2021-ൽ, 320-ലധികം ആഘാത ഘടകങ്ങളുള്ള ഉയർന്ന സ്വാധീനമുള്ള ജേണലുകളിൽ 31 ഡി നോവോ ജീനോം ഗവേഷണം വിജയകരമായി പ്രസിദ്ധീകരിച്ചതിന് BMKGENE സാക്ഷ്യം വഹിച്ചു. 15 ലേഖനങ്ങൾ സഹ-രചയിതാവാണ് അവയിൽ 4 എണ്ണം BMKGENE ആദ്യ രചയിതാക്കളായി സഹ-രചയിതാക്കളായി.
2022-ന്റെ തുടക്കത്തിനു ശേഷം, യഥാക്രമം "നാച്ചുറൽ ജെനറ്റിക്സ്", "മോളിക്യുലാർ പ്ലാന്റ്" എന്നീ ജേണലിൽ ഇതിനകം രണ്ട് ഗവേഷണ ലേഖനങ്ങൾ പ്രസിദ്ധീകരിച്ചിട്ടുണ്ട്.അവയാണ്, “വളരെ വ്യത്യസ്തമായ ലിച്ചി ജീനോമിൽ നിന്നുള്ള രണ്ട് വ്യത്യസ്‌ത ഹാപ്ലോടൈപ്പുകൾ നേരത്തെയും വൈകിയും പക്വത പ്രാപിക്കുന്ന കൃഷികൾക്കായി സ്വതന്ത്രമായ വളർത്തൽ സംഭവങ്ങളെ നിർദ്ദേശിക്കുന്നു” (ലിച്ചി ജീനോം ഗവേഷണം, സൗത്ത് ചൈന അഗ്രികൾച്ചറൽ യൂണിവേഴ്സിറ്റി, സൗത്ത് ചൈന അഗ്രികൾച്ചറൽ യൂണിവേഴ്സിറ്റി, സയന്റിഫിക് കോൾബറേറ്റർമാർ എന്നിവർ നടത്തിയ പഠനത്തിലാണ്. ), കൂടാതെ "അഞ്ച് സിറ്റോപ്സിസ് സ്പീഷീസ് എജിലോപ്സിന്റെ ജീനോം സീക്വൻസുകളും പോളിപ്ലോയിഡ് ഗോതമ്പ് ബി-സബ്ജെനോമിന്റെ ഉത്ഭവവും" (നോർത്ത് ഈസ്റ്റ് നോർമൽ യൂണിവേഴ്‌സിറ്റിയിലെ പ്രൊഫസർ ബാവോ ലിയുവിന്റെ ഗവേഷണ സംഘം നടത്തിയ അഞ്ച് സിറ്റോപ്സിസ് സ്പീഷീസ് ജീനോം.).ഞങ്ങൾ ഈ രണ്ട് ലേഖനങ്ങളും അവലോകനം ചെയ്യുകയും ഞങ്ങളുടെ വായനക്കാരുമായി പങ്കിടുകയും ചെയ്യും.
ഇപ്പോൾ, BMK സഹ-രചയിതാവ് 2021-ൽ പ്രസിദ്ധീകരിച്ച മികച്ച ഗവേഷണ ലേഖനങ്ങളും ഞങ്ങളുടെ സഹകരിച്ചുള്ള സൗകര്യങ്ങളും നോക്കാം.
പ്ലാന്റ് ജീനോം - ഒന്നിലധികം സ്പീഷീസുകളിലെ മുന്നേറ്റങ്ങൾ.
