page_head_bg

Produktuak

ARNm eukariotoen sekuentziazioa-Illumina

mRNA sekuentziatzeak zeluletatik transkriptutako mRNA guztien profila ahalbidetzen du baldintza zehatzetan.Zenbait prozesu biologikoren gene-adierazpen-profila, gene-egiturak eta mekanismo molekularrak ezagutarazteko teknologia indartsua da.Orain arte, mRNAren sekuentziazioa oso erabilia izan da oinarrizko ikerketan, diagnostiko klinikoan, sendagaien garapenean, etab.

Plataforma: Illumina NovaSeq 6000


Zerbitzuaren xehetasunak

Bioinformatika

Demo emaitzak

Abantailak

ØEsperientzia handikoa: BMKn 200.000 lagin baino gehiago prozesatu dira hainbat lagin mota biltzen dituztenak, besteak beste, zelula-kultura, ehuna, gorputz-fluidoa, etab. eta 7.000 mRNA-Seq proiektu baino gehiago itxi dira hainbat ikerketa-eremu barne.

ØKalitate-kontrol-sistema zorrotza: oinarrizko kalitate-kontroleko puntuak laginak prestatzea, liburutegia prestatzea, sekuentziazioa eta bioinformatika barne hartzen dituzten urrats guztietan jarraipen zorrotzean daude kalitate handiko emaitzak emateko.

ØHainbat datu-base erabilgarri daude funtzioen oharrak eta aberaste ikasketak egiteko, ikerketa-helburu desberdinak betetzeko.

ØSalmenta osteko zerbitzuak: salmenta osteko zerbitzuak 3 hilabeterako balio du proiektua amaitzean, proiektuen jarraipena, arazoak konpontzea, emaitzen galderak eta erantzunak barne.

Lagin-baldintzak eta entrega

Liburutegia Sekuentziazio estrategia Gomendatutako datuak Kalitate kontrola
Poly A aberastua Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85%

Lagin-baldintzak:

Nukleotidoak:

Garbitasuna Osotasuna Zenbatekoa
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Gelan agertzen da proteina edo DNA kutsadura mugatua edo ez. Landareentzat: RIN≥6,5;Animalientzat: RIN≥7;28S/18S≥1,0;oinarrizko kota mugatua edo ez Konk.≥30 ng/μl;Bolumena ≥ 10 μl;Guztira ≥ 1,5 μg

Ehuna: Pisua (lehorra):≥1 g
*5 mg baino txikiagoak diren ehunetarako, izoztutako (nitrogeno likidoan) ehun lagina bidaltzea gomendatzen dugu.

Zelula esekidura:Gelaxka kopurua = 3×106- 1×107
* Izoztutako zelula lisatua bidaltzea gomendatzen dugu.Zelula hori 5×105 baino txikiagoa bada, nitrogeno likidoan izoztutako flasha gomendatzen da, eta hori hobe da mikro erauzketarako.

Odol laginak:Bolumena ≥1 ml

Mikroorganismoa:Masa ≥ 1 g

Gomendatutako Laginaren Bidalketa

Ontzia: 2 ml zentrifuga-hodi (ez da gomendagarria eztainu-papera)

Laginaren etiketatzea: Taldea+erreplika, adibidez, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Bidalketa:

  1. Izotz lehorra: laginak poltsetan sartu eta izotz lehorrean lurperatu behar dira.
  2. RNAstable hodiak: RNA laginak RNA egonkortzeko hodi batean lehortu daitezke (adibidez, RNAstable®) eta giro-tenperaturan bidal daitezke.

Zerbitzuaren Lan Fluxua

logo_01

Esperimentuen diseinua

logo_02

Laginaren entrega

logo_03

RNA erauzketa

logo_04

Liburutegiaren eraikuntza

logo_05

Sekuentziazioa

logo_06

Datuen azterketa

logo_07

Salmenta osteko zerbitzuak


  • Aurrekoa:
  • Hurrengoa:

  • Bioinformatika

    2(1)

    Eukariotoa mRNA sekuentziazioaren analisiaren lan-fluxua

    Bioinformatika

    ØDatu gordinaren kalitatearen kontrola

    ØErreferentzia genomaren lerrokatzea

    ØTranskripzioaren egituraren azterketa

    ØAdierazpenen kuantifikazioa

    ØAdierazpen diferentzialaren analisia

    ØFuntzioen oharpena eta aberastea

    1.mRNA Datuen Saturazio kurba

    3(1)

    2.Adierazpen diferentzialaren analisia-Sumendien grafikoa

    4(1)

    3.KEGG oharpena DEGetan

    5(1)

    4.GO sailkapena DEGetan

    6(1)

    jaso aurrekontua

    Idatzi zure mezua hemen eta bidali iezaguzu

    Bidali zure mezua: