BMKCloud Log in
条形banner-၀၃

သတင်း

Biomarker Technologies 31 အောင်မြင်ကြောင်းသက်သေဒီနိုဗို2021 ခုနှစ်တွင် Genome သုတေသန

2021 ခုနှစ်တွင် BMKGENE သည် စုစုပေါင်းသက်ရောက်မှုအချက်ပေါင်း 320 ကျော်ရှိသည့် De novo genome သုတေသန 31 ခုကို အောင်မြင်စွာ ထုတ်ဝေနိုင်ခဲ့သည်။ ဆောင်းပါး 15 ခုကို ပူးတွဲရေးသားခဲ့ပြီး 4 ခုကို BMKGENE မှ ပထမဆုံးစာရေးဆရာများအဖြစ် ပူးတွဲရေးသားခဲ့သည်။

သက္ကရာဇ် 2022 ခုနှစ်နောက်ပိုင်းတွင် "Natural Genetics" နှင့် "Molecular Plant" ဂျာနယ်တွင် သုတေသနဆောင်းပါး နှစ်ခု ထုတ်ဝေခဲ့ပြီးဖြစ်သည်။၎င်းတို့သည် "မျိုးရိုးဗီဇကွဲပြားသော lychee မျိုးရိုးဗီဇမှ ကွဲပြားသော မျိုးရိုးဗီဇနှစ်ခုသည် အစောပိုင်းနှင့် နှောင်းပိုင်းမျိုးရိုးများများအတွက် သီးခြားပြည်တွင်းစိုက်ပျိုးခြင်းအစီအစဉ်များကို အကြံပြုသည်" (Lychee genome research, College of Horticulture, South China Agricultural university, and scientific collaborators, published on Natural Genetics. ) နှင့် "Aegilops ၏ Sitopsis မျိုးစိတ်ငါးခု၏ ဂျီနိုမ်အစီအမံများနှင့် polyploid ဂျုံ B-subgenome ၏မူလအစ" (Five Sitopsis မျိုးစိတ်ဂျီနိုမ်၊ Northeast Normal University မှ ပရော်ဖက်ဆာ Bao Liu ၏ သုတေသနအဖွဲ့မှ ဆောင်ရွက်သော။)။ဤဆောင်းပါးနှစ်ခုကိုလည်း သုံးသပ်ပြီး ကျွန်ုပ်တို့၏စာဖတ်သူများထံ မျှဝေပါမည်။

ယခု၊ BMK နှင့် ကျွန်ုပ်တို့၏ ပူးပေါင်းဆောင်ရွက်ထားသော အဆောက်အဦများမှ ထုတ်ဝေသည့် 2021 ခုနှစ်တွင်ထုတ်ဝေသည့် အကောင်းဆုံးသုတေသနဆောင်းပါးများကို တစ်ချက်ကြည့်လိုက်ရအောင်။

Plant Genome — မျိုးစိတ်ပေါင်းများစွာအပေါ် ဖြတ်ကျော်မှုများ။

1. အရည်အသွေးမြင့် ဂျီနိုမ်စည်းဝေးပွဲသည် ကောက်မျိုးရိုးဗီဇလက္ခဏာများနှင့် စိုက်ပျိုးရေးဆိုင်ရာ အရေးကြီးသော ဗီဇများကို မီးမောင်းထိုးပြသည်