1. ഉയർന്ന ഗുണമേന്മയുള്ള ജീനോം അസംബ്ലി റൈ ജീനോമിക് സവിശേഷതകളും കാർഷിക പ്രാധാന്യമുള്ള ജീനുകളും എടുത്തുകാണിക്കുന്നു
സഹകരിച്ചുള്ള സൗകര്യം: ഹെനാൻ അഗ്രികൾച്ചറൽ യൂണിവേഴ്സിറ്റി
ജേണൽ: നാച്ചുറൽ ജനിതകശാസ്ത്രം
ആഘാത ഘടകം: 38.31
ഈ പ്രോജക്റ്റിൽ, ഒരു എലൈറ്റ് ചൈനീസ് റൈ ഇനമായ വീനിംഗ് റൈയുടെ ജീനോം ക്രമീകരിച്ചു.കൂട്ടിച്ചേർത്ത കോണ്ടിഗുകൾ (7.74 ജിബി) കണക്കാക്കിയ ജീനോം വലുപ്പത്തിന്റെ (7.86 ജിബി) 98.47% വരും, 93.67% കോണ്ടിഗുകളും (7.25 ജിബി) ഏഴ് ക്രോമസോമുകൾക്ക് നൽകിയിട്ടുണ്ട്.കൂട്ടിച്ചേർത്ത ജനിതകത്തിന്റെ 90.31% ആവർത്തിച്ചുള്ള മൂലകങ്ങളാണ്.വെയ്നിംഗ് അസംബ്ലിയുടെ കൂടുതൽ വിശകലനങ്ങൾ, ജീനോം-വൈഡ് ജീൻ ഡ്യൂപ്ലിക്കേഷനുകളിലേക്കും അന്നജം ബയോസിന്തസിസ് ജീനുകളിലേക്കും അവയുടെ സ്വാധീനത്തെക്കുറിച്ചും പുതിയ വെളിച്ചം വീശുന്നു, സങ്കീർണ്ണമായ പ്രോലാമിൻ ലോക്കിയുടെ ഭൗതിക ഓർഗനൈസേഷൻ, ആദ്യകാല തലക്കെട്ട് സ്വഭാവത്തിന് അടിവരയിടുന്ന ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ സവിശേഷതകൾ, പുട്ടേറ്റീവ് ഗാർഹിക-അനുബന്ധ ക്രോമസോം മേഖലകൾ, റൈയിലെ ലോക്കുകൾ എന്നിവ.ഈ ജീനോം സീക്വൻസ് റൈയിലും അനുബന്ധ ധാന്യവിളകളിലും ജീനോമിക്, ബ്രീഡിംഗ് പഠനങ്ങൾ ത്വരിതപ്പെടുത്തുമെന്ന് വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു.
2. മുള്ളില്ലാത്ത റോസ്: ഈർപ്പം പൊരുത്തപ്പെടുത്തലുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ജീനോമിക് ഉൾക്കാഴ്ചകൾ
സഹകരിച്ചുള്ള സൗകര്യം: കുൻമിംഗ് ഇൻസ്റ്റിറ്റ്യൂട്ട് ഓഫ് ബോട്ടണി, ചൈനീസ് അക്കാദമി ഓഫ് സയൻസസ്
ജേണൽ: നാഷണൽ സയൻസ് റിവ്യൂ
ഇംപാക്ട് ഫാക്ടർ: 17.273
ഈ പ്രോജക്റ്റിൽ, 'Basye's Thornless' (BT, റോസ വിചുറൈയാനയുടെ മുള്ളില്ലാത്ത ഇനം), 'ഓൾഡ് ബ്ലഷ്' (OB, റോസ് വളർത്തലിലെ ഒരു സ്ഥാപക ജനിതകരൂപം), അവയുടെ F1 ഹൈബ്രിഡുകൾ, BCF1 എന്നിവയുടെ സാമ്പിളുകൾ ശേഖരിച്ചു.സ്റ്റെം പ്രിക്കിൾ വികസനവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ജനിതക ഘടകങ്ങൾ തിരിച്ചറിയുന്നതിനായി ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള റഫറൻസ് ജീനോം അസംബ്ലി ജനറേറ്റുചെയ്തു.ജനിതക വലുപ്പം ഏകദേശം 530.6 Mb ആണ്.കൂട്ടിച്ചേർത്ത ജീനോമിന്റെ ഗുണനിലവാരം പരിശോധിക്കുന്നതിന്, ജനിതക ഭൂപട താരതമ്യം, BUSCO, NGS റീഡ് അസംബ്ലി, OB ഹാപ്ലോടൈപ്പുമായുള്ള താരതമ്യം, അടിസ്ഥാന പിശക് നിരക്ക് നിയന്ത്രണം, ജീനോം-വൈഡ് LTR അസംബ്ലി സൂചിക മൂല്യ പരിശോധന (LAI=20.03) തുടങ്ങിയ വിശകലനം നടത്തി.ഈ ഗവേഷണം, തണ്ടിന്റെ മുൾച്ചെടികളുടെ സങ്കീർണ്ണമായ പാരമ്പര്യ പാറ്റേണും നിയന്ത്രണ സംവിധാനവും വെളിപ്പെടുത്തുകയും റോസ് ബയോളജിയും പ്രധാന സ്വഭാവസവിശേഷതകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഖനി തന്മാത്രാ മാർക്കറുകളും പഠിക്കുന്നതിനുള്ള അടിസ്ഥാനവും നവീനമായ വിഭവങ്ങളും ഞങ്ങൾക്ക് നൽകുകയും ചെയ്തു.
