-
Полногеномный анализ ассоциаций
Полногеномное исследование ассоциаций (GWAS) направлено на выявление генетических вариантов (генотипа), связанных с определенными признаками (фенотипом).Исследование GWAS исследует генетические маркеры, охватывающие весь геном большого количества людей, и прогнозирует ассоциации генотип-фенотип с помощью статистического анализа на популяционном уровне.Он широко применяется в исследованиях заболеваний человека и функциональном анализе генов сложных признаков животных или растений.
-
Секвенирование одноядерной РНК
Достижения в области захвата отдельных клеток и техники создания индивидуальных библиотек в сочетании с высокопроизводительным секвенированием позволяют изучать экспрессию генов на поклеточной основе.Это позволяет проводить более глубокий и полный системный анализ сложных популяций клеток, при этом в значительной степени избегая маскировки их гетерогенности путем взятия среднего значения всех клеток.
Однако некоторые клетки не подходят для приготовления одноклеточной суспензии, поэтому необходимы другие методы подготовки проб – экстракция ядра из тканей, то есть ядро непосредственно извлекается из тканей или клеток и готовится в одноядерную суспензию для одноядерной суспензии. секвенирование клеток.
BMK предоставляет 10-кратную услугу секвенирования одноклеточной РНК на основе Genomics ChromiumTM.Эта услуга широко использовалась в исследованиях, связанных с заболеваниями, такими как дифференцировка иммунных клеток, гетерогенность опухолей, развитие тканей и т. д.
Чип пространственного транскриптома: 10× Геномика
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Полногеномное секвенирование растений/животных
Повторное секвенирование всего генома, также известное как WGS, позволяет выявлять как распространенные, так и редкие мутации во всем геноме, включая однонуклеотидный полиморфизм (SNP), делецию вставки (InDel), вариацию структуры (SV) и вариацию числа копий (CNV). ).SV составляют большую часть вариационной базы, чем SNP, и оказывают большее влияние на геном, что оказывает существенное влияние на живые организмы.Повторное секвенирование длинного считывания позволяет более точно идентифицировать большие фрагменты и сложные вариации, поскольку длинные чтения значительно облегчают хромосомный кроссинг в сложных регионах, таких как тандемные повторы, регионы, богатые GC/AT, и гипервариабельные регионы.
Платформа: Illumina, PacBio, Nanopore.
-
Пространственный транскриптом BMKMANU S1000
Пространственная организация клеток играет жизненно важную роль в различных биологических процессах, таких как иммунная инфильтрация, развитие эмбрионов и т. д. Пространственное секвенирование транскриптома, которое показывает профилирование экспрессии генов, сохраняя при этом информацию о пространственном положении, дает большое представление об архитектуре тканей на уровне транскриптома.С развитием технологий необходимо изучать сверхчеткую морфологию тканей и реальные структурные различия пространственной молекулярной экспрессии с более высоким разрешением.BMKGENE предоставляет комплексную универсальную услугу пространственного секвенирования транскриптома, от образцов до биологических данных.
Технологии пространственной транскриптомики открыли новые перспективы в разнообразной области исследований, разрешив профиль экспрессии генов с пространственным содержанием в гетерогенных образцах.
Чип пространственного транскриптома: BMKMANU S1000
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
10 пространственных транскриптомов Genomics Visium
Visium Spatial Gene Expression — это основная технология пространственного секвенирования транскриптома для классификации тканей на основе общей мРНК.Сопоставьте весь транскриптом с морфологическим контекстом, чтобы получить новую информацию о нормальном развитии, патологии заболеваний и клинических трансляционных исследованиях.BMKGENE предоставляет комплексную универсальную услугу пространственного секвенирования транскриптома, от образцов до биологических данных.
Технологии пространственной транскриптомики открыли новые перспективы в разнообразной области исследований, разрешив профиль экспрессии генов с пространственным содержанием в гетерогенных образцах..
Чип пространственного транскриптома: 10x Genomics Visium
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Полноразмерное секвенирование мРНК – нанопора
Секвенирование РНК стало бесценным инструментом для комплексного анализа транскриптома.Несомненно, традиционное секвенирование короткого считывания достигло здесь многочисленных важных успехов.Тем не менее, он часто сталкивается с ограничениями при полноразмерной идентификации изоформ, количественном определении и систематической ошибке ПЦР.
Секвенирование нанопор отличается от других платформ секвенирования тем, что нуклеотиды считываются напрямую, без синтеза ДНК, и генерирует длинные чтения в десятках килобаз.Это дает возможность прямого считывания, пересечения полноразмерных транскриптов и решения проблем в исследованиях на уровне изоформ.
Платформа:Нанопор ПрометИОН
Библиотека:кДНК-ПЦР
-
Полноразмерное секвенирование мРНК - PacBio
зановополноразмерное секвенирование транскриптома, также известное какзановоIso-Seq использует преимущества секвенатора PacBio в длине считывания, что позволяет секвенировать полноразмерные молекулы кДНК без каких-либо разрывов.Это полностью позволяет избежать любых ошибок, возникающих на этапах сборки транскрипта, и создает наборы унигенов с разрешением на уровне изоформы.Этот набор унигенов предоставляет мощную генетическую информацию в виде «эталонной генома» на уровне транскриптома.Кроме того, в сочетании с данными секвенирования нового поколения эта услуга обеспечивает точную количественную оценку экспрессии на уровне изоформы.
Платформа: PacBio, продолжение II.Библиотека: библиотека звонков SMRT -
Секвенирование мРНК эукариот – Illumina
Секвенирование мРНК позволяет составить профиль всех мРНК, транскриптируемых из клеток в определенных условиях.Это мощная технология для выявления профиля экспрессии генов, генных структур и молекулярных механизмов определенных биологических процессов.На сегодняшний день секвенирование мРНК широко применяется в фундаментальных исследованиях, клинической диагностике, разработке лекарств и т. д.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Неэталонное секвенирование мРНК – Illumina
Секвенирование мРНК использует метод секвенирования нового поколения (NGS) для захвата информационной РНК (мРНК) из эукариот в определенный период, когда активируются некоторые специальные функции.Самый длинный сплайсированный транскрипт был назван «Unigene» и использовался в качестве эталонной последовательности для последующего анализа, что является эффективным средством изучения молекулярного механизма и регуляторной сети вида без ссылки.
После сборки данных транскриптома и функциональной аннотации Unigene
(1) Анализ SSR, предсказание CDS и структура гена будут предварительно сформированы.
(2) Будет проведена количественная оценка экспрессии унигенов в каждом образце.
(3) Дифференциально экспрессируемые унигены между образцами (или группами) будут обнаружены на основе экспрессии унигенов.
(4) Будут выполнены кластеризация, функциональная аннотация и анализ обогащения дифференциально экспрессируемых унигенов.
-
Длинное некодирующее секвенирование — Illumina
Длинные некодирующие РНК (днРНК) — это тип молекул РНК длиной более 200 нт, которые характеризуются крайне низким кодирующим потенциалом.LncRNA, как ключевой член некодирующих РНК, в основном обнаруживается в ядре и плазме.Развитие технологий секвенирования и биоинформатики позволяет идентифицировать многочисленные новые днРНК и связывать их с биологическими функциями.Накопленные данные свидетельствуют о том, что днРНК широко участвует в эпигенетической регуляции, регуляции транскрипции и посттранскрипционной регуляции.
-
Секвенирование малых РНК-Illumina
Малая РНК относится к классу некодирующих молекул РНК, длина которых обычно составляет менее 200 нуклеотидов, включая микроРНК (миРНК), малую интерференционную РНК (миРНК) и пиви-взаимодействующую РНК (пиРНК).
МикроРНК (миРНК) представляет собой класс эндогенных малых РНК длиной около 20–24 нуклеотидов, которые играют ряд важных регуляторных ролей в клетках.микроРНК участвуют во многих жизненных процессах, обнаруживая тканеспецифическую и стадийно-специфическую экспрессию и высококонсервативную у разных видов.
-
Секвенирование циркРНК-Illumina
ЦирРНК (круговые РНК) представляют собой один класс некодирующих молекул РНК, у которых нет 5'-концевого концевого колпачка и 3'-концевого поли(А)-хвоста.ЦирРНК образуют кольцевую структуру за счет ковалентной связи, которая защищает от расщепления экзонуклеазой РНК.ЦирРНК играет важную роль в росте и развитии организмов и их устойчивости к внешней среде.
ЦирРНК имеет множество функций, которые могут конкурентно связывать микроРНК, выполнять регуляторную функцию церРНК и регулировать экспрессию генов.В последние годы также было обнаружено, что он тесно связан с возникновением и развитием заболеваний и имеет большие перспективы применения в области маркеров диагностики заболеваний и так далее.