ပူးပေါင်းဆောင်ရွက်သည့် အထောက်အကူပြုပစ္စည်း- Henan စိုက်ပျိုးရေးတက္ကသိုလ်

ဂျာနယ်- သဘာဝမျိုးရိုးဗီဇ

သက်ရောက်မှုအချက်- ၃၈.၃၁

ဤပရောဂျက်တွင် အထက်တန်းစား တရုတ်ကောက်မျိုးမျိုးဖြစ်သော Weining rye ၏ ဂျီနိုမီကို စီစဥ်ထားသည်။စုစည်းထားသော contigs (7.74 Gb) သည် ခန့်မှန်းထားသော ဂျီနိုမ်အရွယ်အစား (7.86 Gb) ၏ 98.47% နှင့် contigs များ၏ 93.67% (7.25 Gb) သည် ခရိုမိုဆုန်း ခုနစ်ခုအတွက် သတ်မှတ်ထားသည်။ထပ်တလဲလဲဒြပ်စင်များသည် စုစည်းထားသော ဂျီနိုမ်၏ 90.31% ဖြင့် ဖွဲ့စည်းထားသည်။Weining စည်းဝေးပွဲ၏ နောက်ထပ်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာချက်များသည် ဂျီနိုမ်ကျယ်ပြန့်သော ဗီဇပွားမှုများနှင့် ဓာတ်ဇီဝပေါင်းစပ်မှုဆိုင်ရာ မျိုးဗီဇများ၊ ရှုပ်ထွေးသော ပရိုလာမင် loci ၏ ရုပ်ပိုင်းဆိုင်ရာအဖွဲ့အစည်း၊ မျိုးရိုးဗီဇဖော်ပြမှုဆိုင်ရာ အစောပိုင်းဦးခေါင်းစရိုက်လက္ခဏာများနှင့် ခရိုမိုဆိုမ်ဒေသများနှင့် ကောက်ပင်ရှိနေရာများအပေါ်တွင် ၎င်းတို့၏အကျိုးသက်ရောက်မှုများကို အလင်းပြခဲ့သည်။ဤဂျီနိုမ်အစီအစဥ်သည် ကောက်နှင့်ဆက်စပ်သီးနှံများတွင် မျိုးဗီဇနှင့် မျိုးပွားခြင်းဆိုင်ရာလေ့လာမှုများကို အရှိန်မြှင့်ရန် ကတိပြုပါသည်။

2.Rose without prickle - အစိုဓာတ်ကို လိုက်လျောညီထွေဖြစ်အောင် ချိတ်ဆက်ထားသော မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ ထိုးထွင်းသိမြင်မှု

ပူးပေါင်းဆောင်ရွက်သော အဆောက်အဦ- ကူမင်းရုက္ခဗေဒသိပ္ပံ၊ တရုတ်သိပ္ပံအကယ်ဒမီ

ဂျာနယ်- အမျိုးသားသိပ္ပံ သုံးသပ်ချက်

သက်ရောက်မှုအချက်- 17.273

ဤပရောဂျက်တွင်၊ 'Basye's Thornless' (BT၊ အစင်းရာမရှိသော Rosa wichuraiana)၊ 'Old Blush' (OB၊ နှင်းဆီအပင်ကို တည်ထောင်သူ မျိုးရိုးဗီဇ)၊ ၎င်းတို့၏ F1 မျိုးစပ်နှင့် BCF1 တို့၏ နမူနာများကို စုဆောင်းခဲ့သည်။ပင်စည်ပေါက်ပွားမှုဆိုင်ရာ မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ ဒြပ်စင်များကို ခွဲခြားသတ်မှတ်ရန် အရည်အသွေးမြင့် ရည်ညွှန်းဂျီနို စည်းဝေးပွဲကို ထုတ်ပေးခဲ့သည်။ဂျီနိုမ်အရွယ်အစား 530.6 Mb ခန့်ရှိသည်။စုစည်းထားသော ဂျီနိုမ်၏ အရည်အသွေးကို စစ်ဆေးရန်၊ မျိုးရိုးဗီဇမြေပုံ နှိုင်းယှဉ်ခြင်း၊ BUSCO၊ NGS ကဲ့သို့ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုများ၊ ပြန်လည်စုစည်းမှုကို ဖတ်ပြသည်၊ OB haplotype နှင့် နှိုင်းယှဉ်ခြင်း၊ အခြေခံအမှားအယွင်းနှုန်း ထိန်းချုပ်မှု စီတန်းခြင်းနှင့် ဂျီနိုမ်ကျယ်ပြန့်သော LTR စည်းဝေးပွဲ အညွှန်းကိန်းတန်ဖိုး စစ်ဆေးခြင်း (LAI=20.03)တို့ကို ပြုလုပ်ခဲ့ပါသည်။ဤသုတေသနသည် ရှုပ်ထွေးသော အမွေဆက်ခံမှုပုံစံနှင့် ပင်စည်ပေါက်ခြင်း၏ စည်းမျဉ်းစည်းကမ်းယန္တရားကို ဖော်ပြပြီး အရေးကြီးသော လက္ခဏာများနှင့် ဆက်စပ်နေသော နှင်းဆီဇီဝဗေဒနှင့် မိုင်းမော်လီကျူး အမှတ်အသားများကို လေ့လာရန် အခြေခံအုတ်မြစ်နှင့် ဆန်းသစ်သောအရင်းအမြစ်များ ပေးဆောင်ထားပါသည်။

