lncrna

Длинные некодирующие РНК (днРНК) – это РНК длиной более 200 нуклеотидов с низким кодирующим потенциалом, но с критически важными регуляторными функциями. Конвейер днРНК BMKCloud предназначен для анализа библиотек, обеднённых рРНК, с использованием высококачественного, хорошо аннотированного референсного генома путём совместного анализа экспрессии днРНК и мРНК. После обрезки прочтений и контроля качества прочтения выравниваются с референсным геномом для сборки транскриптов, а последующий анализ структуры гена выявляет альтернативный сплайсинг и новые гены. Транскрипты идентифицируются как мРНК или днРНК, а анализ дифференциальной экспрессии позволяет идентифицировать дифференциально экспрессирующиеся днРНК, их мишени и дифференциально экспрессирующиеся гены (ДЭГ). Как ДЭГ, так и дифференциально экспрессирующиеся днРНК-мишени функционально аннотируются для поиска обогащённых функциональных категорий.