ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ

1. ഹിസ്റ്റോഗ്രാം: സ്പീഷീസ് ഡിസ്ട്രിബ്യൂഷൻ

2.കെഇജിജി ഉപാപചയ പാതകളിലേക്ക് വ്യാഖ്യാനിച്ച ഫങ്ഷണൽ ജീനുകൾ

3. ഹീറ്റ് മാപ്പ്: ആപേക്ഷിക ജീൻ സമൃദ്ധിയെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ഡിഫറൻഷ്യൽ ഫംഗ്ഷനുകൾ4. CARD ആൻറിബയോട്ടിക് പ്രതിരോധ ജീനുകളുടെ സർക്കോസ്

ബിഎംകെ കേസ്

ആൻറിബയോട്ടിക് റെസിസ്റ്റൻസ് ജീനുകളുടെയും ബാക്‌ടീരിയൽ രോഗാണുക്കളുടെയും മണ്ണ്-കണ്ടൽക്കാടിന്റെ വേരുകൾ തുടർച്ചയിൽ വ്യാപിക്കുന്നു

പ്രസിദ്ധീകരിച്ചത്:ജേണൽ ഓഫ് ഹാസാർഡസ് മെറ്റീരിയൽസ്, 2021

ക്രമപ്പെടുത്തൽ തന്ത്രം:

മെറ്റീരിയലുകൾ: കണ്ടൽക്കാടിന്റെ വേരുകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട നാല് ശകലങ്ങളുടെ ഡിഎൻഎ എക്സ്ട്രാക്‌റ്റുകൾ: നടാത്ത മണ്ണ്, റൈസോസ്ഫിയർ, എപ്പിസ്ഫിയർ, എൻഡോസ്ഫിയർ കമ്പാർട്ടുമെന്റുകൾ
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina HiSeq 2500
ലക്ഷ്യങ്ങൾ: മെറ്റാജെനോം
16S rRNA ജീൻ V3-V4 മേഖല

പ്രധാന ഫലങ്ങൾ

മണ്ണിൽ നിന്ന് ചെടികളിലേക്ക് ആന്റിബയോട്ടിക് റെസിസ്റ്റൻസ് ജീനുകളുടെ (എആർജി) വ്യാപനം പഠിക്കുന്നതിനായി കണ്ടൽ ചെടികളുടെ മണ്ണ്-വേരു തുടർച്ചയെക്കുറിച്ചുള്ള മെറ്റാജെനോമിക് സീക്വൻസിംഗും മെറ്റാബാർകോഡിംഗ് പ്രൊഫൈലിംഗും പ്രോസസ്സ് ചെയ്തു.91.4% ആൻറിബയോട്ടിക് പ്രതിരോധ ജീനുകൾ മുകളിൽ സൂചിപ്പിച്ച നാല് മണ്ണ് കമ്പാർട്ടുമെന്റുകളിലും സാധാരണയായി തിരിച്ചറിഞ്ഞിട്ടുണ്ടെന്ന് മെറ്റാജെനോമിക് ഡാറ്റ വെളിപ്പെടുത്തി, ഇത് തുടർച്ചയായ ഫാഷൻ കാണിക്കുന്നു.16S rRNA ആംപ്ലിക്കൺ സീക്വൻസിംഗ് 346 സ്പീഷീസുകളെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്ന 29,285 സീക്വൻസുകൾ സൃഷ്ടിച്ചു.ആംപ്ലിക്കൺ സീക്വൻസിംഗിലൂടെ സ്പീഷീസ് പ്രൊഫൈലിങ്ങുമായി സംയോജിപ്പിച്ച്, ഈ വ്യാപനം റൂട്ട്-അസോസിയേറ്റഡ് മൈക്രോബയോട്ടയിൽ നിന്ന് സ്വതന്ത്രമാണെന്ന് കണ്ടെത്തി, എന്നിരുന്നാലും, ജനിതക മൂലകങ്ങളുടെ മൊബൈൽ വഴി ഇത് സുഗമമാക്കാം.ഈ പഠനം മണ്ണിൽ നിന്ന് ചെടികളിലേക്ക് പരസ്‌പരബന്ധിതമായ മണ്ണ്-വേരു തുടർച്ചയിലൂടെ ARG-കളും രോഗാണുക്കളും ഒഴുകുന്നത് തിരിച്ചറിഞ്ഞു.

റഫറൻസ്

വാങ്, സി., ഹു, ആർ., സ്ട്രോങ്, പി.ജെ, ഷുവാങ്, ഡബ്ല്യു., & ഷു, എൽ.(2020).ആൻറിബയോട്ടിക് റെസിസ്റ്റൻസ് ജീനുകളുടെയും ബാക്‌ടീരിയൽ രോഗാണുക്കളുടെയും മണ്ണിൽ-കണ്ടൽക്കാടിന്റെ വേരുകളുടെ തുടർച്ചയായി വ്യാപനം.അപകടകരമായ വസ്തുക്കളുടെ ജേണൽ, 408, 124985.