3. Cucumis ရှိ Synthesized Allopolyploids ၏ ဂျီနိုမီ တစ်ခုလုံးသည် Allopolyploidization ၏ Genome Evolution အတွက် ထိုးထွင်းသိမြင်မှုကို ဖော်ထုတ်သည်

ပူးပေါင်းဆောင်ရွက်သော အဆောက်အဦ- Nanjing စိုက်ပျိုးရေးတက္ကသိုလ်

ဂျာနယ်- အဆင့်မြင့်သိပ္ပံ

သက်ရောက်မှုအချက်- 16.801

ဤလေ့လာမှုသည် သခွားသီး (C. sativus၊ 2n = 14) နှင့် ၎င်း၏ရိုင်းမျိုးစိတ် (C. hystrix၊ 2n = 24) နှင့် နောက်ဆက်တွဲ ခရိုမိုဆုမ်းပွားခြင်းကို အသုံးပြု၍ ရရှိသော ပေါင်းစပ်ဖွဲ့စည်းမှုဆိုင်ရာ allotetraploid ၏ အရည်အသွေးမြင့် ဂျီနိုမ်ကို အစီရင်ခံတင်ပြခဲ့သည်၊ အပြည့်အဝပေါင်းစပ်ထားသော ဓာတု allopolyploid။ဂျီနိုအာစည်းဝေးပွဲသည် “PacBio+BioNano+Hi-C+Illumina” စီစီခြင်း၏ အလုပ်အသွားအလာကို အသုံးချကာ ဂျီနိုမ်အရွယ်အစား 530.8Mb နှင့် contig N50 = 6.5Mb ဖြစ်သည်။Reads များကို pseudochromosomes နှင့် subgenomes 19 ခုတွင် သတ်မှတ်ထားသည်။ရလဒ်များက ဂျီနိုမ်ပွားခြင်းထက် hybridization သည် နူကလီးယားနှင့် cp ဂျီနိုမ်နှစ်ခုလုံးတွင် မျိုးဗီဇပြောင်းလဲမှုအများစုကို ဖြစ်စေသည်ဟု ညွှန်ပြခဲ့သည်။ပုံသေ heterozygosity သည် C.×hytivus ကို တိုးမြင့်သော stress adaptation ဖြင့် ပံ့ပိုးပေးသည်ဟု အကြံပြုထားသည်။ရလဒ်များသည် အပင် polyploidy ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်အတွက် ထိုးထွင်းသိမြင်မှုအသစ်များကို ပေးစွမ်းပြီး အနာဂတ်သီးနှံများအတွက် အလားအလာရှိသော မျိုးပွားနည်းဗျူဟာကို ပေးဆောင်ပါသည်။

4.Comparative Genome Analyzes Highlight Transposon Mediated Genome Expansion and 3D Genomic Folding of Cotton ၏ ဆင့်ကဲဗိသုကာလက်ရာ

