Resequenzierung des gesamten Genoms von Bakterien und Pilzen
Projekte zur vollständigen Resequenzierung bakterieller und pilzlicher Genome sind von zentraler Bedeutung für den Fortschritt der mikrobiellen Genomik, da sie die Vervollständigung und den Vergleich mikrobieller Genome ermöglichen. Dies erleichtert die Fermentationstechnik, die Optimierung industrieller Prozesse und die Erforschung von Sekundärstoffwechselwegen. Darüber hinaus ist die Resequenzierung von Pilzen und Bakterien entscheidend für das Verständnis der Umweltanpassung, die Optimierung von Stämmen und die Aufklärung der Dynamik der genetischen Evolution mit weitreichenden Implikationen für Medizin, Landwirtschaft und Umweltwissenschaften.
Servicevorteile
●Bioinformatische Analyse umfasst Variantenerkennung:Funktionelle Einblicke in die resequenzierten Genome liefern.
● Umfassende ExpertiseMit Tausenden von mikrobiellen Resequenzierungsprojekten pro Jahr verfügen wir über mehr als ein Jahrzehnt Erfahrung, ein hochqualifiziertes Analyseteam, umfassende Inhalte und einen exzellenten Kundendienst.
●Kundendienst:Unser Engagement geht über den Projektabschluss hinaus und umfasst einen dreimonatigen Kundendienst. In dieser Zeit bieten wir Projektnachbetreuung, Unterstützung bei der Fehlerbehebung und Fragerunden an, um alle Fragen zu den Ergebnissen zu klären.
Service-Spezifikationen
| Sequenzierungsplattform | Sequenzierungsstrategie | Empfohlene Daten | Qualitätskontrolle |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 100-fache Tiefe | Q30≥85% |
Musteranforderungen
| Konzentration (ng/µL) | Gesamtbetrag (ng) | Volumen (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterien: ≥1x107 Zellen
Einzellige Pilze: ≥5x106-1x107 Zellen
Makropilze: ≥4 g
Service-Workflow
Musterlieferung
Bibliotheksbau
Sequenzierung
Datenanalyse
Kundendienst
Beinhaltet die folgende Analyse:
- Qualitätskontrolle der Sequenzierungsdaten
- Ausrichtung am Referenzgenom
- Variantenaufruf: SNP und InDel
- Variantenannotation
Variantenaufruf: SNP-Typen
Variantenaufruf: InDel-Längenverteilung
Entdecken Sie die Fortschritte, die durch die mikrobiellen Genom-Resequenzierungsdienste von BMKGene ermöglicht wurden, anhand einer kuratierten Sammlung von Publikationen.
Jia, Y. et al. (2023) „Kombination von Transkriptom- und Gesamtgenom-Resequenzierung zum Screening von Krankheitsresistenzgenen für Weizen-Zwergbrand“,Internationale Zeitschrift für Molekularwissenschaften, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. et al. (2023) „Ampicillin-kontrollierter Glukosestoffwechsel manipuliert den Übergang von Toleranz zu Resistenz bei Bakterien“,Wissenschaftliche Fortschritte, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., ein haloalkaliphiles Bakterium, isoliert aus einem Sodasee in der Autonomen Region Innere Mongolei, China', Int. J. Syst. Evol.Mikrobiologie, 72, S. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. und Wang, G.-H. (2024) 'Genomsequenz von Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, isoliert aus Nasonia vitripennis',Ankündigungen zu Ressourcen im Bereich Mikrobiologie. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
