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Flexible Analyse-APPs

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Eukaryotische mRNA-Analyse (mit Referenz)

Basierend auf den bekannten Genomsequenz- und Annotationsinformationen wird eine neue Generation von Hochdurchsatzsequenzierungsdaten (RNA-Seq) als Eingabe verwendet und die neuen Transkriptionsstellen (neues Gen) und neue variable Spleißereignisse identifiziert.Bewertung der Sequenzierungsdatenqualität;Sequenzierungsdaten und Sequenzausrichtung des ausgewählten Referenzgenoms, Identifizierung der Grenzen von Exon/Intron, Analyse des Spleißens der Genvariante, Erforschung der Genregionen und neuer Transkripte, Identifizierung der SNP-Stellen der transkribierten Region, der Grenze zwischen 3' und 5 ' Gene und die funktionelle Annotation und Anreicherungsanalyse verschiedener Proben (Gruppen).

Lange nichtkodierende RNAs

Lange nichtkodierende RNAs (lncRNA) sind eine Art Transkripte mit einer Länge von mehr als 200 nt, die keine Proteine ​​kodieren können.Die zunehmenden Beweise deuten darauf hin, dass die meisten lncRNAs höchstwahrscheinlich funktionsfähig sind.Hochdurchsatz-Sequenzierungstechnologien und bioinformatische Analysetools ermöglichen es uns, lncRNA-Sequenzen und Positionierungsinformationen effizienter aufzudecken und lncRNAs mit entscheidenden regulatorischen Funktionen zu entdecken.BMKCloud ist stolz darauf, unseren Kunden eine lncRNA-Sequenzierungsanalyseplattform zur Verfügung zu stellen, um eine schnelle, zuverlässige und flexible lncRNA-Analyse zu ermöglichen.

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16S/18S/ITS-Amplikonsequenzierung

Die Plattform zur Analyse der mikrobiellen Diversität wurde mit jahrelanger Erfahrung in der Projektanalyse der mikrobiellen Diversität entwickelt und umfasst standardisierte Basisanalysen und personalisierte Analysen: Die Basisanalyse deckt den Hauptanalyseinhalt der aktuellen mikrobiellen Forschung ab, der Analyseinhalt ist reichhaltig und umfassend und die Analyseergebnisse werden präsentiert in Form von Projektberichten;Die Inhalte der personalisierten Analyse sind vielfältig.Je nach grundlegendem Analysebericht und Forschungszweck können Proben ausgewählt und Parameter flexibel eingestellt werden, um individuelle Anforderungen zu erfüllen.Windows-Betriebssystem, einfach und schnell.

Schrotflinten-Metagenomik (NGS)

Metagenomische Daten werden zur Analyse der aus Umweltproben extrahierten gemischten genomischen Materialien verwendet, die detaillierte Informationen über Artenvielfalt und -häufigkeit, Populationsstruktur, phylogenetische Beziehung, funktionelle Gene und Korrelationsnetzwerk mit Umweltfaktoren liefern.

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NGS-WGS (Illumina/BGI)

Eine integrierte Analyse-Pipeline, die für Forscher ohne Vorkenntnisse in der Bioinformatik entwickelt wurde und auf einem Hochleistungsserver läuft.Es erleichtert die schnelle Erledigung von Aufgaben wie Datenqualitätskontrolle, Sequenzausrichtung, SNP/InDel/SV-Variationserkennung, Annotation und Mutationsgen.

GWAS

Mithilfe spezifischer statistischer Methoden zielt die GWAS-Analyse darauf ab, genomweite Nukleotidvariationen aufzudecken, die mit phänotypischen Unterschieden korrelieren.Es spielt eine entscheidende Rolle bei der Erforschung funktioneller Gene, die mit komplexen menschlichen Krankheiten und komplexen Merkmalen bei Pflanzen und Tieren verbunden sind.

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BSA

Die integrierte Analyseplattform bietet eine benutzerfreundliche Oberfläche für standardisierte und personalisierte Diversitätsanalysen.Bei der BSA-Analyse werden Individuen mit extremen phänotypischen Merkmalen aus einer segregierenden Population zusammengefasst.Durch den Vergleich unterschiedlicher Loci zwischen den gepoolten Proben identifiziert dieser Ansatz schnell eng verbundene molekulare Marker, die mit Zielgenen assoziiert sind.Es wird häufig bei der genetischen Kartierung von Pflanzen und Tieren eingesetzt und ist ein wertvolles Werkzeug für die markergestützte Züchtung und Genpositionierung.

Evolutionäre Genetik

Es handelt sich um einen integrierten Analyse-Workflow, der für Forschungsexperten mit begrenzten Bioinformatik-Kenntnissen konzipiert ist.Diese Plattform nutzt die umfangreiche Erfahrung von BMKGENE in genetischen Evolutionsprojekten und läuft auf Hochleistungsservern, um eine schnelle und präzise Durchführung personalisierter Analysen zu gewährleisten.Dazu gehören Aufgaben wie die phylogenetische Baumkonstruktion, die Analyse des Verknüpfungsungleichgewichts, die Bewertung der genetischen Diversität, die Identifizierung selektiver Sweeps, die Verwandtschaftsanalyse, die Hauptkomponentenanalyse und die Charakterisierung der Populationsstruktur.

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