia: 2 ml zentrifugatzaile-hodia (ez da gomendagarria eztainu-papera)

Laginaren etiketatzea: Taldea+erreplika, adibidez, A1, A2, A3;B1, B2, B3....

Bidalketa:

  1. Izotz lehorra: laginak poltsetan sartu eta izotz lehorrean lurperatu behar dira.
  2. RNAstable hodiak: RNA laginak RNA egonkortzeko hodi batean lehortu daitezke (adibidez, RNAstable®) eta giro-tenperaturan bidal daitezke.

Zerbitzuaren Lan Fluxua

Lagina QC

Esperimentuen diseinua

laginaren entrega

Laginaren entrega

Esperimentu pilotua

RNA erauzketa

Liburutegiaren Prestaketa

Liburutegiaren eraikuntza

Sekuentziazioa

Sekuentziazioa

Datuen azterketa

Datuen azterketa

Salmenta osteko Zerbitzuak

Salmenta osteko zerbitzuak


  • Aurrekoa:
  • Hurrengoa:

  • Bioinformatika

    wps_doc_10

    Eukariotoa mRNA sekuentziazioaren analisiaren lan-fluxua

    Bioinformatika

    ØDatu gordinak kalitate kontrola

    ØErreferentzia genomaren lerrokatzea

    ØTranskripzioaren egituraren azterketa

    ØAdierazpenen kuantifikazioa

    ØAdierazpen diferentzialaren analisia

    ØFuntzioen oharpena eta aberastea

    1.mRNA Datuen Saturazio-kurba

    3 (1)

    2.Adierazpen diferentzialaren analisia-Sumendien grafikoa

    4 (1)

    3.KEGG oharpena DEGetan

    5 (1)

    4.GO sailkapena DEGetan

    6 (1)

    jaso aurrekontua

    Idatzi zure mezua hemen eta bidali iezaguzu

    Bidali zure mezua: