条形ປ້າຍໂຄສະນາ-03

ຜະລິດຕະພັນ

ການຈັດລໍາດັບ Metatranscriptome

ການໃຊ້ເທກໂນໂລຍີການຈັດລໍາດັບ Illumina, ການບໍລິການຈັດລໍາດັບ metatranscriptome ຂອງ BMKGENE ເປີດເຜີຍການສະແດງອອກຂອງ gene dynamic ຂອງ microbes ຫຼາກຫຼາຍຊະນິດ, ຂະຫຍາຍ eukaryotes ກັບ prokaryotes ແລະໄວຣັສ, ພາຍໃນສະພາບແວດລ້ອມທໍາມະຊາດເຊັ່ນດິນ, ນ້ໍາ, ທະເລ, ອາຈົມ, ແລະລໍາໄສ້. ການບໍລິການທີ່ສົມບູນແບບຂອງພວກເຮົາໃຫ້ອຳນາດແກ່ນັກຄົ້ນຄວ້າເພື່ອເຈາະເລິກເຖິງໂປຣໄຟລ໌ການສະແດງອອກຂອງເຊື້ອຈຸລິນຊີທີ່ສົມບູນຂອງຊຸມຊົນຈຸລິນຊີທີ່ສັບສົນ. ນອກເຫນືອຈາກການວິເຄາະ taxonomic, ການບໍລິການຈັດລໍາດັບ metatranscriptome ຂອງພວກເຮົາອໍານວຍຄວາມສະດວກໃນການສໍາຫຼວດໄປສູ່ການເສີມສ້າງທີ່ເປັນປະໂຫຍດ, ສ່ອງແສງກ່ຽວກັບພັນທຸກໍາທີ່ສະແດງອອກແຕກຕ່າງກັນແລະພາລະບົດບາດຂອງເຂົາເຈົ້າ. ຄົ້ນພົບຄວາມເຂົ້າໃຈທາງຊີວະວິທະຍາທີ່ອຸດົມສົມບູນໃນຂະນະທີ່ທ່ານທ່ອງໄປຫາພູມສັນຖານທີ່ຊັບຊ້ອນຂອງການສະແດງອອກຂອງພັນທຸກໍາ, ຄວາມຫຼາກຫຼາຍທາງດ້ານພາສີ, ແລະການເຄື່ອນໄຫວທີ່ມີປະໂຫຍດພາຍໃນສະພາບແວດລ້ອມທີ່ຫຼາກຫຼາຍເຫຼົ່ານີ້.


ລາຍລະອຽດການບໍລິການ

ຊີວະວິທະຍາ

ຜົນການສາທິດ

ສິ່ງພິມທີ່ໂດດເດັ່ນ

ຄຸນນະສົມບັດການບໍລິການ

● rRNA depletion ປະຕິບັດຕາມທິດທາງການກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດ mRNA.

● ການຈັດລໍາດັບໃນ Illumina NovaSeq.

ຂໍ້ໄດ້ປຽບການບໍລິການ

ສຶກສາການປ່ຽນແປງຂອງຊຸມຊົນຈຸລິນຊີທີ່ຊັບຊ້ອນ:ອັນນີ້ເກີດຂຶ້ນໃນລະດັບການຖອດຂໍ້ຄວາມ ແລະສຳຫຼວດພັນທຸກຳໃໝ່ທີ່ມີທ່າແຮງ.

ອະທິບາຍການພົວພັນກັບຊຸມຊົນຈຸລິນຊີກັບເຈົ້າພາບ ຫຼືສະພາບແວດລ້ອມ.

ການ​ວິ​ເຄາະ Bioinformatic ທີ່​ສົມ​ບູນ​ແບບ​: ນີ້ສະຫນອງຄວາມເຂົ້າໃຈກ່ຽວກັບອົງປະກອບ taxonomic ຊຸມຊົນແລະທີ່ເປັນປະໂຫຍດ, ເຊັ່ນດຽວກັນກັບການວິເຄາະການສະແດງອອກຂອງ gene ທີ່ແຕກຕ່າງກັນ.

ຄໍາອະທິບາຍກ່ຽວກັບພັນທຸກໍາທີ່ກວ້າງຂວາງ:ການນໍາໃຊ້ຖານຂໍ້ມູນການທໍາງານຂອງ gene ທີ່ທັນສະໄຫມສໍາລັບຂໍ້ມູນການສະແດງອອກຂອງ gene ຂໍ້ມູນຂ່າວສານຂອງຊຸມຊົນຈຸລິນຊີ.

ສະຫນັບສະຫນູນການຂາຍຫລັງ:ຄໍາຫມັ້ນສັນຍາຂອງພວກເຮົາຂະຫຍາຍອອກໄປນອກເຫນືອການສໍາເລັດໂຄງການດ້ວຍໄລຍະເວລາການບໍລິການຫລັງການຂາຍ 3 ເດືອນ. ໃນລະຫວ່າງເວລານີ້, ພວກເຮົາສະເຫນີການຕິດຕາມໂຄງການ, ການຊ່ວຍເຫຼືອການແກ້ໄຂບັນຫາ, ແລະກອງປະຊຸມ Q&A ເພື່ອແກ້ໄຂຄໍາຖາມໃດໆທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຜົນໄດ້ຮັບ.

