Assay für Transposase-zugängliches Chromatin mit Hochdurchsatzsequenzierung (ATAC-seq)
Servicevorteile
● Umfassende Analyse: Professionelle Analyse-Pipeline zur Erfüllung einer Vielzahl individueller Analyseanforderungen;
● Umfangreiche Erfahrung: Hunderte Projekte wurden bisher erfolgreich abgeschlossen, einschließlich Tier- und Pflanzenproben.
Leistungsbeschreibung
Plattform: Illumina NovaSeq-Plattform
Bibliothekstyp: ATAC-seq
Empfohlene Datenausgabe: ≥20 Millionen Lesevorgänge
Beispielanforderungen
Probentyp: Gewebe, lebende Zellen oder gefrorene Zellen usw
Zellenzahl: ≥ 5×105Zellen ist eine genaue Zellzahl der Schlüssel zum Erfolg des Experiments;
Gewebegewicht: ≥ 200 mg frisches Gewebe;
Blut: ≥ 2 ml
Service-Workflow
Experimentdesign
Musterlieferung
DNA-Extraktion
Bibliotheksbau
Sequenzierung
Datenanalyse
Kundendienst
1.Heatmap auf ATAC liest die Verteilung bei TSS und angrenzenden Regionen (±3 kb)
2.Verteilung der offenen Chromatinregion in verschiedenen Genomkomponenten
3.Differenzielles Peak-Calling zwischen Gruppen
