Ena pomembna hortikulturna značilnost, po kateri se pupkaste pomaranče razlikujejo od drugih pogostih sladkih pomaranč, je prisotnost popka na plodu.Ta lastnost je tudi pomembno merilo za razvrščanje vrtnarskih sort sladkih pomaranč.
Stranke podjetja BMKGENE so uporabile samorazvito tehnologijo sekvenciranja SLAF podjetja BMKGENE za izvedbo študije z naslovom “Rudarski geni, povezani s kakovostjo sadja v sladkih pomarančah na podlagi specifičnega sekvenciranja fragmentov pomnoženega lokusa.“
Študija je vključevala sekvenciranje 240 virov zarodne plazme sladke pomaranče z veliko gensko raznolikostjo in različnim geografskim poreklom, kar je povzročilo 497,82 Mb kratkobranih podatkov.Analiza podatkov je dala 1.467.968 genotipov SNP v celotnem genomu.Z uporabo analize Fst je študija identificirala 6 genov kandidatov, povezanih s prisotnostjo popka, težo ploda in kislostjo, ki jo je mogoče titrirati, kar je osnova za ciljno izboljšanje sort sladkih pomaranč.
Za obsežno populacijsko sekvenciranje je sekvenciranje pomnoženih fragmentov specifičnega lokusa (SLAF) stroškovno in zelo učinkovito v primerjavi s sekvenciranjem celotnega genoma (WGS).
Kliknitetukajče želite izvedeti več o tej študiji.
Čas objave: 5. december 2023