-
Metagenomiki yzygiderlilik (NGS)
Metagenome, ekologiki metagenoma, adam metagenomy we ş.m. ýaly garyşyk organizmleriň umumy genetiki materiallarynyň ýygyndysyna degişlidir. Onda ekilip bilinýän we ösdürip ýetişdirilmedik mikroorganizmleriň genomlary bar.Metagenomiki yzygiderlilik, daşky gurşawyň nusgalaryndan alnan garyşyk genom materiallaryny seljermek üçin ulanylýan molekulýar gural bolup, görnüşleriň dürlüligi we bolçulygy, ilatyň gurluşy, filogenetik gatnaşygy, funksional genleri we daşky gurşaw faktorlary bilen arabaglanyşyk ulgamy barada jikme-jik maglumat berýär.
Platforma ：Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomiki yzygiderlilik-Nanopore
Metagenomika, daşky gurşawyň nusgalaryndan alnan garyşyk genom materiallaryny seljermek üçin ulanylýan molekulýar guraldyr, görnüşleriň dürlüligi we bolçulygy, ilatyň gurluşy, filogenetik gatnaşygy, funksional genler we daşky gurşaw faktorlary bilen korrelýasiýa ulgamy we ş.m. barada jikme-jik maglumat berýän Nanopore yzygiderli platformalary. metagenomiki gözleglere.Okalýan uzynlykdaky ajaýyp ýerine ýetiriş, esasan metagenom ýygnanyşygynyň aşaky akym metagenomiki derňewini güýçlendirdi.Okalýan uzynlygyň artykmaçlyklaryndan peýdalanyp, Nanopore esasly metagenomiki gözleg, ýaragly metagenomika bilen deňeşdirilende has üznüksiz ýygnanyşyga ýetmegi başarýar.Nanopore esasly metagenomikanyň mikrobiomalardan doly we ýapyk bakterial genomlaryny üstünlikli döredendigi (Moss, EL we ş.m.,Tebigat biotehniki, 2020)
Platforma ：Nanopore PromethION P48
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S we 18S rRNA-da ýokary konserwirlenen we aşa üýtgeýän sebitleri öz içine alýan subunit, prokaryotik we eukariotik organizmleri kesgitlemek üçin ajaýyp molekulýar barmak yzydyr.Yzygiderlilikden peýdalanyp, bu amplikonlar konserwirlenen böleklere esaslanyp nyşana alnyp bilner we mikroblaryň dürlüligini seljermek, taksonomiýa, filogeniýa we ş.m. öz içine alýan barlaglara goşant goşýan giper üýtgeýän sebitler doly häsiýetlendirilip bilner. ) “PacBio” platformasynyň yzygiderliligi, doly uzynlykdaky amplikonlary (takmynan 1,5 Kb) örtüp bilýän ýokary takyk uzyn okamaga mümkinçilik berýär.Genetiki meýdanyň giň görnüşi bakteriýalarda ýa-da kömelekler jemgyýetinde görnüşleriň düşündirişinde çözgüdi ep-esli ýokarlandyrdy.
Platforma ：PacBio Sequel II
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S / 18S / ITS amplikon yzygiderliligi, ýokary gürleşilýän we ýokary derejeli bölekleri öz içine alýan öý genetiki bellikleriniň PCR önümlerini derňemek arkaly mikrob jemgyýetinde filogeniýany, taksonomiýany we görnüşleriň köplügini ýüze çykarmagy maksat edinýär.Woeses we başganyň (1977) bu ajaýyp molekulýar barmak yzynyň girizilmegi, izolýasiýa erkin mikrobiome profilini güýçlendirýär.16S (bakteriýalar), 18S (kömelekler) we Içerki transkripsiýaly spacer (ITS, kömelekler) yzygiderliligi, köp görnüşi, şeýle hem seýrek we näbelli görnüşleri kesgitlemäge mümkinçilik berýär.Bu tehnologiýa, adamyň agzy, içege, nejis we ş.m. ýaly dürli gurşawda diferensial mikrob düzümini kesgitlemekde giňden ulanylýan we esasy gurala öwrüldi.
Platforma ：Illumina NovaSeq6000
-
Bakterial we kömelekli genomyň yzygiderliligi
Bakterial we kömelekli genomyň gaýtadan yzygiderliligi belli bakteriýalaryň we kömelekleriň genomlaryny tamamlamak, şeýle hem birnäçe genomlary deňeşdirmek ýa-da täze organizmleriň genomlaryny kartalaşdyrmak üçin möhüm guraldyr.Takyk salgylanma genomlaryny döretmek, mikroblary kesgitlemek we beýleki deňeşdirme genom barlaglaryny geçirmek üçin bakteriýalaryň we kömelekleriň ähli genomlaryny yzygiderlilikde yzarlamak möhümdir.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Kömelek genomy
Biomarker Technologies, belli bir gözleg maksadyna baglylykda genom gözlegini, inçe genomy we kömelekleriň doly genomyny üpjün edýär.Genom yzygiderliligi, ýygnamak we funksional düşündiriş, indiki nesil yzygiderliligi + Üçünji nesil yzygiderliligini ýokary derejeli gen ýygnamak üçin birleşdirip bolýar.Hromosoma derejesinde gen ýygnamagy aňsatlaşdyrmak üçin “Hi-C” tehnologiýasy hem ulanylyp bilner.
Platforma ：PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Bakteriýalar doly genom
Biomarker Technologies, bakteriýalaryň doly genomyny nol boşluk bilen gurmak boýunça yzygiderli hyzmat edýär.Bakteriýalaryň doly gen gurluşynyň esasy iş prosesi üçünji nesil yzygiderliligini, ýygnamagyny, funksional düşündirişini we belli bir gözleg maksatlaryny ýerine ýetirýän ösen bioinformatiki derňewi öz içine alýar.Bakteriýalaryň genomynyň has giňişleýin öwrenilmegi, biologiki amallarynyň esasy mehanizmlerini ýüze çykarmaga mümkinçilik berýär, bu has ýokary eukariotik görnüşlerde genom gözlegleri üçin gymmatly salgylanma berip biler.
Platforma ：Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