ပူးပေါင်းဆောင်ရွက်သော အဆောက်အဦ- Huazhong စိုက်ပျိုးရေးတက္ကသိုလ်

ဂျာနယ်- မော်လီကျူးဇီဝဗေဒနှင့် ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်

သက်ရောက်မှုအချက်- 16.242

ဤပရောဂျက်သည် Gossypium rotundifolium (K2၊ genome size = 2.44Gb၊ contigN50 = 5.33Mb)၊ G. arboreum (A2၊ genome size = 1.62Gb၊ contigN50 = 1.62Gb)၊ contigN50 G. raimondii (D5၊ ဂျီနိုဆိုဒ် = 0.75Gb၊ contigN50 = 17.04 Gb)။ဂျီနိုမ်သုံးမျိုးလုံး၏ 99% ကျော်ကို Hi-C မှတဆင့် စုစည်းထားသည်။BUSCO ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု၏ရလဒ်များသည် 92.5%, 93.9% နှင့် 95.4% အသီးသီးရှိသည်။ဤကိန်းဂဏာန်းများအားလုံးသည် စည်းဝေးပွဲသုံးမျိုးရိုးဗီဇများသည် ရည်ညွှန်း-အဆင့်ဖြစ်ကြောင်း ညွှန်ပြသည်။နှိုင်းယှဉ်ထားသော ဂျီနိုမ် ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုများသည် မျိုးရိုးအလိုက် သီးခြား TE ချဲ့ထွင်မှု၏ အသေးစိတ်အချက်အလက်များကို ဂျီနိုမ်အရွယ်အစား ကွဲပြားမှုများကို ပံ့ပိုးပေးပါသည်။ဤလေ့လာမှုသည် အပင်များတွင် အဆင့်မြင့် chromatin ဖွဲ့စည်းမှု၏ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်တွင် transposon-mediated genome ချဲ့ထွင်မှု၏အခန်းကဏ္ဍကို အလင်းပြသည်။

5.Chromosome-စကေးစုဝေးမှုနှင့် ဇီဝဒြပ်ထုသီးနှံများ၏ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု Miscanthus lutarioriparius ဂျီနိုမ်

ပူးပေါင်းဆောင်ရွက်ထားသည့် အထောက်အကူပစ္စည်းများ- မော်လီကျူး အပင်သိပ္ပံတွင် ထူးချွန်မှုအတွက် CAS စင်တာ

