-
ജീനോം വൈഡ് അസോസിയേഷൻ അനാലിസിസ്
ജീനോം വൈഡ് അസോസിയേഷൻ പഠനം (GWAS) നിർദ്ദിഷ്ട സ്വഭാവങ്ങളുമായി (ഫിനോടൈപ്പ്) ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്ന ജനിതക വ്യതിയാനങ്ങളെ (ജനിതകരൂപം) തിരിച്ചറിയാൻ ലക്ഷ്യമിടുന്നു.GWAS പഠനം, ജനിതക മാർക്കറുകൾ വലിയൊരു കൂട്ടം വ്യക്തികളുടെ മുഴുവൻ ജീനോമും പരിശോധിക്കുന്നു, കൂടാതെ ജനസംഖ്യാ തലത്തിൽ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്ക് വിശകലനം വഴി ജനിതകമാതൃക-ഫിനോടൈപ്പ് അസോസിയേഷനുകൾ പ്രവചിക്കുന്നു.മനുഷ്യന്റെ രോഗങ്ങളെക്കുറിച്ചുള്ള ഗവേഷണത്തിലും മൃഗങ്ങളുടെയോ സസ്യങ്ങളുടെയോ സങ്കീർണ്ണമായ സ്വഭാവസവിശേഷതകളെക്കുറിച്ചുള്ള പ്രവർത്തനപരമായ ജീൻ ഖനനത്തിലും ഇത് വ്യാപകമായി പ്രയോഗിച്ചു.
-
സിംഗിൾ ന്യൂക്ലിയസ് ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ്
സിംഗിൾ സെൽ ക്യാപ്ചറിംഗിലെ പുരോഗതിയും ഹൈ-ത്രൂപുട്ട് സീക്വൻസിംഗുമായി സംയോജിപ്പിച്ച് വ്യക്തിഗത ലൈബ്രറി നിർമ്മാണ സാങ്കേതികവിദ്യയും സെൽ-ബൈ-സെൽ അടിസ്ഥാനത്തിൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പഠനങ്ങളെ അനുവദിക്കുന്നു.സങ്കീർണ്ണമായ സെൽ പോപ്പുലേഷനുകളിൽ ആഴമേറിയതും പൂർണ്ണവുമായ സിസ്റ്റം വിശകലനം ഇത് പ്രാപ്തമാക്കുന്നു, അതിൽ എല്ലാ കോശങ്ങളുടെയും ശരാശരി എടുത്ത് അവയുടെ വൈവിധ്യത്തെ മറയ്ക്കുന്നത് വലിയതോതിൽ ഒഴിവാക്കുന്നു.
എന്നിരുന്നാലും, ചില കോശങ്ങൾ സിംഗിൾ-സെൽ സസ്പെൻഷനാക്കി മാറ്റാൻ അനുയോജ്യമല്ല, അതിനാൽ മറ്റ് സാമ്പിൾ തയ്യാറാക്കൽ രീതികൾ ആവശ്യമാണ് - ടിഷ്യൂകളിൽ നിന്ന് ന്യൂക്ലിയസ് വേർതിരിച്ചെടുക്കൽ, അതായത്, ടിഷ്യൂകളിൽ നിന്നോ കോശത്തിൽ നിന്നോ ന്യൂക്ലിയസ് നേരിട്ട് വേർതിരിച്ചെടുത്ത് സിംഗിൾ-ന്യൂക്ലിയസ് സസ്പെൻഷനായി തയ്യാറാക്കുന്നു. സെൽ സീക്വൻസിങ്.
BMK 10× ജീനോമിക്സ് ക്രോമിയം TM അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സിംഗിൾ-സെൽ RNA സീക്വൻസിങ് സേവനം നൽകുന്നു.രോഗപ്രതിരോധ കോശ വ്യത്യാസം, ട്യൂമർ വൈവിധ്യം, ടിഷ്യു വികസനം തുടങ്ങിയ രോഗങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട പഠനങ്ങളിൽ ഈ സേവനം വ്യാപകമായി ഉപയോഗിച്ചുവരുന്നു.
സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം ചിപ്പ്: 10× ജീനോമിക്സ്
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq 6000
-
പ്ലാന്റ്/ആനിമൽ ഹോൾ ജീനോം സീക്വൻസിങ്
സിംഗിൾ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് പോളിമോർഫിസം (എസ്എൻപി), ഇൻസെർഷൻ ഡിലീഷൻ (ഇൻഡെൽ), സ്ട്രക്ചർ വേരിയേഷൻ (എസ്വി), കോപ്പി നമ്പർ വേരിയേഷൻ (സിഎൻവി) എന്നിവയുൾപ്പെടെ മുഴുവൻ ജീനോമിലും പൊതുവായതും അപൂർവവുമായ മ്യൂട്ടേഷനുകൾ വെളിപ്പെടുത്താൻ ഡബ്ല്യുജിഎസ് എന്നും അറിയപ്പെടുന്ന ഹോൾ ജീനോം റീ-സീക്വൻസിങ് സാധ്യമാക്കുന്നു. ).എസ്‌എൻ‌പികളേക്കാൾ വ്യതിയാന അടിത്തറയുടെ വലിയൊരു ഭാഗം എസ്‌വികൾ നിർമ്മിക്കുകയും ജീനോമിൽ വലിയ സ്വാധീനം ചെലുത്തുകയും ചെയ്യുന്നു, ഇത് ജീവജാലങ്ങളിൽ കാര്യമായ സ്വാധീനം ചെലുത്തുന്നു.വലിയ ശകലങ്ങളും സങ്കീർണ്ണമായ വ്യതിയാനങ്ങളും കൂടുതൽ കൃത്യമായി തിരിച്ചറിയാൻ ലോംഗ്-റീഡ് റെസീക്വൻസിംഗ് അനുവദിക്കുന്നു, കാരണം ദൈർഘ്യമേറിയ വായനകൾ ടാൻഡം റിപ്പീറ്റുകൾ, ജിസി/എടി സമ്പന്നമായ പ്രദേശങ്ങൾ, ഹൈപ്പർ-വേരിയബിൾ മേഖലകൾ എന്നിവ പോലുള്ള സങ്കീർണ്ണമായ പ്രദേശങ്ങളിൽ ക്രോമസോം ക്രോസ് ചെയ്യുന്നത് വളരെ എളുപ്പമാക്കുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: ഇല്ലുമിന, പാക്ബയോ, നാനോപോർ
-
BMKMANU S1000 സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ്
രോഗപ്രതിരോധ നുഴഞ്ഞുകയറ്റം, ഭ്രൂണ വികസനം തുടങ്ങിയ വിവിധ ജൈവ പ്രക്രിയകളിൽ കോശങ്ങളുടെ സ്പേഷ്യൽ ഓർഗനൈസേഷൻ നിർണായക പങ്ക് വഹിക്കുന്നു. സ്പേഷ്യൽ സ്ഥാനത്തെക്കുറിച്ചുള്ള വിവരങ്ങൾ നിലനിർത്തിക്കൊണ്ട് ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലിംഗ് സൂചിപ്പിക്കുന്ന സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിംഗ്, ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ്-ലെവൽ ടിഷ്യു ആർക്കിടെക്ചറിലേക്ക് മികച്ച ഉൾക്കാഴ്ചകൾ നൽകുന്നു.സാങ്കേതികവിദ്യയുടെ വികാസത്തോടെ, അൾട്രാ ക്ലിയർ ടിഷ്യു രൂപഘടനയും സ്പേഷ്യൽ മോളിക്യുലാർ എക്സ്പ്രഷന്റെ യഥാർത്ഥ ഘടനാപരമായ വ്യത്യാസവും ഉയർന്ന മിഴിവോടെ പഠിക്കേണ്ടതുണ്ട്.BMKGENE സാമ്പിളുകൾ മുതൽ ജീവശാസ്ത്രപരമായ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ വരെ സമഗ്രവും ഒറ്റത്തവണ സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിങ് സേവനം നൽകുന്നു.
