Küçük RNA Dizileme - Illumina
Özellikler
● Boyut seçimi kütüphanesinin hazırlanması.
● MikroRNA tahmini ve hedeflerine odaklanan biyoinformatik analiz.
Hizmet Avantajları
●Kapsamlı Uzmanlık300'den fazla numuneyi, çeşitli numune türlerini kapsayacak şekilde işledik. Her projeye zengin uzmanlığımızı getiriyoruz.
●Titiz Kalite KontrolüNumune hazırlığından kütüphane hazırlığına, sekanslamaya ve biyoinformatik işlemlerine kadar tüm aşamalarda temel kontrol noktaları uyguluyoruz. Titiz izlememiz, sürekli olarak yüksek kaliteli sonuçlar elde edilmesini sağlar.
●Kapsamlı biyoinformatik analizi:Bu, hem bilinen hem de yeni miRNA'ların tanımlanmasını, miRNA hedeflerinin belirlenmesini ve ilgili fonksiyonel açıklamaların ve çoklu veritabanlarıyla (KEGG, GO) zenginleştirmenin yapılmasını sağlar.
●Satış Sonrası Destek: Var olmanın ne kadar önemli olduğunu biliyoruz, bu nedenle taahhüdümüz proje tamamlandıktan sonra da devam ederek 3 aylık bir satış sonrası hizmet dönemi sunuyor. Bu süre zarfında, sonuçlarla ilgili tüm sorularınızı yanıtlamak için proje takibi, sorun giderme yardımı ve soru-cevap oturumları sunuyoruz.
Numune Gereksinimleri ve Teslimatı
| Kütüphane | Platform | Önerilen veriler | Veri Kalite Kontrolü |
| Seçilen beden | Illumina SE50 | 10M-20M okuma | Q30≥85% |
Örnek Gereksinimleri:
Nükleotidler:
| Konsantrasyon (ng/μl) | Miktar (μg) | Saflık | Bütünlük |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Jel üzerinde sınırlı veya hiç protein veya DNA kontaminasyonu görülmemiştir. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; sınırlı veya hiç temel yükseklik yok |
● Bitkiler:
Kök, Gövde veya Taç Yaprağı: 450 mg
Yaprak veya Tohum: 300 mg
Meyve: 1,2 g
● Hayvan:
Kalp veya Bağırsak: 450 mg
İç organlar veya beyin: 240 mg
Kas: 600 mg
Kemik, Saç veya Deri: 1,5 g
● Eklembacaklılar:
Böcekler: 9g
Kabuklular: 450 mg
● Tam kan: 2 tüp
● Hücreler: 106 hücreler
● Serum ve Plazma:6 mL
Önerilen Numune Teslimatı
Kap: 2 ml santrifüj tüpü (Alüminyum folyo kullanılması önerilmez)
Örnek etiketleme: Grup+tekrar, örneğin A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Sevkiyat:
1. Kuru buz: Numuneler torbalara konulmalı ve kuru buzun içine gömülmelidir.
2. RNA stabilizasyon tüpleri: RNA örnekleri, RNA stabilizasyon tüpünde (örneğin RNAstable®) kurutulabilir ve oda sıcaklığında gönderilebilir.
Servis İş Akışı
Deney tasarımı
Numune teslimatı
RNA ekstraksiyonu
Kütüphane inşaatı
Dizileme
Veri analizi
Satış sonrası hizmetler
Biyoinformatik
● Ham veri kalite kontrolü
● Küçük RNA sınıflandırması
● miRNA ekspresyonu ve diferansiyel ekspresyon analizi
● miRNA hedef geni ve farklı şekilde ifade edilen miRNA hedef geni açıklaması
● Hedef gen açıklaması ve farklı şekilde ifade edilen miRNA gen fonksiyonu zenginleştirmesi
miRNA'ların tanımlanması: yapı ve derinlik
miRNA'ların farklı ifade edilmesi – hiyerarşik kümeleme
Farklı şekilde ifade edilen mikroRNA'ların hedefinin fonksiyonel açıklaması
BMKGene'nin sRNA sekanslama hizmetleri sayesinde elde edilen araştırma gelişmelerini, özenle seçilmiş yayınlar koleksiyonu aracılığıyla keşfedin.
Chen, H. ve diğerleri (2023) 'Viral enfeksiyonlar Panax notoginseng'de saponin biyosentezini ve fotosentezi engeller',Bitki Fizyolojisi ve Biyokimyası, 203, s. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. ve diğerleri (2023) 'Bitki FYVE alanını içeren protein FREE1, mikroişlemci bileşenleriyle ilişki kurarak miRNA biyogenezini baskılar',EMBO raporları, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. ve diğerleri (2023) 'MikroRNA Ame-Bantam-3p, Bal Arısı Apis mellifera'da Çoklu Epidermal Büyüme Faktörü Benzeri Alanlar 8 Genini (megf8) Hedefleyerek Larva-Pupa Gelişimini Kontrol Eder',Uluslararası Moleküler Bilimler Dergisi, 24(6), s. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. ve diğerleri (2018) 'Et Kalitesiyle İlişkili MiRNA ve Genlerin Entegre Analizi, Gga-MiR-140-5p'nin Tavuklarda Kas İçi Yağ Birikimini Etkilediğini Ortaya Koyuyor',Hücresel Fizyoloji ve Biyokimya, 46(6), s. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
