Øມີປະສົບການສູງ: ຫຼາຍກວ່າ 200,000 ຕົວຢ່າງໄດ້ຖືກປຸງແຕ່ງໃນ BMK ກວມເອົາຊະນິດຕົວຢ່າງທີ່ຫຼາກຫຼາຍ, ລວມທັງວັດທະນະທໍາຈຸລັງ, ເນື້ອເຍື່ອ, ນ້ໍາໃນຮ່າງກາຍ, ແລະອື່ນໆແລະຫຼາຍກວ່າ 7,000 ໂຄງການ mRNA-Seq ໄດ້ປິດກວມເອົາພື້ນທີ່ການຄົ້ນຄວ້າຕ່າງໆ.
Øລະບົບການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບທີ່ເຂັ້ມງວດ: ຈຸດຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຫຼັກຜ່ານທຸກຂັ້ນຕອນລວມທັງການກະກຽມຕົວຢ່າງ, ການກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດ, ການຈັດລໍາດັບແລະ bioinformatics ແມ່ນຢູ່ພາຍໃຕ້ການຕິດຕາມຢ່າງໃກ້ຊິດເພື່ອໃຫ້ຜົນໄດ້ຮັບທີ່ມີຄຸນນະພາບສູງ.
Øຖານຂໍ້ມູນຫຼາຍອັນທີ່ມີໃຫ້ສໍາລັບຄໍາອະທິບາຍການເຮັດວຽກແລະການສຶກສາການເສີມສ້າງເພື່ອບັນລຸເປົ້າຫມາຍການຄົ້ນຄວ້າທີ່ຫຼາກຫຼາຍ.
Øການບໍລິການຫຼັງການຂາຍ: ການບໍລິການຫຼັງການຂາຍມີເວລາ 3 ເດືອນຫຼັງຈາກໂຄງການສໍາເລັດ, ລວມທັງການຕິດຕາມໂຄງການ, ການແກ້ໄຂບັນຫາ, ຜົນໄດ້ຮັບ Q&A, ແລະອື່ນໆ.
ຫໍສະໝຸດ | ຍຸດທະສາດການຈັດລໍາດັບ | ຂໍ້ມູນແນະນໍາ | ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບ |
ອຸດົມດ້ວຍໂພລີ A | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nucleotides:
ຄວາມບໍລິສຸດ | ຄວາມຊື່ສັດ | ຈໍານວນ |
OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5ຈໍາກັດຫຼືບໍ່ມີການປົນເປື້ອນທາດໂປຼຕີນຫຼື DNA ທີ່ສະແດງຢູ່ໃນເຈນ. | ສໍາລັບພືດ: RIN≥6.5;ສໍາລັບສັດ: RIN≥7;28S/18S≥1.0;ຄວາມສູງຈໍາກັດຫຼືບໍ່ມີພື້ນຖານ | Conc.≥30 ng/μl;ປະລິມານ ≥ 10 μl;ທັງໝົດ ≥ 1.5 μg |
ເນື້ອເຍື່ອ: ນໍ້າໜັກ (ແຫ້ງ):≥1 g
* ສໍາລັບເນື້ອເຍື່ອຂະຫນາດນ້ອຍກວ່າ 5 ມລກ, ພວກເຮົາແນະນໍາໃຫ້ສົ່ງຕົວຢ່າງເນື້ອເຍື່ອ frozen (ໃນໄນໂຕຣເຈນຂອງແຫຼວ) flash.
ການລະງັບເຊລ:ຈຳນວນຕາລາງ = 3×106- 1×107
*ພວກເຮົາແນະນໍາໃຫ້ສົ່ງ lysate ຫ້ອງ frozen.ໃນກໍລະນີທີ່ຈຸລັງມີຂະຫນາດນ້ອຍກວ່າ 5 × 105, flash frozen ໃນໄນໂຕຣເຈນຂອງແຫຼວແມ່ນແນະນໍາ, ເຊິ່ງດີກວ່າສໍາລັບການສະກັດຈຸນລະພາກ.
ຕົວຢ່າງເລືອດ:ປະລິມານ≥1 ml
ຈຸລິນຊີ:ມະຫາຊົນ ≥ 1 g
ບັນຈຸ: 2 ml centrifuge tube (tin foil ແມ່ນບໍ່ແນະນໍາ)
ການຕິດສະຫຼາກຕົວຢ່າງ: Group+replicate ເຊັ່ນ: A1, A2, A3;B1, B2, B3......
ການຂົນສົ່ງ:
ຊີວະຂໍ້ມູນຂ່າວສານ
Eukaryotic ຂັ້ນຕອນການວິເຄາະການຈັດລໍາດັບ mRNA
ຊີວະຂໍ້ມູນຂ່າວສານ
Øການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນດິບ
Øການຈັດຮຽງ genome ອ້າງອີງ
Øການວິເຄາະໂຄງສ້າງການຖອດຂໍ້ຄວາມ
Øປະລິມານການສະແດງອອກ
Øການວິເຄາະການສະແດງອອກທີ່ແຕກຕ່າງ
ØFunction annotation ແລະການເສີມສ້າງ
1.ເສັ້ນໂຄ້ງການອີ່ມຕົວຂອງຂໍ້ມູນ mRNA
2.ການວິເຄາະການສະແດງອອກທີ່ແຕກຕ່າງກັນ - ແຜນການຂອງພູເຂົາໄຟ
3.ຄໍາອະທິບາຍ KEGG ກ່ຽວກັບ DEGs
4.ການຈັດປະເພດ GO ໃນ DEGs