3. കുക്കുമിസിലെ സിന്തസൈസ്ഡ് അലോപോളിപ്ലോയിഡുകളുടെ മുഴുവൻ-ജീനോം സീക്വൻസ് അലോപോളിപ്ലോയിഡൈസേഷന്റെ ജീനോം പരിണാമത്തെക്കുറിച്ചുള്ള ഉൾക്കാഴ്ചകൾ വെളിപ്പെടുത്തുന്നു
സഹകരിച്ചുള്ള സൗകര്യം: നാൻജിംഗ് അഗ്രികൾച്ചറൽ യൂണിവേഴ്സിറ്റി
ജേണൽ: അഡ്വാൻസ്ഡ് സയൻസ്
ഇംപാക്ട് ഫാക്ടർ: 16.801
കുക്കുമ്പറും (C. sativus, 2n = 14) അതിന്റെ വന്യമായ ആപേക്ഷിക സ്പീഷീസുകളും (C. hystrix, 2n = 24), തുടർന്നുള്ള ക്രോമസോം ഡ്യൂപ്ലിക്കേഷനും തമ്മിലുള്ള ഇന്റർസ്പെസിഫിക് ഹൈബ്രിഡൈസേഷൻ ഉപയോഗിച്ച് ലഭിച്ച ഒരു സിന്തറ്റിക് അലോട്ടെട്രാപ്ലോയിഡിന്റെ ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള ജീനോം ഈ പഠനം റിപ്പോർട്ട് ചെയ്തു, ഇത് ആദ്യത്തേതാണ്. പൂർണ്ണമായും ക്രമീകരിച്ച സിന്തറ്റിക് അലോപോളിപ്ലോയിഡ്.ജീനോമിന്റെ അസംബ്ലി "PacBio+BioNano+Hi-C+Illumina" സീക്വൻസിംഗിന്റെ വർക്ക്ഫ്ലോ പ്രയോഗിച്ചു, ജീനോം വലുപ്പം 530.8Mb ഉം contig N50 = 6.5Mb ഉം ആയി.19 സ്യൂഡോക്രോമസോമുകൾക്കും ഉപജീനോമുകൾക്കും റീഡുകൾ നൽകി.ന്യൂക്ലിയർ, സിപി ജീനോമുകളിൽ ഭൂരിഭാഗം ജനിതകമാറ്റങ്ങൾക്കും ജീനോം ഡ്യൂപ്ലിക്കേഷനുപകരം ഹൈബ്രിഡൈസേഷൻ കാരണമാകുമെന്ന് ഫലങ്ങൾ സൂചിപ്പിച്ചു.ഫിക്സഡ് ഹെറ്ററോസൈഗോസിറ്റി, വർദ്ധിച്ച സ്ട്രെസ് പൊരുത്തപ്പെടുത്തലിനൊപ്പം സിഫലങ്ങൾ പ്ലാന്റ് പോളിപ്ലോയിഡി പരിണാമത്തെക്കുറിച്ച് പുതിയ ഉൾക്കാഴ്ചകൾ നൽകുകയും ഭാവിയിലെ വിളകൾക്കായി ഒരു പ്രജനന തന്ത്രം വാഗ്ദാനം ചെയ്യുകയും ചെയ്യുന്നു.
