Одной из важных садоводческих характеристик, отличающих пупочные апельсины от других распространенных сортов сладких апельсинов, является наличие пупка на плоде.Этот признак также является важным критерием классификации садовых сортов сладкого апельсина.
Клиенты BMKGENE использовали разработанную BMKGENE технологию секвенирования SLAF для проведения исследования под названием «Добывающие гены, связанные с качеством плодов сладких апельсинов, на основе секвенирования специфичных локусных амплифицированных фрагментов.«
Исследование включало секвенирование 240 ресурсов зародышевой плазмы сладкого апельсина с широким генетическим разнообразием и разным географическим происхождением, в результате чего было получено 497,82 МБ данных для короткого чтения.Анализ данных позволил выявить 1 467 968 генотипов SNP по всему геному.С помощью Fst-анализа исследование выявило 6 генов-кандидатов, связанных с наличием пупка, массой плода и титруемой кислотностью, что послужило основой для целенаправленного улучшения сортов сладких апельсинов.
Для крупномасштабного популяционного секвенирования секвенирование специфичных локус-амплифицированных фрагментов (SLAF) является более экономичным и высокоэффективным по сравнению с полногеномным секвенированием (WGS).
Нажмитездесьчтобы узнать больше об этом исследовании.
Время публикации: 05 декабря 2023 г.