-
Kromatin İmmünopresipitasyon Sıralaması (ChIP-seq)
ChIP-Seq, histon modifikasyonu, transkripsiyon faktörleri ve diğer DNA ile ilişkili proteinler için DNA hedeflerinin genom çapında profilini sağlar.Spesifik protein-DNA komplekslerini kurtarmak için kromatin immünopresipitasyonunun (ChIP) seçiciliğini, geri kazanılan DNA'nın yüksek verimli dizilimi için yeni nesil dizilemenin (NGS) gücüyle birleştirir.Ayrıca protein-DNA kompleksleri canlı hücrelerden elde edildiği için bağlanma bölgeleri farklı hücre tipleri ve dokularda veya farklı koşullar altında karşılaştırılabilir.Uygulamalar, transkripsiyonel düzenlemeden gelişimsel yollara, hastalık mekanizmalarına ve ötesine kadar uzanır.
Platform: Illumina NovaSeq Platformu
-
Tüm genom bisülfit dizilimi
Sitozindeki beşinci pozisyondaki (5-mC) DNA metilasyonunun, gen ekspresyonu ve hücresel aktivite üzerinde temel bir etkisi vardır.Anormal metilasyon modelleri kanser gibi çeşitli durum ve hastalıklarla ilişkilendirilmiştir.WGBS, tek baz çözünürlüğünde genom çapında metilasyonu incelemek için altın standart haline geldi.
Platform: Illumina NovaSeq Platformu
-
Yüksek Verimli Sıralamayla Transpozazla Erişilebilir Kromatin Testi (ATAC-seq)
ATAC-seq, gen ifadesinin küresel epigenetik kontrolü için önemli olan genom çapında kromatin erişilebilirliğinin analizine yönelik yüksek verimli bir sıralama yöntemidir.Sıralama adaptörleri, hiperaktif Tn5 transpozaz tarafından açık kromatin bölgelerine yerleştirilir.PCR amplifikasyonundan sonra bir sıralama kütüphanesi oluşturulur.Tüm açık kromatin bölgeleri, yalnızca bir transkripsiyon faktörünün bağlanma bölgeleriyle veya belirli bir histonla değiştirilmiş bölgeyle sınırlı olmamak üzere, belirli bir uzay-zaman koşulu altında elde edilebilir.
-
Azaltılmış Temsil Bisülfit Sıralaması (RRBS)
DNA metilasyonu araştırması, hastalık araştırmalarında her zaman sıcak bir konu olmuştur ve gen ifadesi ve fenotipik özelliklerle yakından ilişkilidir.RRBS, DNA metilasyon araştırması için doğru, etkili ve ekonomik bir yöntemdir.Bisülfit dizilimi ile birlikte promotör ve CpG ada bölgelerinin enzimatik bölünme (Msp I) yoluyla zenginleştirilmesi, yüksek çözünürlüklü DNA metilasyon tespiti sağlar.
Platform: Illumina NovaSeq Platformu