4. താരതമ്യ ജീനോം ഹൈലൈറ്റ് ട്രാൻസ്‌പോസൺ മീഡിയേറ്റഡ് ജീനോം വിപുലീകരണവും പരുത്തിയിലെ 3D ജീനോമിക് ഫോൾഡിംഗിന്റെ പരിണാമ വാസ്തുവിദ്യയും വിശകലനം ചെയ്യുന്നു
സഹകരിച്ചുള്ള സൗകര്യം: Huazhong അഗ്രികൾച്ചറൽ യൂണിവേഴ്സിറ്റി
ജേണൽ: മോളിക്യുലർ ബയോളജി ആൻഡ് എവല്യൂഷൻ
ഇംപാക്ട് ഫാക്ടർ: 16.242
ഈ പ്രോജക്റ്റ് നാനോപോർ സീക്വൻസിംഗ് ഉപയോഗിച്ച് മൂന്ന് കോട്ടൺ സ്പീഷീസുകളുടെ ജീനോം കൂട്ടിച്ചേർക്കാൻ ഉപയോഗിച്ചു: ഗോസിപിയം റൊട്ടണ്ടിഫോളിയം (K2, ജീനോം വലുപ്പം = 2.44Gb, contigN50 = 5.33Mb), G. അർബോറിയം (A2, ജീനോം വലുപ്പം = 1.62Gb, contigN50), ഒപ്പം 11.59 = G. raimondii (D5, ജീനോം വലുപ്പം = 0.75Gb, contigN50 = 17.04 Gb).മൂന്ന് ജീനോമുകളിൽ 99 ശതമാനവും ഹൈ-സി വഴിയാണ് സമാഹരിച്ചത്.BUSCO വിശകലനത്തിന്റെ ഫലങ്ങൾ യഥാക്രമം 92.5%, 93.9%, 95.4% എന്നിങ്ങനെയാണ്.ഈ സംഖ്യകളെല്ലാം സൂചിപ്പിക്കുന്നത് മൂന്ന് അസംബ്ലി ജീനോമുകൾ റഫറൻസ്-ഗ്രേഡ് ആണെന്നാണ്.താരതമ്യ ജീനോം വിശകലനങ്ങൾ വലിയ ജീനോം വലുപ്പ വ്യത്യാസങ്ങൾക്ക് കാരണമാകുന്ന ലൈനേജ്-സ്പെസിഫിക് ടിഇ ആംപ്ലിഫിക്കേഷന്റെ വിശദാംശങ്ങൾ രേഖപ്പെടുത്തി.സസ്യങ്ങളിലെ ഉയർന്ന ക്രമത്തിലുള്ള ക്രോമാറ്റിൻ ഘടനയുടെ പരിണാമത്തിൽ ട്രാൻസ്‌പോസൺ-മധ്യസ്ഥ ജനിതക വികാസത്തിന്റെ പങ്കിനെക്കുറിച്ച് ഈ പഠനം വെളിച്ചം വീശുന്നു.
5. ക്രോമസോം സ്കെയിൽ അസംബ്ലിയും ബയോമാസ് ക്രോപ്പിന്റെ വിശകലനവും Miscanthus lutarioriparius ജീനോം
സഹകരിച്ചുള്ള സൗകര്യം: CAS സെന്റർ ഫോർ എക്സലൻസ് ഇൻ മോളിക്യുലാർ പ്ലാന്റ് സയൻസസ്
ജേണൽ: നേച്ചർ കമ്മ്യൂണിക്കേഷൻസ്
ഇംപാക്ട് ഫാക്ടർ: 14.912
ഈ പ്രോജക്റ്റ് ഓക്സ്ഫോർഡ് നാനോപോർ സീക്വൻസിംഗും ഹൈ-സി സാങ്കേതികവിദ്യകളും സംയോജിപ്പിച്ച് മിസ്‌കാന്തസ് ലുട്ടാരിയോറിപാരിയസ് ജീനോമിന്റെ ക്രോമസോം സ്കെയിൽ അസംബ്ലി റിപ്പോർട്ട് ചെയ്തു.2.07Gb അസംബ്ലി ജനിതകത്തിന്റെ 96.64% ഉൾക്കൊള്ളുന്നു, 1.71 Mb-ന്റെ contig N50.