Společnost BMKGENE poskytla služby plného sekvenování transkriptomu pomocí technologií PacBio a ONT pro studii s názvem „Srovnávací analýza metod sekvenování PacBio a ONT RNA pro identifikaci jedu Nemopilema Nomurai“, která byla publikována v časopise Genomics.Cílem studie bylo porovnat účinnost metod sekvenování PacBio a ONT RNA při identifikaci jedu medúzy druhu Nemopilema nomurai.
Zjištění studie naznačují, že ONT obecně produkoval vyšší kvalitu nezpracovaných dat v transkriptomové analýze, zatímco PacBio generoval delší délky čtení.Bylo zjištěno, že PacBio je lepší v identifikaci kódujících sekvencí a nekódující RNA s dlouhým řetězcem, zatímco ONT byl nákladově efektivnější pro predikci alternativních sestřihových událostí, jednoduchých opakování sekvencí a transkripčních faktorů.
Tato studie má významné důsledky pro budoucí technologie sekvenování u mořských medúz a zdůrazňuje sílu analýzy transkriptomu v plné délce při objevování potenciálních terapeutických cílů pro dermatitidu medúz.
Kliknětetadyse dozvíte více o tomto článku.
Čas odeslání: 20. prosince 2023