page_head_bg

ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ

മെറ്റാജെനോമിക് സീക്വൻസിംഗ് (NGS)

പാരിസ്ഥിതിക മെറ്റാജെനോം, ഹ്യൂമൻ മെറ്റാജെനോം മുതലായ ജീവികളുടെ ഒരു സമ്മിശ്ര സമൂഹത്തിന്റെ മൊത്തം ജനിതക വസ്തുക്കളുടെ ഒരു ശേഖരത്തെയാണ് മെറ്റാജെനോം സൂചിപ്പിക്കുന്നത്. ഇതിൽ കൃഷി ചെയ്യാവുന്നതും കൃഷി ചെയ്യാത്തതുമായ സൂക്ഷ്മാണുക്കളുടെ ജീനോമുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു.പാരിസ്ഥിതിക സാമ്പിളുകളിൽ നിന്ന് വേർതിരിച്ചെടുത്ത മിശ്രിത ജനിതക പദാർത്ഥങ്ങളെ വിശകലനം ചെയ്യാൻ ഉപയോഗിക്കുന്ന ഒരു തന്മാത്രാ ഉപകരണമാണ് മെറ്റാജെനോമിക് സീക്വൻസിംഗ്, ഇത് സ്പീഷിസ് വൈവിധ്യവും സമൃദ്ധിയും, ജനസംഖ്യാ ഘടന, ഫൈലോജെനറ്റിക് ബന്ധം, പ്രവർത്തനപരമായ ജീനുകൾ, പാരിസ്ഥിതിക ഘടകങ്ങളുമായുള്ള പരസ്പര ബന്ധ ശൃംഖല എന്നിവയെക്കുറിച്ചുള്ള വിശദമായ വിവരങ്ങൾ നൽകുന്നു.

പ്ലാറ്റ്ഫോം:ഇല്ലുമിന NovaSeq6000


സേവന വിശദാംശങ്ങൾ

ഡെമോ ഫലങ്ങൾ

കേസ് പഠനം

സേവന നേട്ടങ്ങൾ

Øമൈക്രോബയൽ കമ്മ്യൂണിറ്റി പ്രൊഫൈലിംഗിനായി ഒറ്റപ്പെടുത്തലും കൃഷി-രഹിതവും

Øപാരിസ്ഥിതിക സാമ്പിളുകളിൽ കുറഞ്ഞ സമൃദ്ധിയുള്ള ജീവികളെ കണ്ടെത്തുന്നതിൽ ഉയർന്ന മിഴിവ്

Ø"മെറ്റാ-" എന്ന ആശയം പ്രവർത്തന തലത്തിലും സ്പീഷിസ് തലത്തിലും ജീൻ തലത്തിലും എല്ലാ ജൈവ സവിശേഷതകളെയും സമന്വയിപ്പിക്കുന്നു, ഇത് യാഥാർത്ഥ്യത്തോട് കൂടുതൽ അടുക്കുന്ന ഒരു ചലനാത്മക വീക്ഷണത്തെ പ്രതിഫലിപ്പിക്കുന്നു.

Ø10,000-ലധികം സാമ്പിളുകൾ പ്രോസസ്സ് ചെയ്‌തുകൊണ്ട് വൈവിധ്യമാർന്ന സാമ്പിൾ തരങ്ങളിൽ ബിഎംകെ വലിയ അനുഭവം ശേഖരിക്കുന്നു.

സേവന സവിശേഷതകൾ

സീക്വൻസിങ്പ്ലാറ്റ്ഫോം

പുസ്തകശാല

ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന ഡാറ്റ വരുമാനം

കണക്കാക്കിയ തിരിയുന്ന സമയം

ഇല്ലുമിന NovaSeq 6000

PE250

50K/100K/300K ടാഗുകൾ

30 ദിവസം

ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്സ് വിശകലനങ്ങൾ

üഅസംസ്കൃത ഡാറ്റ ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം

üമെറ്റാജെനോം അസംബ്ലി

üഅനാവശ്യമായ ജീൻ സെറ്റും വ്യാഖ്യാനവും

üജീവിവർഗങ്ങളുടെ വൈവിധ്യ വിശകലനം

üജനിതക പ്രവർത്തന വൈവിധ്യ വിശകലനം

üഇന്റർ ഗ്രൂപ്പ് വിശകലനം

üപരീക്ഷണാത്മക ഘടകങ്ങൾക്കെതിരായ അസോസിയേഷൻ വിശകലനം

2

സാമ്പിൾ ആവശ്യകതകളും ഡെലിവറിയും

സാമ്പിൾ ആവശ്യകതകൾ:

വേണ്ടിഡിഎൻഎ എക്സ്ട്രാക്റ്റുകൾ:

സാമ്പിൾ തരം

തുക

ഏകാഗ്രത

ശുദ്ധി

ഡിഎൻഎ എക്സ്ട്രാക്റ്റുകൾ

> 30 ng

> 1 ng/μl

OD260/280= 1.6-2.5

പാരിസ്ഥിതിക സാമ്പിളുകൾക്കായി:

