റഫറൻസ് ജീനോം ഉള്ള mRNA-seq (NGS).
RNA-seq എന്നത് ജീവശാസ്ത്രത്തിലും വിള ശാസ്ത്രത്തിലും ഉപയോഗിക്കുന്ന ഒരു സ്റ്റാൻഡേർഡ് ഉപകരണമാണ്, ജീനോമുകൾക്കും പ്രോട്ടിയോമുകൾക്കും ഇടയിലുള്ള വിടവ് നികത്തുന്നു. പുതിയ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകൾ കണ്ടെത്തുന്നതിലും ഒരു അസ്സെയിൽ അവയുടെ എക്സ്പ്രഷൻ അളക്കുന്നതിലുമാണ് ഇതിന്റെ ശക്തി. മ്യൂട്ടന്റുകളെ വൈൽഡ്-ടൈപ്പുകളുമായി താരതമ്യം ചെയ്യുക അല്ലെങ്കിൽ നിർദ്ദിഷ്ട സാഹചര്യങ്ങളിൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ വെളിപ്പെടുത്തുക തുടങ്ങിയ വിവിധ സ്വഭാവസവിശേഷതകളുമായോ ഫിനോടൈപ്പുകളുമായോ ബന്ധപ്പെട്ട ജീനുകളിൽ വെളിച്ചം വീശുന്നതിനും താരതമ്യ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക് പഠനങ്ങൾക്കായി ഇത് വ്യാപകമായി ഉപയോഗിക്കുന്നു. BMKCloud mRNA(റഫറൻസ്) APP എക്സ്പ്രഷൻ ക്വാണ്ടിഫിക്കേഷൻ, ഡിഫറൻഷ്യൽ എക്സ്പ്രഷൻ വിശകലനം(DEG), സീക്വൻസ് സ്ട്രക്ചർ വിശകലനങ്ങൾ എന്നിവ mRNA-seq(NGS) ബയോഇൻഫോർമാറ്റിക്സ് പൈപ്പ്ലൈനിലേക്ക് സംയോജിപ്പിക്കുകയും സമാന സോഫ്റ്റ്വെയറിന്റെ ശക്തികൾ സംയോജിപ്പിക്കുകയും സൗകര്യവും ഉപയോക്തൃ സൗഹൃദവും ഉറപ്പാക്കുകയും ചെയ്യുന്നു. ഉപയോക്താക്കൾക്ക് അവരുടെ RNA-seq ഡാറ്റ ക്ലൗഡിലേക്ക് അപ്ലോഡ് ചെയ്യാൻ കഴിയും, അവിടെ ആപ്പ് സമഗ്രവും വൺ-സ്റ്റോപ്പ് ബയോഇൻഫോർമാറ്റിക് വിശകലന പരിഹാരം വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു. കൂടാതെ, ഇത് ഉപഭോക്തൃ അനുഭവത്തിന് മുൻഗണന നൽകുന്നു, ഉപയോക്താക്കളുടെ പ്രത്യേക ആവശ്യങ്ങൾക്കനുസൃതമായി വ്യക്തിഗതമാക്കിയ പ്രവർത്തനങ്ങൾ വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു. ഉപയോക്താക്കൾക്ക് പാരാമീറ്ററുകൾ സജ്ജീകരിക്കാനും പൈപ്പ്ലൈൻ ദൗത്യം സ്വയം സമർപ്പിക്കാനും, സംവേദനാത്മക റിപ്പോർട്ട് പരിശോധിക്കാനും, ഡാറ്റ/ഡയഗ്രമുകൾ കാണാനും, ടാർഗെറ്റ് ജീൻ സെലക്ഷൻ, ഫങ്ഷണൽ ക്ലസ്റ്ററിംഗ്, ഡയഗ്രമിംഗ് മുതലായവ പോലുള്ള ഡാറ്റ മൈനിംഗ് പൂർത്തിയാക്കാനും കഴിയും.
പ്ലാറ്റ്ഫോം:ഇല്ലുമിന, എംജിഐ
തന്ത്രം:ആർഎൻഎ-സെക്
ലേഔട്ട്: പാരീഡ്, ക്ലീൻ-ഡാറ്റ.
ലൈബ്രറി തരം:ഫ്ര-അൺസ്ട്രാൻഡഡ്, ഫ്ര-ഫസ്റ്റ്സ്ട്രാൻഡ് അല്ലെങ്കിൽ ഫ്ര-സെക്കൻഡ്സ്ട്രാൻഡ്
വായന ദൈർഘ്യം:150 ബിപി
ഫയൽ തരം:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz അല്ലെങ്കിൽ *.fq.gz. സിസ്റ്റം.fastq ഫയലുകൾ അവയുടെ ഫയൽ നാമങ്ങൾക്കനുസരിച്ച് യാന്ത്രികമായി ജോടിയാക്കുക,ഉദാ: *_1.fastq, *._2.fastq എന്നിവയുമായി ജോടിയാക്കി.
സാമ്പിളുകളുടെ എണ്ണം:എണ്ണത്തിൽ നിയന്ത്രണങ്ങളൊന്നുമില്ല.സാമ്പിളുകളുടെ എണ്ണം കൂടുന്നതിനനുസരിച്ച് വിശകലന സമയം വർദ്ധിക്കും.സാമ്പിളുകൾ വളരുന്നു.
ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന ഡാറ്റ തുക:ഒരു സാമ്പിളിന് 6G
