BMKGENE, Genomics dergisinde yayınlanan “Nemopilema Nomurai zehiri tanımlaması için PacBio ve ONT RNA dizileme yöntemlerinin karşılaştırmalı analizi” başlıklı bir çalışma için PacBio ve ONT teknolojilerini kullanarak tam uzunlukta transkriptom dizileme hizmetleri sağladı.Çalışmada, denizanası türü Nemopilema nomurai'nin zehirinin tanımlanmasında PacBio ve ONT RNA dizileme yöntemlerinin etkinliğinin karşılaştırılması amaçlandı.
Çalışmanın bulguları, ONT'nin transkriptom analizinde genellikle daha yüksek ham veri kalitesi ürettiğini, PacBio'nun ise daha uzun okuma uzunlukları ürettiğini göstermektedir.PacBio'nun kodlama dizilerini ve uzun zincirli kodlamayan RNA'yı tanımlamada üstün olduğu, oysa ONT'nin alternatif birleştirme olaylarını, basit dizi tekrarlarını ve transkripsiyon faktörlerini tahmin etmede daha uygun maliyetli olduğu bulundu.
Bu çalışma, deniz denizanasında gelecekteki dizileme teknolojileri için önemli çıkarımlara sahiptir ve denizanası dermatiti için potansiyel terapötik hedeflerin keşfedilmesinde tam uzunlukta transkriptom analizinin gücünü vurgulamaktadır.
TıklamakBuradaBu makale hakkında daha fazla bilgi edinmek için.
Gönderim zamanı: 20 Aralık 2023