Firma BMKGENE świadczył usługi sekwencjonowania transkryptomu pełnej długości przy użyciu technologii PacBio i ONT na potrzeby badania zatytułowanego „Analiza porównawcza metod sekwencjonowania PacBio i ONT RNA RNA sequencing method for Nemopilema Nomurai venom Identification”, które opublikowano w czasopiśmie Genomics.Celem pracy było porównanie skuteczności metod sekwencjonowania RNA PacBio i ONT w identyfikacji jadu meduz z gatunku Nemopilema nomurai.
Wyniki badania sugerują, że ONT generalnie zapewnia wyższą jakość surowych danych w analizie transkryptomu, podczas gdy PacBio generuje dłuższe odczyty.Stwierdzono, że PacBio skutecznie identyfikuje sekwencje kodujące i długołańcuchowe niekodujące RNA, podczas gdy ONT jest bardziej opłacalne w przewidywaniu zdarzeń alternatywnego splicingu, prostych powtórzeń sekwencji i czynników transkrypcyjnych.
Badanie to ma znaczące implikacje dla przyszłych technologii sekwencjonowania meduz morskich i podkreśla siłę analizy transkryptomu pełnej długości w odkrywaniu potencjalnych celów terapeutycznych zapalenia skóry u meduz.
KliknijTutajaby dowiedzieć się więcej na temat tego artykułu.
Czas publikacji: 20 grudnia 2023 r