Малая РНК

Малые РНК — это короткие некодирующие РНК средней длиной 18–30 нуклеотидов, включая miRNA, siRNA и piRNA, которые играют важную роль в регуляторных процессах. Конвейер обработки малых РНК BMKCloud предоставляет как стандартный, так и настраиваемый анализ для идентификации miRNA. После обрезки и контроля качества риды выравниваются по нескольким базам данных для классификации малых РНК и выбора miRNA, а затем картируются на референсный геном. Идентификация miRNA осуществляется на основе известных баз данных miRNA, предоставляющих информацию о вторичной структуре, семействе miRNA и целевых генах. Анализ дифференциальной экспрессии выявляет дифференциально экспрессируемые miRNA, а соответствующие целевые гены функционально аннотируются для поиска обогащенных категорий.