ဂျာနယ်- သဘာဝဆက်သွယ်ရေး

သက်ရောက်မှုအချက်- 14.912

ဤပရောဂျက်သည် Oxford Nanopore sequencing နှင့် Hi-C နည်းပညာများကို ပေါင်းစပ်ခြင်းဖြင့် Miscanthus lutarioriparius ဂျီနိုမ်၏ ခရိုမိုဆုန်းစကေးစည်းဝေးမှုကို အစီရင်ခံခဲ့သည်။2.07Gb တပ်ဆင်မှုသည် 1.71 Mb ၏ contig N50 ဖြင့် ဂျီနိုမ်၏ 96.64% ကို လွှမ်းခြုံထားသည်။စုစုပေါင်း sequences ၏ 94.30% ခန့်ကို pseudochromosomes 19 ခုအဖြစ် ကျောက်ချထားသည်။BAC အစီအစဥ်နှင့် နှိုင်းယှဉ်ခြင်း၊ LAI အကဲဖြတ်ခြင်း၊ BUSCO အကဲဖြတ်ခြင်း၊ NGS ဒေတာဖြင့် ပြန်လည်စုဝေးခြင်း၊ စာသားမှတ်တမ်းဒေတာကို ပြန်လည်စုဝေးခြင်းအားဖြင့်၊ ဂျီနိုမ်အား အရည်အသွေးမြင့်ပြီး အဆက်မပြတ်အဖြစ် အကဲဖြတ်ခဲ့ပါသည်။M. lutarioriparius ၏ Allotetraploid ဇာစ်မြစ်ကို centromeric ဂြိုလ်တုများ ထပ်ခါတလဲလဲသုံးပြီး အတည်ပြုသည်။M. lutarioriparius ၏ ပွားနေသော မျိုးဗီဇများသည် ဖိစီးမှု တုံ့ပြန်မှုနှင့် ပတ်သက်သည့် ဝေါဟာရများသာမက ဆဲလ်နံရံ ဇီဝပေါင်းစပ်မှုဆိုင်ရာ ဝေါဟာရများဖြင့် လုပ်ဆောင်နိုင်စွမ်း ကြွယ်ဝသည်။မျိုးရိုးဗီဇ ထပ်တူများသည် C4 အလင်းပြန်ခြင်းတွင် အခန်းကဏ္ဍတစ်ခုမှ ပါဝင်ပြီး အပူချိန်နိမ့်သောအချိန်တွင် Miscanthus C4 အလင်းပြန်ခြင်းအတွက် အထောက်အကူဖြစ်နိုင်သည်။သုတေသနသည် နှစ်ရှည်ပင်များကို လေ့လာရန်အတွက် အရေးကြီးသော ကိုးကားချက်ဖြစ်သည်။

6. ခရိုမိုဆုန်းအဆင့် Camptotheca acuminata ဂျီနိုမ် စုဝေးမှုသည် camptothecin ဇီဝပေါင်းစပ်မှု၏ ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်ဆိုင်ရာ ဇစ်မြစ်ကို ထိုးထွင်းသိမြင်စေသည်

ပူးပေါင်းဆောင်ရွက်သော အဆောက်အဦ- စီချွမ်တက္ကသိုလ်

ဂျာနယ်- သဘာဝဆက်သွယ်ရေး

သက်ရောက်မှုအချက်- 14.912

ဤပရောဂျက်သည် ဂျီနိုဆိုဒ်အရွယ်အစား 414.95Mb နှင့် N50 1.47Mb ရှိသော အရည်အသွေးမြင့် ခရိုမိုဆုန်းအဆင့် C. acuminata ဂျီနိုမ်စည်းဝေးပွဲကို အစီရင်ခံခဲ့သည်။C. acuminata သည် လွတ်လပ်သော ဂျီနိုမ်တစ်ခုလုံး ထပ်ပွားမှုကို တွေ့ကြုံရပြီး ၎င်းမှရရှိသော မျိုးဗီဇအများအပြားသည် camptothecin biosynthesis နှင့် ဆက်စပ်နေကြောင်း ကျွန်ုပ်တို့တွေ့ရှိခဲ့သည်။LAMT ဗီဇနှင့် SLAS ဗီဇနှစ်ခုလုံး၏ အပြုသဘောဆောင်သော ဆင့်ကဲပြောင်းလဲမှု၊ ထို့ကြောင့် နှစ်ခုစလုံးသည် C. acuminata ရှိ camptothecin biosynthesis အတွက် များစွာအထောက်အကူပြုသည်။ရလဒ်များသည် Secondary metabolite ၏ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်၏မူလအစရှိ မျိုးရိုးဗီဇပြောင်းလဲမှုများကို ဖော်ထုတ်ရာတွင် အရည်အသွေးမြင့် ဂျီနိုမ်စုဝေးမှု၏ အရေးကြီးမှုကို အလေးပေးဖော်ပြခဲ့သည်။

7. Allele-သတ်မှတ်ထားသော ဂျီနိုမ် သည် ပီလောပီနံ ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်တွင် biallelic ကွဲပြားမှုကို ဖော်ပြသည်။

ပူးပေါင်းဆောင်ရွက်ထားသည့် အထောက်အကူပြုပစ္စည်း- တရုတ်အပူပိုင်းစိုက်ပျိုးရေးသိပ္ပံအကယ်ဒမီ