സാമ്പിൾ തരം

ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന സാമ്പിൾ നടപടിക്രമം

മണ്ണ്

സാമ്പിൾ തുക: ഏകദേശം.5 ഗ്രാം;ശേഷിക്കുന്ന വാടിയ പദാർത്ഥം ഉപരിതലത്തിൽ നിന്ന് നീക്കം ചെയ്യേണ്ടതുണ്ട്;വലിയ കഷണങ്ങൾ പൊടിക്കുക, 2 മില്ലീമീറ്റർ ഫിൽട്ടറിലൂടെ കടന്നുപോകുക;റിസർവേഷനായി അണുവിമുക്തമായ ഇപി-ട്യൂബിലോ സൈറോട്യൂബിലോ അലിക്വോട്ട് സാമ്പിളുകൾ.

മലം

സാമ്പിൾ തുക: ഏകദേശം.5 ഗ്രാം;റിസർവേഷനായി അണുവിമുക്തമായ EP-ട്യൂബിലോ ക്രയോട്യൂബിലോ അലിക്വോട്ട് സാമ്പിളുകൾ ശേഖരിക്കുകയും ശേഖരിക്കുകയും ചെയ്യുക.

കുടൽ ഉള്ളടക്കം

അസെപ്റ്റിക് അവസ്ഥയിൽ സാമ്പിളുകൾ പ്രോസസ്സ് ചെയ്യേണ്ടതുണ്ട്.പിബിഎസ് ഉപയോഗിച്ച് ശേഖരിച്ച ടിഷ്യു കഴുകുക;PBS സെൻട്രിഫ്യൂജ് ചെയ്ത് EP-ട്യൂബുകളിൽ അവശിഷ്ടം ശേഖരിക്കുക.

ചെളി

സാമ്പിൾ തുക: ഏകദേശം.5 ഗ്രാം;റിസർവേഷനായി അണുവിമുക്തമായ ഇപി-ട്യൂബിലോ ക്രയോട്യൂബിലോ അലിക്വോട്ട് സ്ലഡ്ജ് സാമ്പിൾ ശേഖരിക്കുക

ജലാശയം

ടാപ്പ് വെള്ളം, കിണർ വെള്ളം മുതലായവ പരിമിതമായ അളവിൽ സൂക്ഷ്മജീവികളുള്ള സാമ്പിളിനായി, കുറഞ്ഞത് 1 ലിറ്റർ വെള്ളമെങ്കിലും ശേഖരിച്ച് 0.22 μm ഫിൽട്ടറിലൂടെ കടന്നുപോകുക.അണുവിമുക്തമായ ട്യൂബിൽ മെംബ്രൺ സൂക്ഷിക്കുക.

തൊലി

അണുവിമുക്തമായ കോട്ടൺ സ്വാബ് അല്ലെങ്കിൽ സർജിക്കൽ ബ്ലേഡ് ഉപയോഗിച്ച് ചർമ്മത്തിന്റെ ഉപരിതലം ശ്രദ്ധാപൂർവ്വം ചുരണ്ടുക, അണുവിമുക്തമായ ട്യൂബിൽ വയ്ക്കുക.

ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന സാമ്പിൾ ഡെലിവറി

സാമ്പിളുകൾ ദ്രവ നൈട്രജനിൽ 3-4 മണിക്കൂർ ഫ്രീസ് ചെയ്ത് ലിക്വിഡ് നൈട്രജനിലോ -80 ഡിഗ്രിയിലോ ദീർഘകാല റിസർവേഷനിൽ സൂക്ഷിക്കുക.ഡ്രൈ-ഐസ് ഉള്ള സാമ്പിൾ ഷിപ്പിംഗ് ആവശ്യമാണ്.

സർവീസ് വർക്ക് ഫ്ലോ

logo_02

സാമ്പിൾ ഡെലിവറി

logo_04

ലൈബ്രറി നിർമ്മാണം

logo_05

സീക്വൻസിങ്

logo_06

ഡാറ്റ വിശകലനം

logo_07

വിൽപ്പനാനന്തര സേവനങ്ങൾ


  • മുമ്പത്തെ:
  • അടുത്തത്:

  • 1. ഹിസ്റ്റോഗ്രാം: സ്പീഷീസ് ഡിസ്ട്രിബ്യൂഷൻ

    3

    2.കെഇജിജി ഉപാപചയ പാതകളിലേക്ക് വ്യാഖ്യാനിച്ച ഫങ്ഷണൽ ജീനുകൾ

    4

    3. ഹീറ്റ് മാപ്പ്: ആപേക്ഷിക ജീൻ സമൃദ്ധിയെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ഡിഫറൻഷ്യൽ ഫംഗ്ഷനുകൾ54. CARD ആൻറിബയോട്ടിക് പ്രതിരോധ ജീനുകളുടെ സർക്കോസ്

