Bulgur Segregant derňewi
Hyzmat artykmaçlyklary
Takagi we başg.,Ösümlik journalurnaly, 2013
ØTakyk lokalizasiýa: Fon sesini azaltmak üçin köp mukdarda 30 + 30-dan 200 + 200 adama çenli garyşdyrmak;sinonim däl mutatantlara esaslanýan dalaşgär sebitiniň çaklamasy.
ØGiňişleýin derňew: NR, SwissProt, GO, KEGG, COG, KOG we ş.m. ýaly çuňňur kandidat gen funksiýasynyň düşündirişi.
ØÇalt öwrüliş wagty: 45 iş gününiň içinde geniň çalt lokalizasiýasy.
ØGiňişleýin tejribe: BMK ekinler, suw önümleri, tokaý, güller, miweler we ş.m. ýaly dürli görnüşleri öz içine alýan müňlerçe häsiýetleriň lokalizasiýasyna goşant goşdy.
Hyzmat aýratynlyklary
Ilaty:
Ene-atalaryň nesillerini garşydaş fenotipler bilen bölmek.
meselem F2 nesli, Backcrossing (BC), Rekombinant inbred line (RIL)
Garyşyk howuz
Hil aýratynlyklary üçin: 30-50 adam (azyndan 20) / köp
San taýdan tratis üçin: tutuş ilatyň arasynda ekstremal fenotipleri bolan iň ýokary 5% -den 10% -e çenli (iň azyndan 30 + 30).
Maslahat berilýän yzygiderlilik çuňlugy
Iň azyndan 20X / ene we 1X / nesil şahsyýeti (mysal üçin, 30 + 30 şahsyýetiň nesil garyşyk howuzy üçin yzygiderlilik çuňlugy 30X bolar)
Bioinformatika derňewi
üGenhli genomyň yzygiderliligi
üMaglumatlary gaýtadan işlemek
üSNP / Indel jaňy
üDalaşgärleriň sebit barlagy
üDalaşgärleriň gen funksiýasynyň düşündirişi
Nusga talaplary we gowşuryş
Nusga talaplary:
| gDNA nusgasy | Dokumanyň nusgasy |
| Konsentrasiýa: ng30 ng / μl | Ösümlikler: 1-2 gr |
| Mukdary: ≥2 μg (Tom ≥15 μl) | Haýwanlar: 0,5-1 gr |
| Arassalygy: OD260 / 280 = 1.6-2.5 | Bütin gan: 1,5 ml |
Hyzmat işiniň akymy
Synag dizaýny
Mysal üçin gowşuryş
Kitaphana gurluşygy
Yzygiderlilik
Maglumatlaryň derňewi
Satuwdan soňky hyzmatlar
1. Dalaşgär sebitini kesgitlemek üçin ucewklid aralygy (ED) boýunça birleşme derňew bazasy.Aşakdaky suratda
X oky: Hromosoma sany;Her nokat SNP-iň ED bahasyny görkezýär.Gara çyzyk, ED bahasyna laýyk gelýär.Has ýokary ED bahasy, sahypa bilen fenotipiň arasynda has möhüm birleşigi görkezýär.Gyzyl çyzyk çyzygy möhüm birleşigiň çägini görkezýär.
2. SNP-indeks ýok birleşme derňewi
X oky: Hromosoma sany;Her nokat SNP-indeks bahasyny görkezýär.Gara çyzyk, SNP-indeks bahasyna laýyk gelýär.Gymmatlygy näçe uly bolsa, birleşme şonça-da möhümdir.
BMK meselesi
Fnl7.1-iň esasy täsir ediji mukdar häsiýeti, hyýarda miwäniň boýunyň uzynlygy bilen baglanyşykly giçki embrionogeneziň köp mukdaryny kodlaýar.
Çap edilen: Ösümlik biotehnologiýasy Journalurnaly, 2020
Yzygiderlilik strategiýasy:
Ene-atalar (Jin5-508, YN): 34 × we 20 for üçin tutuş gen genine laýyklyk.
DNK howuzlary (50 uzyn boýly we 50 gysga boýly): 61 × we 52 for üçin talap
Esasy netijeler
Bu gözlegde, uzyn boýly hyýar çyzygyny Jin5-508 we gysga boýly YN-den geçmek arkaly ilaty bölmek (F2 we F2: 3) döredildi.Iki sany DNK howuzy, aşa uzyn boýly 50 we gysga boýly 50 adam tarapyndan guruldy.Esasy täsirli QTL, Chr07-de BSA derňewi we adaty QTL kartasy bilen kesgitlenildi.Dalaşgär sebiti, CsFnl7.1 boýnuň uzynlygyna gözegçilik etmekde esasy geni ýüze çykaran inçe kartalaşdyrmak, gen aňlatma mukdary we transgen synaglar arkaly hasam çäklendirildi.Mundan başga-da, CsFnl7.1 promouter sebitindäki polimorfizmiň degişli aňlatma bilen baglanyşyklydygy anyklandy.Soňraky filogenetiki derňew Fnl7.1 ýeriniň Hindistandan gelip çykmagynyň ähtimaldygyny görkezdi.
 Sogan boýnunyň uzynlygy bilen baglanyşykly dalaşgär sebitini kesgitlemek üçin BSA derňewinde QTL-kartalaşdyrmak |  Chr07-de kesgitlenen hyýar boýnunyň uzynlygy QTL-iň LOD profilleri |
Su, X. we ş.m."Fnl7.1-iň esasy täsir ediji mukdar häsiýeti, hyýarda miwäniň boýunyň uzynlygy bilen baglanyşykly giçki embrionogeneziň köp mukdaryny kodlaýar."Ösümlik biotehnologiýasy Journalurnaly 18.7 (2020).
