Jednou z dôležitých záhradníckych vlastností, ktorá odlišuje pupkové pomaranče od iných bežných odrôd sladkých pomarančov, je prítomnosť pupka na plodoch.Táto vlastnosť je tiež dôležitým kritériom pre klasifikáciu záhradníckych odrôd sladkého pomaranča.
Klienti spoločnosti BMKGENE využili sekvenčnú technológiu SLAF, ktorú vyvinula spoločnosť BMKGENE, na uskutočnenie štúdie s názvom „Ťažba génov súvisiacich s kvalitou ovocia v sladkých pomarančoch na základe špecifického sekvenovania fragmentov so zosilneným miestom.“
Štúdia zahŕňala sekvenovanie 240 zdrojov zárodočnej plazmy sladkých pomarančov so širokou genetickou diverzitou a rôznym geografickým pôvodom, čo viedlo k 497,82 Mb krátkych dát.Analýza údajov poskytla 1 467 968 genotypov SNP v celom genóme.Využitím Fst analýzy štúdia identifikovala 6 kandidátskych génov súvisiacich s prítomnosťou pupka, hmotnosťou ovocia a titrovateľnou kyslosťou, čo poskytuje základ pre cielené zlepšenie odrôd sladkých pomarančov.
Pre sekvenovanie populácie vo veľkom meradle je sekvenovanie fragmentov so špecifickým lokusom (SLAF) nákladovo efektívnejšie a vysoko efektívnejšie v porovnaní so sekvenovaním celého genómu (WGS).
Kliknitetuaby ste sa o tejto štúdii dozvedeli viac.
Čas odoslania: 5. decembra 2023