Produkte

Pilzgenom

Biomarker-Technologien bieten je nach spezifischem Forschungsziel eine Genomuntersuchung, ein Feingenom und ein vollständiges Genom von Pilzen.Genomsequenzierung, Assemblierung und funktionale Annotation können durch die Kombination von Next-Generation-Sequenzierung und Third-Generation-Sequenzierung erreicht werden, um eine Genomassemblierung auf hohem Niveau zu erreichen.Die Hi-C-Technologie kann auch eingesetzt werden, um die Genomassemblierung auf Chromosomenebene zu erleichtern.

Plattform:PacBio Fortsetzung II

Nanopore PromethION P48

Illumina NovaSeq-Plattform

Kontaktiere uns

Servicedetails

Demo-Ergebnisse

Servicevorteile

● Mehrere Sequenzierungsstrategien für unterschiedliche Forschungsziele verfügbar

● Sehr erfahren in der Assemblierung von Pilzgenomen mit über 10.000 assemblierten Pene-vollständigen Genomen.

● Professionelles technisches Kundendienstteam, das spezifischere Forschungsanforderungen erfüllt.

Leistungsbeschreibung

Service	Sequenzierungsstrategie	Qualität garantiert	Geschätzte Bearbeitungszeit
Pilz-Feinkarte	Illumina 50X+Nanopore 100X	Contig N50≥2 MB	35 Werktage
Pilz-Feinkarte	PacBio HiFi 30X	Contig N50≥2 MB	35 Werktage
Pilz-Pene-vollständige Karte	Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	Chromosomenverankerungsverhältnis >90 %	45 Werktage

Bioinformatische Analysen

● Qualitätskontrolle der Rohdaten

● Genomassemblierung

● Genomkomponentenanalyse

● Annotation der Genfunktion

● Vergleichende Genomanalyse

Musteranforderungen und Lieferung

Probenanforderungen:

FürDNA-Extrakte:

Beispielstyp	Menge	Konzentration	Reinheit
DNA-Extrakte	＞ 1,2 μg	＞ 20 ng/μl	AD260/280= 1,6-2,5

Für Gewebeproben:

Beispielstyp

Empfohlene Probenbehandlung

Probenlagerung und -versand

Einzelliger Pilz

Beobachten Sie Hefen unter dem Mikroskop und sammeln Sie sie in ihrer exponentiellen Phase

Übertragen Sie die Kultur (enthält ca. 3–4,5e9 Zellen) in einen 1,5 oder 2 ml Eppendorf.(Auf Eis bleiben)

Zentrifugieren Sie das Röhrchen 1 Minute lang bei 14.000 g, um Bakterien zu sammeln, und entfernen Sie den Überstand vorsichtig

Verschließen Sie das Röhrchen und frieren Sie die Bakterien mindestens 1–3 Stunden lang in flüssigem Stickstoff ein.Bewahren Sie das Röhrchen im Kühlschrank bei -80 °C auf.

Frieren Sie die Proben 3-4 Stunden lang in flüssigem Stickstoff ein und lagern Sie sie zur Langzeitkonservierung in flüssigem Stickstoff oder bei -80 Grad.Der Probenversand mit Trockeneis ist erforderlich.

Makropilz

Empfohlen wird Gewebe in der aktiven Wachstumsphase.

Spülen Sie das Gewebe mit endotoxinfreiem Wasser und anschließend mit 70 % Ethonal.

Bewahren Sie die Probe in Kryo-Röhrchen auf.