ဂျာနယ်- မော်လီကျူးစက်ရုံ

သက်ရောက်မှုအချက်- 13.162

ဤပရောဂျက်သည် Pacific Biosciences (PacBio) sequencing platform ကို အသုံးပြု၍ contigN50 1.1Mb ဖြင့် ပီလောပီနံအတွက် ရည်ညွှန်းဂျီနိုမ်တစ်ခုကို စုစည်းထားသည်။BUSCO၊ LAI အညွှန်းကိန်းနှင့် သိပ်သည်းဆမြင့်သော မျိုးရိုးဗီဇမြေပုံတို့က အကဲဖြတ်ပြီးနောက်တွင် စုစည်းထားသော ဂျီနိုမ်ကို အကာအကွယ်အဆင့်အဖြစ် အတည်ပြုသည်။မလိုအပ်သော ဒေသများကို ဖော်ထုတ်ခဲ့ပြီး ပိုးမွှားများကို Hi-C လင့်ခ်များကို အသုံးပြုကာ pseudochromosome 18 ခုပေါ်တွင် ကျောက်ချထားသည်။ပီလောပီနံအတွက် အရည်အသွေးမြင့်ပြီး အယ်လီလီများသတ်မှတ်ထားသော ဤဂျီနိုမီသည် တူညီသောခရိုမိုဇုန်းများတွင် ကွဲပြားသော bi-allele များကို ခွဲခြားသတ်မှတ်ရာတွင် အဖိုးတန်ပြီး bi-allele များ၏ ကွဲပြားမှုနှင့် ၎င်းတို့၏ လွှမ်းမိုးမှုဆိုင်ရာ အရင်းခံ ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်ကို စူးစမ်းရှာဖွေနိုင်စေမည့် တန်ဖိုးရှိပါသည်။၎င်းသည် ပီလောပီနံနှင့် အခြားမျိုးကွဲအမြောက်အများရှိသော သီးနှံများတွင် မွေးမြူနည်းဗျူဟာများ တီထွင်ဖန်တီးနိုင်စေရန် ကူညီဆောင်ရွက်ပေးခဲ့ပါသည်။

8. paulownia ကြီးထွားမှုမြန်ဆန်ခြင်းနှင့် Paulownia စုန်းမများ၏တံမြက်စည်းများဖွဲ့စည်းခြင်းဆိုင်ရာ ဂျီနိုအာဆိုင်ရာ ထိုးထွင်းသိမြင်မှုများ

ပူးပေါင်းဆောင်ရွက်သော အထောက်အကူပြုပစ္စည်း- Henan စိုက်ပျိုးရေးတက္ကသိုလ်

ဂျာနယ်- မော်လီကျူးစက်ရုံ

သက်ရောက်မှုအချက်- 13.162

ဤပရောဂျက်သည် အရွယ်အစား 511.6 Mb ရှိသော Paulownia fortunei ၏ အရည်အသွေးမြင့် နူကလီးယား ဂျီနိုအာကို စုစည်းထားပြီး အပိုင်းများ၏ 93.2% ကို pseudochromosomes 20 တွင် ကျောက်ချထားသည်။Paulownia သစ်ပင်များ၏ အလွန်လျင်မြန်သော ကြီးထွားမှုအလေ့အထကို အထောက်အကူပြုစေမည့် C3 ဓါတ်ပုံများပေါင်းစပ်ခြင်းနှင့် crassulacean acid ဇီဝြဖစ်ပျက်မှုလမ်းကြောင်းတို့ကို ပေါင်းစပ်ခြင်းဖြင့် ပိုမိုမြင့်မားသော photosynthetic ထိရောက်မှုကို ရရှိပါသည်။လုပ်ဆောင်မှုဆိုင်ရာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုများနှင့် ပေါင်းစပ်ထားသော PaWB phytoplasma ၏ ဂျီနိုမိုနောက်ဆက်တွဲ စီစစ်မှုသည် PaWB-SAP54 သည် Paulownia PfSPLa နှင့် တိုက်ရိုက် အပြန်အလှန် သက်ရောက်မှုရှိကြောင်း ညွှန်ပြခဲ့ပြီး ၎င်းသည် ubiquitin-mediated လမ်းကြောင်းဖြင့် PfSPLA ၏ ပျက်စီးမှုကို ဖြစ်ပေါ်စေပြီး စုန်းမများ၏ တံမြက်စည်းများ ဖွဲ့စည်းခြင်းကို ဖြစ်ပေါ်စေသည်။အချက်အလက်များသည် paulownias ၏ ဇီဝဗေဒနှင့် PaWB ဖွဲ့စည်းခြင်းအတွက် စည်းမျဉ်းစည်းကမ်းဆိုင်ရာ သိသိသာသာ ထိုးထွင်းသိမြင်မှုကို ပေးပါသည်။

