● rRNA depletion ປະຕິບັດຕາມທິດທາງການກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດ mRNA.
● ການຈັດລໍາດັບໃນ Illumina NovaSeq.
●ສຶກສາການປ່ຽນແປງຂອງຊຸມຊົນຈຸລິນຊີທີ່ຊັບຊ້ອນ:ອັນນີ້ເກີດຂຶ້ນໃນລະດັບການຖອດຂໍ້ຄວາມ ແລະສຳຫຼວດພັນທຸກຳໃໝ່ທີ່ມີທ່າແຮງ.
●ອະທິບາຍການພົວພັນກັບຊຸມຊົນຈຸລິນຊີກັບເຈົ້າພາບ ຫຼືສະພາບແວດລ້ອມ.
●ການວິເຄາະ Bioinformatic ທີ່ສົມບູນແບບ: ນີ້ສະຫນອງຄວາມເຂົ້າໃຈກ່ຽວກັບອົງປະກອບ taxonomic ຊຸມຊົນແລະທີ່ເປັນປະໂຫຍດ, ເຊັ່ນດຽວກັນກັບການວິເຄາະການສະແດງອອກຂອງ gene ທີ່ແຕກຕ່າງກັນ.
●ຄໍາອະທິບາຍກ່ຽວກັບພັນທຸກໍາທີ່ກວ້າງຂວາງ:ການນໍາໃຊ້ຖານຂໍ້ມູນການທໍາງານຂອງ gene ທີ່ທັນສະໄຫມສໍາລັບຂໍ້ມູນການສະແດງອອກຂອງ gene ຂໍ້ມູນຂ່າວສານຂອງຊຸມຊົນຈຸລິນຊີ.
●ສະຫນັບສະຫນູນການຂາຍຫລັງ:ຄໍາຫມັ້ນສັນຍາຂອງພວກເຮົາຂະຫຍາຍອອກໄປນອກເຫນືອການສໍາເລັດໂຄງການດ້ວຍໄລຍະເວລາການບໍລິການຫລັງການຂາຍ 3 ເດືອນ. ໃນລະຫວ່າງເວລານີ້, ພວກເຮົາສະເຫນີການຕິດຕາມໂຄງການ, ການຊ່ວຍເຫຼືອການແກ້ໄຂບັນຫາ, ແລະກອງປະຊຸມ Q&A ເພື່ອແກ້ໄຂຄໍາຖາມໃດໆທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຜົນໄດ້ຮັບ.
ເວທີການຈັດລໍາດັບ | ຍຸດທະສາດການຈັດລໍາດັບ | ຂໍ້ມູນແນະນໍາ | ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນ |
Illumina NovaSeq | PE150 | 12Gb | Q30≥85% |
ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນ (ng/µL) | ຈຳນວນທັງໝົດ (µg) | ປະລິມານ (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
ລວມມີການວິເຄາະຕໍ່ໄປນີ້:
● ການຈັດລໍາດັບການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນ
● ສະພາບັນດິດ
● ຄຳອະທິບາຍປະກອບທາງດ້ານພາສາ ແລະ ຄວາມອຸດົມສົມບູນ
● Functional Annotation ແລະຄວາມອຸດົມສົມບູນ
● ປະລິມານການສະແດງອອກ ແລະການວິເຄາະຄວາມແຕກຕ່າງ
ການແຜ່ກະຈາຍ taxonomic ຂອງແຕ່ລະຕົວຢ່າງ:
ການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງເບຕ້າ: UPGMA
ຄໍາອະທິບາຍທີ່ເປັນປະໂຫຍດ – GO ອຸດົມສົມບູນ
ຄວາມອຸດົມສົມບູນຂອງການຈັດໝວດໝູ່ - LEFSE
ຄົ້ນຫາຄວາມກ້າວຫນ້າທີ່ອໍານວຍຄວາມສະດວກໂດຍການບໍລິການຈັດລໍາດັບ meta transcriptomics ຂອງ BMKGene ຜ່ານການເກັບກໍາສິ່ງພິມທີ່ຄັດສັນມາ.
Lu, Z. et al. (2023) 'ຄວາມທົນທານຕໍ່ອາຊິດຂອງ lactate-utilizing ເຊື້ອແບັກທີເຣັຍຄໍາສັ່ງ Bacteroidales ປະກອບສ່ວນເຂົ້າໃນການປ້ອງກັນຂອງ acidosis ruminal ໃນແບ້ປັບຕົວເຂົ້າກັບອາຫານທີ່ມີຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນສູງ',ໂພຊະນາການສັດ, 14, ໜ້າ 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
ເພງ, Z. et al. (2017) 'ການຖອດ microbiota ທີ່ເປັນປະໂຫຍດຫຼັກໃນການໝັກທາດແຂງແບບດັ້ງເດີມໂດຍ amplicons ທີ່ມີຄວາມໄວສູງແລະການຈັດລໍາດັບ metatranscriptomics',ຊາຍແດນໃນຈຸລິນຊີ, 8(ກໍລະກົດ). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et al. (2022) 'Mycoviruses Novel ຄົ້ນພົບຈາກການສໍາຫຼວດ Metatranscriptomics ຂອງເຊື້ອເຫັດ Phytopathogenic Alternaria',ໄວຣັສ, 14(11), ໜ້າ. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'ການວິເຄາະ metatranscriptome ຂະໜານເປີດເຜີຍການເສື່ອມໂຊມຂອງທາດຍ່ອຍອາຫານຂັ້ນສອງຂອງພືດໂດຍແມງ ແລະ ລຳໄສ້ຂອງພວກມັນ',ໂມເລກຸນ ນິເວດວິທະຍາ, 31(15), ໜ້າ 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.