-
PacBio-Doly uzynlykdaky transkriptom (salgylanma däl)
Amplicon (16S / 18S / ITS) platformasy, mikroblaryň dürlüligi taslamasynyň derňewinde köp ýyllyk tejribe toplap, standartlaşdyrylan esasy derňewi we şahsylaşdyrylan derňewi öz içine alýar: esasy derňew häzirki mikrob gözlegleriniň esasy derňew mazmunyny öz içine alýar, derňew mazmuny baý we giňişleýin, we derňew netijeleri taslama hasabatlary görnüşinde berilýär;Şahsylaşdyrylan derňewiň mazmuny dürli-dürli.Nusgalar saýlanyp bilner we şahsylaşdyrylan talaplary durmuşa geçirmek üçin esasy derňew hasabatyna we gözleg maksadyna görä parametrler çeýe düzülip bilner.Windows operasiýa ulgamy, ýönekeý we çalt.
-
PacBio-Doly uzynlykdaky transkriptom (salgylanma däl)
“Pacific Biosciences” (PacBio) “Isoform” yzygiderli maglumatlary giriş hökmünde kabul edip, bu programma doly uzynlykdaky transkripsiýa yzygiderliligini kesgitläp bilýär (gurnamazdan).Salgy genomyna garşy doly uzynlykly yzygiderliligi düzmek bilen, transkripsiýalary belli genler, transkripsiýalar, kodlaýyş sebitleri we ş.m. optimizirläp bolýar, bu ýagdaýda alternatiw bölüniş we ş.m. ýaly mRNA gurluşlaryny has takyk kesgitlemek mümkin.NGS transkriptom yzygiderliligi maglumatlary bilen bilelikde seljerme has giňişleýin düşündiriş bermäge we transkripsiýa derejesinde has takyk kesgitlemäge mümkinçilik berýär, bu esasan aşaky diferensial aňlatma we funksional derňew üçin peýdalydyr.
-
Gurallar
BMKCloud, genom programmalary üçin bir bitewi çözgüt hödürleýän öňdebaryjy bioinformatik platforma bolup, lukmançylyk, oba hojalygy, daşky gurşaw we ş.m. ýaly dürli ugurlardaky gözlegçiler tarapyndan giňden ynanylýar BMKCloud bioinformatiki derňew platformalary we gurallary goşmak bilen toplumlaýyn, ygtybarly we täsirli hyzmatlary bermäge borçlanýar. , hasaplaýyş çeşmeleri, jemgyýetçilik maglumatlar binýady, bioinformtiki onlaýn kurslar we ş.m. BMKCloud-da gen annotasiýasy, ewolýusiýa genetiki gurallary, ncRNA, maglumatlaryň hiline gözegçilik, ýygnamak, deňleşdirmek, maglumatlary çykarmak, mutasiýa, statistika, şekil generatory, yzygiderliligi öz içine alýan dürli bioinformatiki gurallar bar. derňew we ş.m.
-
kiçi RNK
Kiçi RNK, miRNA, siRNA we piRNA ýaly ortaça uzynlygy 18-30 nt bolan gysga kodlanmadyk RNK görnüşidir.Bu kiçijik RNK-leriň mRNA zaýalanmagy, terjime edilmegi, heterohromatin emele gelmegi we ş.m. ýaly dürli biologiki proseslere gatnaşýandygy barada köp habar berildi, ownuk RNA yzygiderliligi haýwanlaryň / ösümlikleriň ösüşi, kesel, wirus we ş.m. gözleglerde giňden ulanyldy. yzygiderlilik derňew platformasy standart derňewden we ösen maglumatlary gazmakdan ybaratdyr.RNA-seq maglumatlarynyň esasynda standart derňew miRNA kesgitlemäni we çaklamany, miRNA maksatly gen çaklamasyny, düşündiriş we aňlatma derňewini gazanyp biler.Giňişleýin derňew, ýöriteleşdirilen miRNA gözleg we çykarmak, Wenn diagramma döretmek, miRNA we maksatly gen ulgamy gurmak mümkinçiligini berýär.
-
NGS-WGS (Illumina / BGI)
NGS-WGS, Biomarker Technologies-de baý tejribe esasynda işlenip düzülen genomyň yzygiderli yzygiderliliginiň derňew platformasydyr.Ulanylyşy aňsat bolan bu platforma, Illumina platformasyndan we BGI yzygiderlilik platformasyndan emele gelen DNK yzygiderlilik maglumatlaryna laýyk gelýän birnäçe esasy parametrleri düzmek arkaly toplumlaýyn derňew işini çalt tabşyrmaga mümkinçilik berýär.Bu platforma ýokary öndürijilikli hasaplaýyş serwerinde ýerleşdirilip, örän çäkli wagtyň içinde ýokary netijeli maglumat derňewine mümkinçilik berýär.Şahsy maglumatlary gazyp almak, adaty gen seljermesi, PCR başlangyç dizaýny we ş.m. standart derňewiň esasynda elýeterlidir.