    6

    ബിഎംകെ കേസ്

    ആൻറിബയോട്ടിക് റെസിസ്റ്റൻസ് ജീനുകളുടെയും ബാക്‌ടീരിയൽ രോഗാണുക്കളുടെയും മണ്ണ്-കണ്ടൽക്കാടിന്റെ വേരുകൾ തുടർച്ചയിൽ വ്യാപിക്കുന്നു

    പ്രസിദ്ധീകരിച്ചത്:ജേണൽ ഓഫ് ഹാസാർഡസ് മെറ്റീരിയൽസ്, 2021

    ക്രമപ്പെടുത്തൽ തന്ത്രം:

    മെറ്റീരിയലുകൾ: കണ്ടൽക്കാടിന്റെ വേരുകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട നാല് ശകലങ്ങളുടെ ഡിഎൻഎ എക്സ്ട്രാക്‌റ്റുകൾ: നടാത്ത മണ്ണ്, റൈസോസ്ഫിയർ, എപ്പിസ്ഫിയർ, എൻഡോസ്ഫിയർ കമ്പാർട്ടുമെന്റുകൾ
    പ്ലാറ്റ്ഫോം: ഇല്ലുമിന ഹൈസെക് 2500
    ലക്ഷ്യങ്ങൾ: മെറ്റാജെനോം
    16S rRNA ജീൻ V3-V4 മേഖല

    പ്രധാന ഫലങ്ങൾ

    മണ്ണിൽ നിന്ന് ചെടികളിലേക്ക് ആന്റിബയോട്ടിക് റെസിസ്റ്റൻസ് ജീനുകളുടെ (ARGs) വ്യാപനം പഠിക്കുന്നതിനായി കണ്ടൽ ചെടികളുടെ മണ്ണ്-വേരു തുടർച്ചയിൽ മെറ്റാജെനോമിക് സീക്വൻസിംഗും മെറ്റാബാർകോഡിംഗ് പ്രൊഫൈലിംഗും പ്രോസസ്സ് ചെയ്തു.91.4% ആൻറിബയോട്ടിക് പ്രതിരോധ ജീനുകൾ മുകളിൽ സൂചിപ്പിച്ച നാല് മണ്ണ് കമ്പാർട്ടുമെന്റുകളിലും സാധാരണയായി തിരിച്ചറിഞ്ഞിട്ടുണ്ടെന്ന് മെറ്റാജെനോമിക് ഡാറ്റ വെളിപ്പെടുത്തി, ഇത് തുടർച്ചയായ ഫാഷൻ കാണിക്കുന്നു.16S rRNA ആംപ്ലിക്കൺ സീക്വൻസിംഗ് 346 സ്പീഷീസുകളെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്ന 29,285 സീക്വൻസുകൾ സൃഷ്ടിച്ചു.ആംപ്ലിക്കൺ സീക്വൻസിംഗിലൂടെ സ്പീഷീസ് പ്രൊഫൈലിങ്ങുമായി സംയോജിപ്പിച്ച്, ഈ വ്യാപനം റൂട്ട്-അസോസിയേറ്റഡ് മൈക്രോബയോട്ടയിൽ നിന്ന് സ്വതന്ത്രമാണെന്ന് കണ്ടെത്തി, എന്നിരുന്നാലും, ജനിതക മൂലകങ്ങളുടെ മൊബൈൽ വഴി ഇത് സുഗമമാക്കാം.ഈ പഠനം മണ്ണിൽ നിന്ന് ചെടികളിലേക്ക് പരസ്‌പരബന്ധിതമായ മണ്ണ്-വേരു തുടർച്ചയിലൂടെ ARG-കളും രോഗാണുക്കളും ഒഴുകുന്നത് തിരിച്ചറിഞ്ഞു.

    റഫറൻസ്

    വാങ്, സി., ഹു, ആർ., സ്ട്രോങ്, പി.ജെ, ഷുവാങ്, ഡബ്ല്യു., & ഷു, എൽ.(2020).ആൻറിബയോട്ടിക് റെസിസ്റ്റൻസ് ജീനുകളുടെയും ബാക്‌ടീരിയൽ രോഗാണുക്കളുടെയും മണ്ണിൽ-കണ്ടൽക്കാടിന്റെ വേരുകളുടെ തുടർച്ചയായി വ്യാപനം.ജേണൽ ഓഫ് ഹാസാർഡസ് മെറ്റീരിയൽസ്, 408, 124985.

    ഒരു ഉദ്ധരണി എടുക്കൂ

    നിങ്ങളുടെ സന്ദേശം ഇവിടെ എഴുതി ഞങ്ങൾക്ക് അയയ്ക്കുക

    നിങ്ങളുടെ സന്ദേശം ഞങ്ങൾക്ക് അയക്കുക: