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DNA/RNA -Sequenzierung - Nanopore -Sequenzer

ONT-Sequenzierung ist eine einzelne Echtzeit-Echtzeit-Signalsequenzierungstechnologie, die auf Nanoporen basiert, das Sequenzierungsprinzip jeder Plattform ist gleich. Doppelsträngige DNA/RNA wird an in das Biofilm eingebettete nanoporöses Protein bin Rate. Aufgrund der Unterschiede der chemischen Eigenschaften der verschiedenen Basen auf dem DNA/RNA -Strang, wenn ein einzelner Base oder ein DNA -Molekül durch den Nanopore -Kanal führt, wird die Änderung verschiedener elektrischer Signale verursacht. Durch Erkennen und Entsprechen dieser Signale können die entsprechenden Basistypen berechnet werden und die Echtzeiterkennung der Sequenz abgeschlossen werden.

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Servicedetails

Demo -Ergebnis

Servicedetails Funktionen

Plattform	Bibliotheksgröße	Theoretische Datenertrag (pro Zelle)	Einzelbasisgenauigkeit	Anwendungen
Nanopore	8 KB, 10 KB, 20 KB, Ultralong, cDNA-PCR	70-90 GB/Zelle	85-92%	SV Calling, de novo, Sequenzierung in voller Länge, ISO-seq, Genannotation, Nachweis der DNA-Methylierung

Servicevorteile

● Über 5 Jahre Erfahrung auf der Pacbio -Sequenzierungsplattform mit Tausenden von geschlossenen Projekten mit verschiedenen Arten.
● Bmkgene ist offizieller Partner von Oxford Nanopore mit einer Doppelplattform -RNA/DNA -Zertifizierung.
● Es gibt Mainstream -Modelle von Sequenzern mit vollständiger Ausrüstung und ausreichender Sequenzierungsdurchsatz.
● Basierend auf der Nanopore -Plattform wurden in international renommierten Zeitschriften mehr als 10 Tier- und Pflanzenforschungen veröffentlicht.

Stichprobenanforderungen

Probentyp

Menge

Konzentration (Qubit ®)

Volumen

Reinheit

Andere

Genomische DNA

Abhängig von den Datenanforderungen

≥ 20 ng/μl

≥ 15 μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230 under 1,5 ；

Klarer Peak bei 260 nm ， Keine Verunreinigungen

Die Konzentration muss mit Qubit und Qubit/Nanopore ≤ 2 gemessen werden

Gesamt -RNA

≥ 1,2 μg

≥ 100 μg/μl

≥ 15 μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ； Keine Verunreinigungen

RIN -Wert ≥ 7,5

Service Workflow

Probenvorbereitung

Bibliothekskonstruktion

Sequenzierung

Datenanalyse

Projektlieferung

Vorherige: Illumina vorgefertigte Bibliotheken

Nächste: Verstärkte Fragmentsequenzierung spezifischer Lokus (SLAF-Seq)

Datenqualitätsbewertung der DNA -Probe

Tabelle 1. Statistik zu sauberen Daten.

Bmkid	Rawseqnum	Rawsumbase	Cleanseqnum	Reinigungsbaum	Cleann50len	Cleann90Len	Cleanmeanlen	CleanMaxlen	CleanMeanqual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121.736	25.90	28.014	15.764	23.090	143.181	9