മൊത്തം സീക്വൻസുകളുടെ 94.30% 19 സ്യൂഡോക്രോമസോമുകളായി ആങ്കർ ചെയ്തു.BAC സീക്വൻസുമായുള്ള താരതമ്യത്തിലൂടെ, LAI മൂല്യനിർണ്ണയം, BUSCO മൂല്യനിർണ്ണയം, NGS ഡാറ്റയുമായി വീണ്ടും അസംബ്ലി ചെയ്യൽ, ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് ഡാറ്റയുടെ പുനഃസംയോജനം എന്നിവയിലൂടെ, ജീനോം ഉയർന്ന നിലവാരവും തുടർച്ചയും ആയി വിലയിരുത്തപ്പെട്ടു.സെൻട്രോമെറിക് സാറ്റലൈറ്റ് റിപ്പീറ്റുകൾ ഉപയോഗിച്ച് എം.ലുട്ടാരിയോറിപാരിയസിന്റെ അലോട്ടെട്രാപ്ലോയിഡ് ഉത്ഭവം സ്ഥിരീകരിക്കുന്നു.എം. ലുട്ടാരിയോറിപാരിയസിന്റെ ടാൻഡം ഡ്യൂപ്ലിക്കേറ്റ് ജീനുകൾ സ്ട്രെസ് പ്രതികരണവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട കാര്യങ്ങളിൽ മാത്രമല്ല, സെൽ വാൾ ബയോസിന്തസിസുമായി ബന്ധപ്പെട്ട പ്രവർത്തന സമ്പുഷ്ടമാണ്.ജീൻ ഡ്യൂപ്ലിക്കേറ്റുകൾ ഒരുപക്ഷേ C4 ഫോട്ടോസിന്തസിസിൽ ഒരു പങ്കു വഹിക്കുകയും കുറഞ്ഞ താപനിലയിൽ Miscanthus C4 ഫോട്ടോസിന്തസിസിന് സംഭാവന നൽകുകയും ചെയ്യുന്നു.വറ്റാത്ത സസ്യങ്ങളെ പഠിക്കുന്നതിനുള്ള പ്രധാന റഫറൻസ് ഗവേഷണം നൽകി.
6.ഒരു ക്രോമസോം-ലെവൽ കാംപ്‌റ്റോതെക്ക അക്കുമിനേറ്റ ജീനോം അസംബ്ലി ക്യാമ്പ്‌ടോതെസിൻ ബയോസിന്തസിസിന്റെ പരിണാമ ഉത്ഭവത്തെക്കുറിച്ചുള്ള ഉൾക്കാഴ്ചകൾ നൽകുന്നു.
സഹകരിച്ചുള്ള സൗകര്യം: സിചുവാൻ യൂണിവേഴ്സിറ്റി
ജേണൽ: നേച്ചർ കമ്മ്യൂണിക്കേഷൻസ്
ഇംപാക്ട് ഫാക്ടർ: 14.912
ഈ പ്രോജക്റ്റ് ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള, ക്രോമസോം-ലെവൽ C. അക്യുമിനേറ്റ ജീനോം അസംബ്ലി റിപ്പോർട്ട് ചെയ്തു, ജീനോം വലുപ്പം 414.95Mb, contingN50 1.47Mb.C. acuminata ഒരു സ്വതന്ത്ര പൂർണ്ണ-ജീനോം തനിപ്പകർപ്പ് അനുഭവിക്കുന്നുവെന്നും അതിൽ നിന്ന് ഉരുത്തിരിഞ്ഞ നിരവധി ജീനുകൾ ക്യാമ്പോതെസിൻ ബയോസിന്തസിസുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നുവെന്നും ഞങ്ങൾ കണ്ടെത്തി.LAMT ജീനിന്റെ പ്രവർത്തനപരമായ വ്യതിചലനവും രണ്ട് SLAS ജീനുകളുടെ പോസിറ്റീവ് പരിണാമവും, അതിനാൽ, C. അക്യുമിനാറ്റയിലെ ക്യാമ്പ്‌ടോതെസിൻ ബയോസിന്തസിസിൽ ഇവ രണ്ടും വലിയ പങ്കുവഹിച്ചു.ഒരു ദ്വിതീയ മെറ്റാബോലൈറ്റിന്റെ പരിണാമ ഉത്ഭവത്തിലെ ജനിതക മാറ്റങ്ങൾ തിരിച്ചറിയുന്നതിൽ ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള ജീനോം അസംബ്ലിയുടെ പ്രാധാന്യം ഫലങ്ങൾ ഊന്നിപ്പറയുന്നു.