വൈവിധ്യമാർന്ന സാമ്പിളുകളിൽ സ്പേഷ്യൽ ഉള്ളടക്കമുള്ള ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈൽ പരിഹരിച്ചുകൊണ്ട് സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് സാങ്കേതികവിദ്യകൾ വൈവിധ്യമാർന്ന ഗവേഷണ രംഗത്ത് പുതിയ കാഴ്ചപ്പാടുകളെ ശക്തിപ്പെടുത്തി.
സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് ചിപ്പ്: BMKMANU S1000
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq 6000
-
10x ജീനോമിക്സ് വിസിയം സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം
വിസിയം സ്പേഷ്യൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ എന്നത് മൊത്തം എംആർഎൻഎയെ അടിസ്ഥാനമാക്കി ടിഷ്യുവിനെ വർഗ്ഗീകരിക്കുന്നതിനുള്ള ഒരു മുഖ്യധാരാ സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് സീക്വൻസിങ് സാങ്കേതികവിദ്യയാണ്.സാധാരണ വികസനം, രോഗ പാത്തോളജി, ക്ലിനിക്കൽ വിവർത്തന ഗവേഷണം എന്നിവയെക്കുറിച്ചുള്ള പുതിയ ഉൾക്കാഴ്ചകൾ കണ്ടെത്തുന്നതിന് മൊർഫോളജിക്കൽ സന്ദർഭം ഉപയോഗിച്ച് മുഴുവൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റും മാപ്പ് ചെയ്യുക.BMKGENE സാമ്പിളുകൾ മുതൽ ജീവശാസ്ത്രപരമായ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ വരെ സമഗ്രവും ഒറ്റത്തവണ സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിങ് സേവനം നൽകുന്നു.
വൈവിധ്യമാർന്ന സാമ്പിളുകളിലെ സ്പേഷ്യൽ ഉള്ളടക്കമുള്ള ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈൽ പരിഹരിച്ചുകൊണ്ട് സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് സാങ്കേതികവിദ്യകൾ വൈവിധ്യമാർന്ന ഗവേഷണ രംഗത്ത് പുതിയ കാഴ്ചപ്പാടുകളെ ശക്തിപ്പെടുത്തി..
സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം ചിപ്പ്: 10x ജീനോമിക്സ് വിസിയം
പ്ലാറ്റ്ഫോം:ഇല്ലുമിന NovaSeq 6000
-
മുഴുനീള mRNA സീക്വൻസിങ്-നാനോപോർ
സമഗ്രമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം വിശകലനത്തിനുള്ള അമൂല്യമായ ഉപകരണമാണ് ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ്.നിസ്സംശയമായും, പരമ്പരാഗത ഹ്രസ്വ-വായന ക്രമം ഇവിടെ നിരവധി സുപ്രധാന വികസനം കൈവരിച്ചു.എന്നിരുന്നാലും, പൂർണ്ണ ദൈർഘ്യമുള്ള ഐസോഫോം ഐഡന്റിഫിക്കേഷനുകൾ, ക്വാണ്ടിഫിക്കേഷൻ, പിസിആർ ബയസ് എന്നിവയിൽ ഇത് പലപ്പോഴും പരിമിതികൾ നേരിടുന്നു.
