മെറ്റാജെനോമിക്സ് (NGS)

സങ്കീർണ്ണമായ സാമ്പിളുകളിൽ നിന്ന് ഡിഎൻഎ നേരിട്ട് ക്രമീകരിച്ചുകൊണ്ട് മൈക്രോബയോമുകളെ പഠിക്കുന്നതിനുള്ള ഒരു ജനപ്രിയ ഉപകരണമാണ് ഷോട്ട്ഗൺ മെറ്റാജെനോമിക്സ് വിത്ത് ഇല്ലുമിന. ബിഎംകെക്ലൗഡ് മെറ്റാജെനോമിക് (എൻജിഎസ്) പൈപ്പ്‌ലൈൻ ആരംഭിക്കുന്നത് ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണവും മെറ്റാജെനോം അസംബ്ലിയും ഉപയോഗിച്ചാണ്, അതിൽ നിന്ന് ജീനുകൾ പ്രവചിക്കുകയും ഒന്നിലധികം ഡാറ്റാബേസുകൾ ഉപയോഗിച്ച് പ്രവർത്തനത്തിനും ടാക്‌സോണമിക്കുമായി വ്യാഖ്യാനിച്ച അനാവശ്യ ഡാറ്റാസെറ്റുകളിലേക്ക് ക്ലസ്റ്റർ ചെയ്യുകയും ചെയ്യുന്നു. ഈ വിവരങ്ങൾ സാമ്പിൾ ടാക്സോണമിക് വൈവിധ്യത്തിലും (ആൽഫ വൈവിധ്യം), സാമ്പിൾ വൈവിധ്യങ്ങൾക്കിടയിലും (ബീറ്റ വൈവിധ്യം) വിശകലനം ചെയ്യാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നു. ഗ്രൂപ്പുകൾ തമ്മിലുള്ള ഡിഫറൻഷ്യൽ വിശകലനം പാരാമെട്രിക്, നോൺ-പാരാമെട്രിക് ടെസ്റ്റുകൾ ഉപയോഗിച്ച് രണ്ട് ഗ്രൂപ്പുകൾക്കിടയിൽ വ്യത്യാസമുള്ള OTU-കളും ജൈവ പ്രവർത്തനങ്ങളും കണ്ടെത്തുന്നു, അതേസമയം പരസ്പരബന്ധ വിശകലനം ഈ വ്യത്യാസങ്ങളെ പാരിസ്ഥിതിക ഘടകങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെടുത്തുന്നു.