ຂໍ້ມູນຈໍາເພາະການບໍລິການ

ເວທີການຈັດລໍາດັບ

ຍຸດທະສາດການຈັດລໍາດັບ

ຂໍ້​ມູນ​ແນະ​ນໍາ​

ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນ

Illumina NovaSeq

PE150

12Gb

Q30≥85%

ຄວາມຕ້ອງການຕົວຢ່າງ

ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນ (ng/µL)

ຈຳນວນທັງໝົດ (µg)

ປະລິມານ (µL)

OD260/280

OD260/230

RIN

≥50

≥1.0

≥20

1.8-2.0

1.0-2.5

≥6.5

 

 

 

ກະແສວຽກບໍລິການ

ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ

ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ

ການ​ກະ​ກຽມ​ຫ້ອງ​ສະ​ຫມຸດ​

ການກໍ່ສ້າງຫໍສະຫມຸດ

ການຈັດລໍາດັບ

ການຈັດລໍາດັບ

ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ

ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ

ບໍລິການຫຼັງການຂາຍ

ບໍລິການຫຼັງການຂາຍ


  • ທີ່ຜ່ານມາ:
  • ຕໍ່ໄປ:

  • 流程图7-01

    ລວມມີການວິເຄາະຕໍ່ໄປນີ້:

    ● ການຈັດລໍາດັບການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນ

    ● ສະພາບັນດິດ

    ● ຄຳອະທິບາຍປະກອບທາງດ້ານພາສາ ແລະ ຄວາມອຸດົມສົມບູນ

    ● Functional Annotation ແລະຄວາມອຸດົມສົມບູນ

    ● ປະລິມານການສະແດງອອກ ແລະການວິເຄາະຄວາມແຕກຕ່າງ

    ການ​ແຜ່​ກະ​ຈາຍ taxonomic ຂອງ​ແຕ່​ລະ​ຕົວ​ຢ່າງ​:

     

     图片73

     

    ການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງເບຕ້າ: UPGMA

     

    图片74 

     

      

    ຄໍາອະທິບາຍທີ່ເປັນປະໂຫຍດ – GO ອຸດົມສົມບູນ

     

    图片75 

     

    ຄວາມອຸດົມສົມບູນຂອງການຈັດໝວດໝູ່ - LEFSE

     

     图片76

     

    ຄົ້ນຫາຄວາມກ້າວຫນ້າທີ່ອໍານວຍຄວາມສະດວກໂດຍການບໍລິການຈັດລໍາດັບ meta transcriptomics ຂອງ BMKGene ຜ່ານການເກັບກໍາສິ່ງພິມທີ່ຄັດສັນມາ.

    Lu, Z. et al. (2023) 'ຄວາມທົນທານຕໍ່ອາຊິດຂອງ lactate-utilizing ເຊື້ອແບັກທີເຣັຍຄໍາສັ່ງ Bacteroidales ປະກອບສ່ວນເຂົ້າໃນການປ້ອງກັນຂອງ acidosis ruminal ໃນແບ້ປັບຕົວເຂົ້າກັບອາຫານທີ່ມີຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນສູງ',ໂພຊະນາການສັດ, 14, ໜ້າ 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

    ເພງ, Z. et al. (2017) 'ການຖອດ microbiota ທີ່ເປັນປະໂຫຍດຫຼັກໃນການໝັກທາດແຂງແບບດັ້ງເດີມໂດຍ amplicons ທີ່ມີຄວາມໄວສູງແລະການຈັດລໍາດັບ metatranscriptomics',ຊາຍແດນໃນຈຸລິນຊີ, 8(ກໍລະກົດ). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.

    Wang, W. et al. (2022) 'Mycoviruses Novel ຄົ້ນພົບຈາກການສໍາຫຼວດ Metatranscriptomics ຂອງເຊື້ອເຫັດ Phytopathogenic Alternaria',ໄວຣັສ, 14(11), ໜ້າ. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

    Wei, J. et al. (2022) 'ການວິເຄາະ metatranscriptome ຂະໜານເປີດເຜີຍການເສື່ອມໂຊມຂອງທາດຍ່ອຍອາຫານຂັ້ນສອງຂອງພືດໂດຍແມງ ແລະ ລຳໄສ້ຂອງພວກມັນ',ໂມເລກຸນ ນິເວດວິທະຍາ, 31(15), ໜ້າ 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.

    ໄດ້ຮັບໃບສະເໜີລາຄາ

    ຂຽນຂໍ້ຄວາມຂອງທ່ານທີ່ນີ້ແລະສົ່ງໃຫ້ພວກເຮົາ

    ສົ່ງຂໍ້ຄວາມຂອງທ່ານໄປຫາພວກເຮົາ: