секвенирование мРНК (NGS) с использованием референсного генома.

РНК-секвенирование (RNA-seq) — это стандартный инструмент в биологических и сельскохозяйственных науках, позволяющий преодолеть разрыв между геномами и протеомами. Его сила заключается в обнаружении новых транскриптов и количественной оценке их экспрессии в одном анализе. Он широко используется для сравнительных транскриптомных исследований, проливая свет на гены, связанные с различными признаками или фенотипами, например, при сравнении мутантов с дикими типами или выявлении экспрессии генов в определенных условиях. Приложение BMKCloud mRNA(Reference) интегрирует количественную оценку экспрессии, анализ дифференциальной экспрессии (DEG) и анализ структуры последовательности в биоинформатический конвейер мРНК-секвенирования (NGS) и объединяет преимущества аналогичного программного обеспечения, обеспечивая удобство и простоту использования. Пользователи могут загружать свои данные RNA-seq в облако, где приложение предлагает комплексное, универсальное решение для биоинформатического анализа. Кроме того, оно уделяет приоритетное внимание удобству использования, предлагая персонализированные операции, адаптированные к конкретным потребностям пользователей. Пользователи могут самостоятельно задавать параметры и отправлять задания конвейера обработки данных, проверять интерактивный отчет, просматривать данные/диаграммы и выполнять интеллектуальный анализ данных, например: выбор целевых генов, функциональную кластеризацию, построение диаграмм и т. д.