7. അല്ലീൽ-നിർവചിക്കപ്പെട്ട ജീനോം കസവ പരിണാമസമയത്ത് ബിയാലിക് വ്യത്യാസം വെളിപ്പെടുത്തുന്നു
സഹകരിച്ചുള്ള സൗകര്യം: ചൈനീസ് അക്കാദമി ഓഫ് ട്രോപ്പിക്കൽ അഗ്രികൾച്ചറൽ സയൻസസ്
ജേണൽ: മോളിക്യുലർ പ്ലാന്റ്
ഇംപാക്ട് ഫാക്ടർ: 13.162
ഈ പ്രോജക്റ്റ് പസഫിക് ബയോസയൻസസ് (പാക്ബയോ) സീക്വൻസിങ് പ്ലാറ്റ്ഫോം ഉപയോഗിച്ച് contigN50 1.1Mb ഉള്ള കസവയ്ക്ക് ഒരു റഫറൻസ് ജീനോം കൂട്ടിച്ചേർക്കുന്നു.BUSCO, LAI സൂചിക, ഉയർന്ന സാന്ദ്രത ജനിതക ഭൂപടം എന്നിവയുടെ മൂല്യനിർണ്ണയത്തിന് ശേഷം, കൂട്ടിച്ചേർത്ത ജീനോം റഫറൻസ്-ഗ്രേഡായി സ്ഥിരീകരിക്കുന്നു.അനാവശ്യമായ പ്രദേശങ്ങൾ കണ്ടെത്തി, ഹൈ-സി ലിങ്കുകൾ ഉപയോഗിച്ച് 18 സ്യൂഡോക്രോമസോമുകളിൽ കോണ്ടിഗുകൾ നങ്കൂരമിട്ടു.കസാവയുടെ ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ളതും അല്ലീൽ-നിർവചിക്കപ്പെട്ടതുമായ ഈ റഫറൻസ് ജീനോം, ഹോമോലോജസ് ക്രോമസോമുകളിലെ വ്യത്യസ്‌ത ബൈ-അലീലുകളെ തിരിച്ചറിയുന്നതിനും ബൈ-അലീലുകളുടെ വ്യത്യാസവും ആവിഷ്‌കാര ആധിപത്യവും അവയുടെ അടിസ്ഥാന പരിണാമ ചാലകശക്തികളും പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യാൻ അനുവദിക്കുന്നു.മരച്ചീനിയിലും മറ്റ് ഉയർന്ന വൈവിധ്യമാർന്ന വിളകളിലും പ്രജനന തന്ത്രങ്ങൾ നവീകരിക്കാൻ ഇത് സഹായിച്ചു.