တိရစ္ဆာန်မျိုးရိုးဗီဇ - မျိုးစိတ်ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်၏ နက်နဲသော ထိုးထွင်းသိမြင်မှု

1. Nautilus pompilius ၏ ဂျီနိုမိုသည် မျက်လုံး၏ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်နှင့် ဇီဝတွင်းထွက်ပစ္စည်းများကို တောက်ပစေသည်။

ပူးပေါင်းဆောင်ရွက်သည့် အထောက်အပံ့- တောင်တရုတ်ပင်လယ် သမုဒ္ဒရာဗေဒသိပ္ပံ၊ CAS

ဂျာနယ်- သဘာဝဂေဟဗေဒနှင့် ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်

သက်ရောက်မှုအချက်- 15,462

ဤပရောဂျက်သည် Nautilus pompilius အတွက် ပြီးပြည့်စုံသော ဂျီနိုအာကို တင်ပြသည်။၎င်းတွင် contigN50 = 1.1Mb ရှိသော 730.58Mb ရှိသည့် sephalopods များကြားတွင် သေးငယ်သော ဂျီနိုမ်ပါရှိသည်။BUSCO အကဲဖြတ်မှုရလဒ်သည် 91.31% ဖြစ်သည်။စာသားမှတ်တမ်း၊ ပရိုတီအိုမီ၊ မျိုးရိုးဗီဇနှင့် ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတို့ဖြင့် ပေါင်းစပ်ထားသော ဤဂျီနိုမ်သည် ပင်ပေါက်မျက်လုံးနှင့် ဇီဝသတ္တုဓာတ်သတ္တုတူးဖော်ခြင်းကဲ့သို့သော cephalopod တီထွင်ဆန်းသစ်မှုများအပေါ် အခြေခံအကိုးအကားကို ပေးထားသည်။Hox gene cluster ၏ ပြည့်စုံမှုအပေါ် ပျက်စီးမှုသည် Mollusks ၏ အခွံ ပျောက်ကွယ်သွားခြင်းနှင့် ဆက်စပ်နေနိုင်ကြောင်း သုတေသနပြုချက်များအရ သိရသည်။အရေးကြီးသည်မှာ၊ မျိုးရိုးဗီဇဆုံးရှုံးမှု၊ သီးခြားမျိုးရိုးကျုံ့ခြင်းနှင့် သီးခြားမျိုးရိုးဗီဇများကို ချဲ့ထွင်ခြင်းအပါအဝင် မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ တီထွင်ဆန်းသစ်မှုများသည် nautilus pinhole မျက်လုံး၏ ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်ကို ပုံသွင်းနိုင်ဖွယ်ရှိသည်။nautilus ဂျီနိုမ်သည် ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်အခြေအနေများနှင့် တည်ရှိနေသော cephalopods များကို ပုံသွင်းသည့် မျိုးဗီဇဆိုင်ရာ ဆန်းသစ်တီထွင်မှုများကို ပြန်လည်တည်ဆောက်ရန်အတွက် အဖိုးတန်အရင်းအမြစ်တစ်ခုအဖြစ် ဖွဲ့စည်းထားသည်။

