Leistung verschiedener Sequenzierungstechnologien bei der Aufklärung der Metagenomik.
In dieser Vorlesung gibt sie eine Einführung in die Anwendungen verschiedener Sequenzierungstechnologien zum Verständnis des Mikrobioms, einschließlich ihrer technischen Arbeitsabläufe, Leistungen und einiger Fallstudien.Der Vortrag wird folgende Aspekte behandeln:
● Allgemeine Einführung in aktuelle Methoden zur Mikrobiom-Profilierung
● Amplikon-basierte Metabarcoding-Sequenzierung: Von der Probenvorbereitung bis zur Dateninterpretation
● Was wir sonst noch vom Metabarcoding erwarten können: PacBio-basierte Amplikonsequenzierung in voller Länge
● Shot-Gun-Metagenomsequenzierung für einen umfassenderen Überblick über funktionelle Gene
● Nanoporenbasierte Metagenomsequenzierung