8. പൗലോനിയയുടെ വേഗത്തിലുള്ള വളർച്ചയെയും പൗലോനിയ മന്ത്രവാദിനികളുടെ ചൂലിന്റെ രൂപീകരണത്തെയും കുറിച്ചുള്ള ജനിതക ഉൾക്കാഴ്ചകൾ
സഹകരിച്ചുള്ള സൗകര്യം: ഹെനാൻ അഗ്രികൾച്ചറൽ യൂണിവേഴ്സിറ്റി
ജേണൽ: മോളിക്യുലർ പ്ലാന്റ്
ഇംപാക്ട് ഫാക്ടർ: 13.162
511.6 Mb വലിപ്പമുള്ള പൗലോനിയ ഫോർച്യൂണിയുടെ ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള ന്യൂക്ലിയർ ജീനോം ഈ പ്രോജക്റ്റ് കൂട്ടിച്ചേർക്കുന്നു, 93.2% സീക്വൻസുകളും 20 സ്യൂഡോക്രോമസോമുകളിലേക്ക് നങ്കൂരമിട്ടിരിക്കുന്നു.C3 ഫോട്ടോസിന്തസിസും ക്രാസ്സുലേസിയൻ ആസിഡ് മെറ്റബോളിസം പാതയും സമന്വയിപ്പിക്കുന്നതിലൂടെ ഉയർന്ന ഫോട്ടോസിന്തറ്റിക് കാര്യക്ഷമത കൈവരിക്കാനാകും, ഇത് പൗലോനിയ മരങ്ങളുടെ അതിവേഗ വളർച്ചാ ശീലത്തിന് കാരണമായേക്കാം.PaWB ഫൈറ്റോപ്ലാസ്മയുടെ അധിക ജീനോം സീക്വൻസിങ്, ഫങ്ഷണൽ അനാലിസുകൾക്കൊപ്പം, PaWB-SAP54 എന്ന ഫലകം പൗലോനിയ PfSPLa യുമായി നേരിട്ട് ഇടപഴകുന്നു, ഇത് ubiquitin-മെഡിയേറ്റഡ് പാത്ത്‌വേ വഴി PfSPLa യുടെ അപചയത്തിന് കാരണമാകുകയും മന്ത്രവാദികളുടെ ചൂലിന്റെ രൂപീകരണത്തിലേക്ക് നയിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു.പൗലോണിയാസിന്റെ ജീവശാസ്ത്രത്തെക്കുറിച്ചും PaWB രൂപീകരിക്കുന്നതിനുള്ള നിയന്ത്രണ സംവിധാനത്തെക്കുറിച്ചും ഡാറ്റ സുപ്രധാന ഉൾക്കാഴ്ചകൾ നൽകി.
അനിമൽ ജീനോം - സ്പീഷീസ് പരിണാമത്തിന്റെ ആഴത്തിലുള്ള ഉൾക്കാഴ്ചകൾ
1. നോട്ടിലസ് പോമ്പിലിയസിന്റെ ജനിതകഘടന കണ്ണിന്റെ പരിണാമത്തെയും ബയോമിനറലൈസേഷനെയും പ്രകാശിപ്പിക്കുന്നു
സഹകരിച്ചുള്ള സൗകര്യം: സൗത്ത് ചൈന സീ ഇൻസ്റ്റിറ്റ്യൂട്ട് ഓഫ് ഓഷ്യനോളജി, CAS
ജേണൽ: നാച്ചുറൽ ഇക്കോളജി & എവല്യൂഷൻ
ഇംപാക്ട് ഫാക്ടർ: 15.462
ഈ പ്രോജക്റ്റ് നോട്ടിലസ് പോംപിലിയസിന് ഒരു സമ്പൂർണ്ണ ജീനോം അവതരിപ്പിച്ചു.സീക്വൻസ്ഡ് സെഫലോപോഡുകൾക്കിടയിൽ ഇതിന് മിനിമലിസ്റ്റ് ജീനോം ഉണ്ട്, അത് contigN50 = 1.1Mb ഉള്ള 730.58Mb ആണ്.BUSCO മൂല്യനിർണ്ണയ ഫലം 91.31% ആണ്.ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം, പ്രോട്ടിയോം, ജീൻ ഫാമിലി, ഫൈലോജെനെറ്റിക് വിശകലനം എന്നിവയുമായി സംയോജിപ്പിച്ച്, ഈ ജീനോം പിൻഹോൾ ഐ, ബയോമിനറലൈസേഷൻ തുടങ്ങിയ സെഫലോപോഡ് കണ്ടുപിടുത്തങ്ങളെക്കുറിച്ച് അടിസ്ഥാനപരമായ ഒരു റഫറൻസ് നൽകി.ഹോക്സ് ജീൻ ക്ലസ്റ്ററിന്റെ പൂർണ്ണതയിലുണ്ടായ കേടുപാടുകൾ മൊളസ്കുകളുടെ ഷെൽ അപ്രത്യക്ഷമാകുന്നതുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കാമെന്ന് ഗവേഷണം സൂചിപ്പിച്ചു.പ്രധാനമായി, ജീൻ നഷ്ടം, സ്വതന്ത്രമായ സങ്കോചം, നിർദ്ദിഷ്ട ജീൻ കുടുംബങ്ങളുടെ വികാസം, അവയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട നിയന്ത്രണ ശൃംഖലകൾ എന്നിവയുൾപ്പെടെ ഒന്നിലധികം ജീനോമിക് കണ്ടുപിടിത്തങ്ങൾ നോട്ടിലസ് പിൻഹോൾ കണ്ണിന്റെ പരിണാമത്തിന് കാരണമായേക്കാം.നിലവിലുള്ള സെഫലോപോഡുകളെ രൂപപ്പെടുത്തുന്ന പരിണാമ സാഹചര്യങ്ങളും ജീനോമിക് കണ്ടുപിടുത്തങ്ങളും പുനർനിർമ്മിക്കുന്നതിനുള്ള വിലപ്പെട്ട ഒരു വിഭവമാണ് നോട്ടിലസ് ജീനോം.