2.Seadragon ဂျီနိုမ်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုသည် ၎င်း၏ phenotype နှင့် လိင်သတ်မှတ်ခြင်းဆိုင်ရာ တည်နေရာကို ထိုးထွင်းသိမြင်စေသည်

ပူးပေါင်းဆောင်ရွက်သည့် အထောက်အပံ့- တောင်တရုတ်ပင်လယ် သမုဒ္ဒရာဗေဒသိပ္ပံ၊ CAS

ဂျာနယ်- သိပ္ပံတိုးတက်မှုများ

သက်ရောက်မှုအချက်- 14.132

ဤပရောဂျက်သည် ဘုံပင်လယ်နဂါး (Phyllopteryx taeniolatus) ၏ အထီးအမနှင့် ဆက်နွယ်ထားသော မျိုးရိုးဗီဇများနှင့် ၎င်း၏ အနီးကပ်ဆက်စပ်မျိုးစိတ်ဖြစ်သည့် မိကျောင်းပိုက်ငါး (Syngnathoides biaculeatus)။Phyllopteryx taeniolatus အတွက် ဂျီနိုအမ် အရွယ်အစားမှာ ~659 Mb (‍♂) နှင့် ~ 663 Mb (‍♀) ဖြစ်ပြီး contigN50 သည် 10.0Mb နှင့် 12.1mb ဖြစ်သည်။Phyllopteryx taeniolatus အတွက် ဂျီနိုမိုအရွယ်အစားသည် 637 Mb (♂) နှင့် ~ 648 Mb (‍♀) ဖြစ်ပြီး contigN50 သည် 18.0Mb နှင့် 21.0Mb ဖြစ်သည်။ဇီဝမျိုးရိုးဗီဇခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုအားဖြင့်၊ ဘုံပင်လယ်နဂါးနှင့် မိလ္လာပိုက်ငါးတို့သည် Syngnathinae ၏ညီမအခွန်ဆောင်ကြပြီး လွန်ခဲ့သော ၂၇.၃ မီလီယံခန့်က ကွဲပြားသွားကြသည်။ဆင့်ကဲပြောင်းလဲမှုအသစ်အဆန်းတစ်ခုဖြစ်သည့် အရွက်ကဲ့သို့သောအဆက်အစပ်များမှ ကူးယူဖော်ပြသည့်ပရိုဖိုင်များသည် ဆူးတောင်များဖွံ့ဖြိုးတိုးတက်မှုတွင် ပါ၀င်လေ့ရှိသော ဗီဇအစုံကို တွဲဖက်ရွေးချယ်ထားပြီး ဖြစ်နိုင်ချေရှိသော တစ်သျှူးများပြုပြင်ခြင်းနှင့် ကိုယ်ခံအားကာကွယ်ရေးဗီဇများအတွက် tran-scripts များ ကြွယ်ဝလာကြောင်းပြသသည်။သာမန် seadragon နှင့် alligator pipefish တို့မှ မျှဝေထားသော အမျိုးသားသီးသန့် amhr2y မျိုးဗီဇကို ကုဒ်သွင်းသည့် သပ်ရပ်သောလိင်-သတ်မှတ်ခြင်းတည်နေရာကို ဖော်ထုတ်တွေ့ရှိခဲ့သည်။ဤပရောဂျက်သည် လိုက်လျောညီထွေရှိသော ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်ကို လေ့လာမှုများအတွက် အရေးကြီးသော အထောက်အထားများ ပေးထားသည်။


တင်ချိန်- စက်တင်ဘာ ၁၉-၂၀၂၂

သင့်ထံ မက်ဆေ့ချ်ပို့ပါ-