BMKGENE pakkus täispika transkriptsiooni sekveneerimisteenuseid, kasutades PacBio ja ONT tehnoloogiaid uuringus pealkirjaga "PacBio ja ONT RNA sekveneerimismeetodite võrdlev analüüs Nemopilema Nomurai mürgi tuvastamiseks", mis avaldati ajakirjas Genomics.Uuringu eesmärk oli võrrelda PacBio ja ONT RNA sekveneerimismeetodite efektiivsust meduusaliigi Nemopilema nomurai mürgi tuvastamisel.
Uuringu tulemused näitavad, et ONT andis transkriptoomianalüüsis üldiselt kõrgema algandmete kvaliteedi, PacBio aga pikema lugemispikkuse.Leiti, et PacBio on parem kodeerivate järjestuste ja pika ahelaga mittekodeeriva RNA tuvastamisel, samas kui ONT oli alternatiivsete splaissimise sündmuste, lihtsate järjestuste korduste ja transkriptsioonifaktorite ennustamiseks kuluefektiivsem.
Sellel uuringul on oluline mõju mere meduuside tulevastele sekveneerimistehnoloogiatele ja see toob esile täispika transkriptoomianalüüsi võimsuse meduuside dermatiidi potentsiaalsete terapeutiliste sihtmärkide avastamisel.
Klõpsakesiinselle artikli kohta lisateabe saamiseks.
Postitusaeg: 20. detsember 2023