-
mRNA (Salgy)
Transkriptom genom genetiki maglumatlar bilen biologiki funksiýanyň proteomynyň arasyndaky baglanyşykdyr.Transkripsiýa derejesini kadalaşdyrmak organizmleriň iň möhüm we iň köp öwrenilen düzgünleşdiriş tertibi.Transkriptor yzygiderliligi transkriptomany islendik wagtda ýa-da islendik şertde bir nukleotidiň takyklygy bilen yzygiderli tertipläp biler. Bu gen transkripsiýasynyň derejesini dinamiki taýdan görkezip biler, şol bir wagtyň özünde seýrek we adaty ýazgylary kesgitläp we kesgitläp biler we gurluş maglumatlaryny berip biler. ýörite ýazgylary nusga al.
Häzirki wagtda transkriptor yzygiderlilik tehnologiýasy agronomiýada, lukmançylykda we haýwanlaryň we ösümlikleriň ösüşini kadalaşdyrmak, daşky gurşawyň uýgunlaşmagy, immunitetiň täsiri, genleriň lokalizasiýasy, görnüşleriň genetiki ewolýusiýasy we çiş we genetiki keselleri kesgitlemek ýaly beýleki gözleg ugurlarynda giňden ulanyldy.
-
Metagenomika (NGS)
Bu derňew platformasy, köp ýyllyk tejribe esasynda tüpeň metagenomiki maglumatlary derňemek üçin döredildi.Maglumatlary gaýtadan işlemek, görnüşler boýunça gözlegler, gen funksiýalaryny öwrenmek, metagenom binýady we ş.m. ýaly dürli zerur bolan metagenomika derňewlerini öz içine alýan toplumlaýyn iş akymyndan ybaratdyr. Mundan başga-da, gen we görnüşleriň gözlegini goşmak bilen, adaty derňew işinde ýöriteleşdirilen magdan gazyp almak gurallary bar. , parametrleri düzmek, şahsylaşdyrylan şekil döretmek we ş.m.
-
LncRNA
Uzyn kodlanmadyk RNK (lncRNA), beloklary kodlap bilmeýän uzynlygy 200 nt-den uzyn bolan ýazgylaryň bir görnüşidir.Toplaýyş subutnamalary lncRNA-laryň köpüsiniň işlemeginiň gaty ähtimaldygyny görkezýär.Throughokary geçişli yzygiderlilik tehnologiýalary we bioinformatiki derňew gurallary bize lncRNA yzygiderliligini we ýerleşdiriş maglumatyny has netijeli açmaga we möhüm kadalaşdyryjy funksiýalar bilen lncRNA-lary tapmaga mümkinçilik berýär.BMKCloud çalt, ygtybarly we çeýe lncRNA derňewini gazanmak üçin müşderilerimize lncRNA yzygiderlilik derňew platformasyny hödürlemek bilen buýsanýar.
-
GWAS
Genom boýunça giňişleýin gözleg (GWAS), belli bir aýratynlyklar (fenotip) bilen baglanyşykly genetiki wariantlary (genotip) kesgitlemegi maksat edinýär.GWA barlaglary genetiki bellikleriň köp sanly adamyň genomyny kesýändigini öwrenýär we ilat derejesinde statistiki derňew arkaly genotip-fenotip birleşmelerini çaklaýar.Genhli genomyň yzygiderliligi ähli genetiki wariantlary ýüze çykaryp biler.Fenotip maglumatlary bilen birleşdirilende, GWAS häzirki zaman haýwanlaryň / ösümlikleriň köpelmegini berk goldaýan fenotip bilen baglanyşykly SNP-leri, QTL-leri we kandidat genlerini kesgitlemek üçin gaýtadan işlenip bilner.SLAF öz-özünden ýönekeýleşdirilen genleriň yzygiderliligi strategiýasy bolup, genleriň giň ýaýradylan markerlerini, SNP-ni açýar.Bu SNP-ler, molekulýar genetiki bellikler hökmünde, maksatly aýratynlyklar bilen birleşmek üçin işlenip bilner.Genetiki üýtgeşmeleriň çylşyrymly aýratynlyklaryny kesgitlemekde tygşytly strategiýa.
-
Nanopore Doly uzynlykdaky transkriptomika
Organizmlerdäki çylşyrymly we üýtgeýän alternatiw izoformlar gen aňlatmasyny we beloklaryň dürlüligini kadalaşdyrmak üçin möhüm genetiki mehanizmlerdir.Transkripsiýa gurluşlaryny takyk kesgitlemek geni aňlatmagyň kadalaşdyryş usullaryny çuňňur öwrenmek üçin esas bolup durýar.Nanopore yzygiderlilik platformasy transkriptomiki gözlegleri izoform derejesine üstünlikli getirdi.Bu seljeriş platformasy, Nanopore platformasynda döredilen gen-geniň esasynda hil we mukdar taýdan analizlere ýetýän RNA-Seq maglumatlary analiz etmek üçin döredildi.
