Адна важная садовая характарыстыка, якая адрознівае пупковыя апельсіны ад іншых распаўсюджаных гатункаў салодкіх апельсінаў, - гэта наяўнасць пупка на плёне.Гэтая асаблівасць таксама з'яўляецца важным крытэрыем для класіфікацыі садовых гатункаў салодкага апельсіна.
Кліенты BMKGENE выкарыстоўвалі тэхналогію секвеніравання SLAF, якую BMKGENE самастойна распрацавала, каб правесці даследаванне пад назвай “Здабыча генаў, звязаных з якасцю садавіны ў салодкіх апельсінах, на аснове паслядоўнасці фрагментаў узмоцненага локуса.«
Даследаванне ўключала ў сябе секвеніраванне 240 рэсурсаў зародкавай плазмы салодкага апельсіна з шырокім генетычным разнастайнасцю і розным геаграфічным паходжаннем, што прывяло да 497,82 Мб кароткачытаных дадзеных.Аналіз дадзеных даў 1 467 968 генатыпаў SNP па ўсім геному.З дапамогай аналізу Fst даследаванне вызначыла 6 генаў-кандыдатаў, звязаных з наяўнасцю пупка, масай плёну і тытруемай кіслотнасцю, што стала асновай для мэтанакіраванага паляпшэння гатункаў салодкіх апельсінаў.
Для буйнамаштабнага секвенирования папуляцыі секвенирование фрагментаў з узмацненнем канкрэтнага локуса (SLAF) з'яўляецца больш рэнтабельным і высокаэфектыўным у параўнанні з секвенированием цэлага геному (WGS).
Націсніцетуткаб даведацца больш аб гэтым даследаванні.
Час публікацыі: 5 снежня 2023 г