lncrna

Uzun kodlamayan RNA'lar (lncRNA), düşük kodlama potansiyeline sahip ancak kritik düzenleyici işlevlere sahip 200 nükleotidden uzun RNA'lardır. BMKCloud lncRNA veri hattı, lncRNA ve mRNA ekspresyonunu birlikte analiz ederek, yüksek kaliteli ve iyi tanımlanmış bir referans genomu olan rRNA'dan yoksun kütüphaneleri analiz etmek üzere tasarlanmıştır. Okuma düzeltme ve kalite kontrolünden sonra, okumalar transkriptleri birleştirmek için referans genoma hizalanır ve ardından gen yapısı analizi alternatif ekleme ve yeni genleri ortaya çıkarır. Transkriptler mRNA veya lncRNA olarak tanımlanır ve diferansiyel ekspresyon analizi, farklı şekilde ifade edilen lncRNA'ları, hedeflerini ve farklı şekilde ifade edilen genleri (DEGS) belirler. Hem DEG'ler hem de farklı şekilde ifade edilen lncRNA hedefleri, zenginleştirilmiş işlevsel kategoriler bulmak için işlevsel olarak açıklanır.