നാനോപോർ സീക്വൻസിംഗ് മറ്റ് സീക്വൻസിംഗ് പ്ലാറ്റ്‌ഫോമുകളിൽ നിന്ന് സ്വയം വേറിട്ടുനിൽക്കുന്നു, ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ ഡിഎൻഎ സിന്തസിസ് കൂടാതെ നേരിട്ട് വായിക്കുകയും പതിനായിരക്കണക്കിന് കിലോബേസിൽ ദീർഘനേരം വായിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു.ഇത് ഡയറക്ട് റീഡ്-ഔട്ട് ക്രോസിംഗ് ഫുൾ-ലെങ്ത് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകൾക്കും ഐസോഫോം-ലെവൽ പഠനങ്ങളിലെ വെല്ലുവിളികളെ നേരിടാനും പ്രാപ്തമാക്കുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം：നാനോപോർ പ്രൊമെതിഒൻ
പുസ്തകശാല:cDNA-PCR
-
മുഴുനീള mRNA സീക്വൻസിങ് -PacBio
ഡി നോവോമുഴുനീള ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് സീക്വൻസിംഗ്, എന്നും അറിയപ്പെടുന്നുഡി നോവോIso-Seq PacBio സീക്വൻസറിന്റെ റീഡ് ലെങ്ത് പ്രയോജനപ്പെടുത്തുന്നു, ഇത് പൂർണ്ണ ദൈർഘ്യമുള്ള cDNA തന്മാത്രകളെ ഇടവേളകളില്ലാതെ ക്രമപ്പെടുത്തുന്നത് സാധ്യമാക്കുന്നു.ഇത് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് അസംബ്ലി ഘട്ടങ്ങളിൽ ഉണ്ടാകുന്ന പിശകുകൾ പൂർണ്ണമായും ഒഴിവാക്കുകയും ഐസോഫോം-ലെവൽ റെസലൂഷൻ ഉപയോഗിച്ച് യൂണിജീൻ സെറ്റുകൾ നിർമ്മിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു.ഈ യൂണിജീൻ സെറ്റുകൾ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം തലത്തിൽ "റഫറൻസ് ജീനോം" ആയി ശക്തമായ ജനിതക വിവരങ്ങൾ നൽകുന്നു.കൂടാതെ, അടുത്ത തലമുറ സീക്വൻസിങ് ഡാറ്റയുമായി സംയോജിപ്പിച്ച്, ഈ സേവനം ഐസോഫോം-ലെവൽ എക്സ്പ്രഷന്റെ കൃത്യമായ അളവ് ശക്തിപ്പെടുത്തുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: PacBio സീക്വൽ IIലൈബ്രറി: SMRT ബെൽ ലൈബ്രറി -
യൂക്കറിയോട്ടിക് mRNA സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
mRNA സീക്വൻസിംഗ് പ്രത്യേക വ്യവസ്ഥകളിൽ സെല്ലുകളിൽ നിന്ന് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് ചെയ്ത എല്ലാ mRNA-കളുടെയും പ്രൊഫൈലിംഗ് സാധ്യമാക്കുന്നു.ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈൽ, ജീൻ ഘടനകൾ, ചില ജൈവ പ്രക്രിയകളുടെ തന്മാത്രാ സംവിധാനങ്ങൾ എന്നിവ വെളിപ്പെടുത്തുന്നതിനുള്ള ശക്തമായ സാങ്കേതികവിദ്യയാണിത്.ഇന്നുവരെ, അടിസ്ഥാന ഗവേഷണം, ക്ലിനിക്കൽ ഡയഗ്‌നോസ്റ്റിക്‌സ്, ഡ്രഗ് ഡെവലപ്‌മെന്റ് മുതലായവയിൽ mRNA സീക്വൻസിംഗ് വ്യാപകമായി ഉപയോഗിച്ചുവരുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq 6000
-
നോൺ-റഫറൻസ് അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള mRNA സീക്വൻസിംഗ്-ഇല്ലുമിന
ചില പ്രത്യേക ഫംഗ്‌ഷനുകൾ സജീവമാകുന്ന നിശ്ചിത കാലയളവിൽ മെസഞ്ചർ ആർഎൻഎ (എംആർഎൻഎ) ഫോം യൂക്കറിയോട്ട് പിടിച്ചെടുക്കാൻ എംആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ് അടുത്ത തലമുറ സീക്വൻസിംഗ് ടെക്നിക് (എൻജിഎസ്) സ്വീകരിക്കുന്നു.ഏറ്റവും ദൈർഘ്യമേറിയ ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്റ്റിനെ 'യൂണിജീൻ' എന്ന് വിളിക്കുകയും തുടർന്നുള്ള വിശകലനത്തിനുള്ള റഫറൻസ് സീക്വൻസായി ഉപയോഗിക്കുകയും ചെയ്തു, ഇത് റഫറൻസില്ലാതെ സ്പീഷിസിന്റെ തന്മാത്രാ സംവിധാനവും നിയന്ത്രണ ശൃംഖലയും പഠിക്കുന്നതിനുള്ള ഫലപ്രദമായ മാർഗമാണ്.
ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് ഡാറ്റ അസംബ്ലിക്കും യൂണിജീൻ ഫംഗ്ഷണൽ വ്യാഖ്യാനത്തിനും ശേഷം
(1)എസ്എസ്ആർ വിശകലനം, സിഡിഎസ് പ്രവചനം, ജീൻ ഘടന എന്നിവ മുൻകൂട്ടി തയ്യാറാക്കപ്പെടും.
(2) ഓരോ സാമ്പിളിലെയും യൂണിജീൻ എക്സ്പ്രഷന്റെ അളവ് നിർണ്ണയിക്കും.
(3) സാമ്പിളുകൾ (അല്ലെങ്കിൽ ഗ്രൂപ്പുകൾ) തമ്മിലുള്ള വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന യൂണിജീനുകൾ ഏകീകൃത ആവിഷ്കാരത്തെ അടിസ്ഥാനമാക്കി കണ്ടെത്തും
(4) വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന യൂണിജീനുകളുടെ ക്ലസ്റ്ററിംഗ്, പ്രവർത്തനപരമായ വ്യാഖ്യാനം, സമ്പുഷ്ടീകരണ വിശകലനം എന്നിവ നടത്തും
-
ദൈർഘ്യമേറിയ നോൺ-കോഡിംഗ് സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
ലോംഗ് നോൺ-കോഡിംഗ് ആർ‌എൻ‌എകൾ (എൽ‌എൻ‌സി‌ആർ‌എൻ‌എകൾ) 200 എൻ‌ടിയിൽ കൂടുതൽ നീളമുള്ള ഒരു തരം ആർഎൻഎ തന്മാത്രകളാണ്, അവ വളരെ കുറഞ്ഞ കോഡിംഗ് സാധ്യതയാണ്.എൽഎൻസിആർഎൻഎ, നോൺ-കോഡിംഗ് ആർഎൻഎകളിലെ പ്രധാന അംഗമെന്ന നിലയിൽ, പ്രധാനമായും ന്യൂക്ലിയസിലും പ്ലാസ്മയിലും കാണപ്പെടുന്നു.സീക്വൻസിങ് ടെക്‌നോളജിയിലും ബയോ ഇൻഫോർറ്റിക്‌സിലുമുള്ള വികസനം നിരവധി നോവൽ എൽഎൻസിആർഎൻഎകളെ തിരിച്ചറിയാനും ജീവശാസ്ത്രപരമായ പ്രവർത്തനങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെടുത്താനും സഹായിക്കുന്നു.എപിജെനെറ്റിക് റെഗുലേഷൻ, ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ റെഗുലേഷൻ, പോസ്റ്റ്-ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ റെഗുലേഷൻ എന്നിവയിൽ lncRNA വ്യാപകമായി ഉൾപ്പെട്ടിട്ടുണ്ടെന്ന് സഞ്ചിത തെളിവുകൾ സൂചിപ്പിക്കുന്നു.
