ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ

*ഇവിടെ കാണിച്ചിരിക്കുന്ന ഡെമോ ഫലങ്ങളെല്ലാം ബയോമാർക്കർ ടെക്നോളജീസ് ഉപയോഗിച്ച് പ്രസിദ്ധീകരിച്ച ജീനോമുകളിൽ നിന്നുള്ളതാണ്

1. ക്രോമസോം ലെവൽ ജീനോം അസംബ്ലിയിലെ സർക്കോസ്ജി. റൊട്ടണ്ടിഫോളിയംനാനോപോർ സീക്വൻസിങ് പ്ലാറ്റ്‌ഫോം വഴി

വാങ് എം തുടങ്ങിയവർ.,തന്മാത്രാ ജീവശാസ്ത്രവും പരിണാമവും, 2021 

2. വെയ്നിംഗ് റൈ ജീനോം അസംബ്ലിയുടെയും വ്യാഖ്യാനത്തിന്റെയും സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ

ലി ജി തുടങ്ങിയവർ.,പ്രകൃതി ജനിതകശാസ്ത്രം, 2021

3.ജീൻ പ്രവചനംസെച്ചിയം എഡ്യൂൾജീനോം, മൂന്ന് പ്രവചന രീതികളിൽ നിന്ന് ഉരുത്തിരിഞ്ഞത്:ഡി നോവോപ്രവചനം, ഹോമോളജി അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള പ്രവചനം, RNA-Seq ഡാറ്റ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള പ്രവചനം

ഫു എ et al.,ഹോർട്ടികൾച്ചർ ഗവേഷണം, 2021

4.മൂന്ന് കോട്ടൺ ജീനോമുകളിലെ കേടുപാടുകൾ കൂടാതെയുള്ള നീണ്ട ടെർമിനൽ ആവർത്തനങ്ങളെ തിരിച്ചറിയൽ

വാങ് എം തുടങ്ങിയവർ.,തന്മാത്രാ ജീവശാസ്ത്രവും പരിണാമവും, 2021

5.Hi-C ഹീറ്റ് മാപ്പ്സി.അക്കുമിനാറ്റജീനോം-വൈഡ് ഓൾ-ബൈ-എല്ലാ ഇടപെടലുകളും കാണിക്കുന്നു.ഹൈ-സി ഇടപെടലുകളുടെ തീവ്രത കോണ്ടിഗുകൾ തമ്മിലുള്ള രേഖീയ ദൂരത്തിന് ആനുപാതികമാണ്.ഈ ഹീറ്റ് മാപ്പിലെ ഒരു വൃത്തിയുള്ള നേർരേഖ ക്രോമസോമുകളിലെ കോണ്ടിഗുകളുടെ വളരെ കൃത്യമായ ആങ്കറിംഗ് സൂചിപ്പിക്കുന്നു.(കോണ്ടിഗ് ആങ്കറിംഗ് അനുപാതം: 96.03%)

kang M et al.,പ്രകൃതി ആശയവിനിമയം,2021

ബിഎംകെ കേസ്

ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള ജീനോം അസംബ്ലി റൈ ജീനോമിക് സവിശേഷതകളും കാർഷിക പ്രാധാന്യമുള്ള ജീനുകളും എടുത്തുകാണിക്കുന്നു

പ്രസിദ്ധീകരിച്ചത്: പ്രകൃതി ജനിതകശാസ്ത്രം, 2021

ക്രമപ്പെടുത്തൽ തന്ത്രം:

ജീനോം അസംബ്ലി: 20 kb ലൈബ്രറിയുള്ള PacBio CLR മോഡ് (497 Gb, ഏകദേശം 63×)
ക്രമം തിരുത്തൽ: ഇല്ലുമിന പ്ലാറ്റ്‌ഫോമിൽ 270 ബിപി ഡിഎൻഎ ലൈബ്രറി (430 ജിബി, ഏകദേശം 54×) ഉള്ള എൻജിഎസ്
കോണ്ടിഗ്സ് ആങ്കറിംഗ്: ഇല്ലുമിന പ്ലാറ്റ്‌ഫോമിലെ ഹൈ-സി ലൈബ്രറി (560 ജിബി, ഏകദേശം 71×)
ഒപ്റ്റിക്കൽ മാപ്പ്: (779.55 Gb, ഏകദേശം 99×) Bionano Irys-ൽ

പ്രധാന ഫലങ്ങൾ

1.വെയ്നിംഗ് റൈ ജീനോമിന്റെ ഒരു അസംബ്ലി മൊത്തം 7.74 ജിബി (ഫ്ലോ സൈറ്റോമെട്രി പ്രകാരം കണക്കാക്കിയ ജീനോം വലുപ്പത്തിന്റെ 98.74%) ഉപയോഗിച്ച് പ്രസിദ്ധീകരിച്ചു.ഈ അസംബ്ലിയുടെ സ്കഫോൾഡ് N50 1.04 Gb നേടി.93.67% കോണ്ടിഗുകളും 7 വ്യാജ ക്രോമസോമുകളിൽ വിജയകരമായി നങ്കൂരമിട്ടു.ഈ അസംബ്ലിയെ ലിങ്കേജ് മാപ്പ്, LAI, BUSCO എന്നിവ ഉപയോഗിച്ച് വിലയിരുത്തി, ഇത് എല്ലാ മൂല്യനിർണ്ണയങ്ങളിലും ഉയർന്ന സ്കോറുകൾക്ക് കാരണമായി.

2. താരതമ്യ ജീനോമിക്സ്, ജനിതക ലിങ്കേജ് മാപ്പ്, ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് പഠനങ്ങൾ എന്നിവയെക്കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ പഠനങ്ങൾ ഈ ജീനോമിന്റെ അടിസ്ഥാനത്തിൽ നടത്തി.ജീനോം-വൈഡ് ജീൻ ഡ്യൂപ്ലിക്കേഷനുകളും അന്നജം ബയോസിന്തസിസ് ജീനുകളിൽ അവയുടെ സ്വാധീനവും ഉൾപ്പെടെയുള്ള ജീനോമിക് സവിശേഷതകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട സ്വഭാവസവിശേഷതകളുടെ ഒരു പരമ്പര വെളിപ്പെടുത്തി;സങ്കീർണ്ണമായ പ്രോലാമിൻ ലോക്കിയുടെ ഭൗതിക ഓർഗനൈസേഷൻ, ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ സവിശേഷതകൾ, ആദ്യകാല തലക്കെട്ട് സ്വഭാവവും പുട്ടേറ്റീവ് ഗാർഹികവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ക്രോമസോം പ്രദേശങ്ങളും റൈയിലെ ലോക്കിയും.

വെയ്നിംഗ് റൈ ജീനോമിന്റെ ജനിതക സവിശേഷതകളെക്കുറിച്ചുള്ള സർക്കോസ് ഡയഗ്രം

റൈ ജീനോമിന്റെ പരിണാമപരവും ക്രോമസോം സിന്റനി വിശകലനവും