2.സീഡ്രാഗൺ ജീനോം വിശകലനം അതിന്റെ ഫിനോടൈപ്പിലേക്കും ലിംഗനിർണ്ണയ സ്ഥലത്തേയും ഉൾക്കാഴ്ച നൽകുന്നു
സഹകരിച്ചുള്ള സൗകര്യം: സൗത്ത് ചൈന സീ ഇൻസ്റ്റിറ്റ്യൂട്ട് ഓഫ് ഓഷ്യനോളജി, CAS
ജേണൽ: സയൻസ് അഡ്വാൻസസ്
ഇംപാക്ട് ഫാക്ടർ: 14.132
ഈ പ്രോജക്റ്റ് ഡി നോവോ-കോമൺ സീഡ്രാഗണിന്റെയും (ഫൈലോപ്റ്റെറിക്സ് ടെനിയോലാറ്റസ്) ആൺ പെൺ ജീനോമുകളുടെയും അതിനോട് അടുത്ത ബന്ധമുള്ള അലിഗേറ്റർ പൈപ്പ്ഫിഷിന്റെയും (സിംഗനത്തോയിഡ്സ് ബിയാകുലേറ്റസ്) ജീനോമുകളെ ക്രമീകരിച്ചു.Phyllopteryx taeniolatus-ന്റെ ജീനോം വലുപ്പം ~659 Mb（Phyllopteryx taeniolatus-ന്റെ ജീനോം വലുപ്പം 637 Mb（ഫൈലോജെനെറ്റിക് വിശകലനത്തിലൂടെ, സാധാരണ സീഡ്രാഗണും അലിഗേറ്റർ പൈപ്പ് ഫിഷും സിൻഗ്നാതിനേയുടെ സഹോദരി ടാക്‌സണാണ്, ഇത് ഏകദേശം 27.3 Ma മുമ്പ് വ്യതിചലിച്ചു.ഒരു പരിണാമ പുതുമയിൽ നിന്നുള്ള ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്ഷൻ പ്രൊഫൈലുകൾ, ഇലകൾ പോലെയുള്ള അനുബന്ധങ്ങൾ, സാധാരണയായി ഫിൻ വികസനത്തിൽ ഉൾപ്പെട്ടിരിക്കുന്ന ഒരു കൂട്ടം ജീനുകൾ സഹകരിച്ച്, ടിഷ്യു നന്നാക്കാനും പ്രതിരോധ പ്രതിരോധ ജീനുകൾക്കും ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെ സമ്പുഷ്ടീകരണവും കാണിക്കുന്നു.സാധാരണ സീഡ്രാഗണും അലിഗേറ്റർ പൈപ്പ് ഫിഷും പങ്കിടുന്ന പുരുഷ-നിർദ്ദിഷ്ട amhr2y ജീനിനെ എൻകോഡിംഗ് ചെയ്യുന്ന ഒരു ലൈംഗിക-നിർണ്ണയ ലോക്കസ് തിരിച്ചറിഞ്ഞു.ഈ പ്രോജക്റ്റ് അഡാപ്റ്റീവ് പരിണാമത്തിന്റെ പഠനങ്ങൾക്ക് നിർണായക തെളിവുകൾ നൽകി.
പോസ്റ്റ് സമയം: സെപ്റ്റംബർ-19-2022