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Produkte

Metatranskriptomsequenzierung

Der Metatranskriptom-Sequenzierungsdienst von BMKGENE nutzt die Sequenzierungstechnologie von Illumina und enthüllt die dynamische Genexpression einer Vielzahl von Mikroben, von Eukaryoten über Prokaryoten bis hin zu Viren, in natürlichen Umgebungen wie Boden, Wasser, Meer, Stuhl und Darm. Unser umfassender Service ermöglicht es Forschern, in die vollständigen Genexpressionsprofile komplexer mikrobieller Gemeinschaften einzutauchen. Über die taxonomische Analyse hinaus erleichtert unser Metatranskriptom-Sequenzierungsdienst die Erforschung der funktionellen Bereicherung und wirft Licht auf unterschiedlich exprimierte Gene und ihre Rollen. Entdecken Sie eine Fülle biologischer Erkenntnisse, während Sie sich durch die komplexen Landschaften der Genexpression, der taxonomischen Vielfalt und der Funktionsdynamik in diesen vielfältigen Umweltnischen bewegen.


Servicedetails

Bioinformatik

Demo-Ergebnisse

Ausgewählte Veröffentlichungen

Servicefunktionen

● rRNA-Depletion, gefolgt von der gerichteten Vorbereitung der mRNA-Bibliothek.

● Sequenzierung auf Illumina NovaSeq.

Servicevorteile

Studieren Sie die Veränderungen komplexer mikrobieller Gemeinschaften:Dies geschieht auf Transkriptionsebene und erforscht potenzielle neue Gene.

Erklären der Interaktionen der mikrobiellen Gemeinschaft mit dem Wirt oder der Umwelt.

Umfassende bioinformatische Analyse: Dies bietet Einblicke in die taxonomische und funktionelle Zusammensetzung der Gemeinschaft sowie in die Analyse der differentiellen Genexpression.

Umfangreiche Genannotation:Nutzung aktueller Genfunktionsdatenbanken für informative Informationen zur Genexpression mikrobieller Gemeinschaften.

Post-Sales-Support:Unser Engagement geht über den Projektabschluss hinaus und umfasst einen dreimonatigen Kundendienstzeitraum. Während dieser Zeit bieten wir Projektnachverfolgung, Unterstützung bei der Fehlerbehebung und Frage-und-Antwort-Sitzungen an, um alle Fragen zu den Ergebnissen zu beantworten.

Leistungsbeschreibung

Sequenzierungsplattform

Sequenzierungsstrategie

Daten empfohlen

Datenqualitätskontrolle

Illumina NovaSeq

PE150

12 GB

Q30≥85 %

Beispielanforderungen

Konzentration (ng/µL)

Gesamtmenge (µg)

Volumen (µL)

OD260/280

OD260/230

RIN

≥50

≥1,0

≥20

1,8-2,0

1,0-2,5

≥6,5

 

 

 

Service-Workflow

Musterlieferung

Musterlieferung

Bibliotheksvorbereitung

Bibliotheksbau

Sequenzierung

Sequenzierung

Datenanalyse

Datenanalyse

Kundendienst

Kundendienst


  • Vorherige:
  • Nächste:

  • Datum: 7.01

    Beinhaltet die folgende Analyse:

    ● Qualitätskontrolle der Sequenzierungsdaten

    ● Transkriptversammlung

    ● Taxonomische Annotation und Fülle

    ● Funktionale Annotation und Fülle

    ● Expressionsquantifizierung und Differentialanalyse

    Taxonomische Verteilung jeder Probe:

     

     Bild 73

     

    Beta-Diversitätsanalyse: UPGMA

     

    Bild 74 

     

      

    Funktionale Annotation – GO-Häufigkeit

     

    图片75 

     

    Differenzielle Taxonomiehäufigkeit – LEFSE

     

     Foto: 76

     

    Entdecken Sie die Fortschritte, die durch die Meta-Transkriptomik-Sequenzierungsdienste von BMKGene ermöglicht werden, anhand einer kuratierten Sammlung von Veröffentlichungen.

    Lu, Z. et al. (2023) „Säuretoleranz von Laktat verwertenden Bakterien der Ordnung Bacteroidales trägt zur Vorbeugung von Pansenazidose bei Ziegen bei, die an eine hochkonzentrierte Ernährung angepasst sind“,Tierernährung, 14, S. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

    Song, Z. et al. (2017) „Entschlüsselung funktioneller Kernmikrobiota in der traditionellen Festkörperfermentation durch Hochdurchsatz-Amplifikate und Metatranskriptomik-Sequenzierung“,Grenzen in der Mikrobiologie, 8(JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.

    Wang, W. et al. (2022) „Neuartige Mykoviren, die aus einer Metatranskriptomik-Untersuchung des phytopathogenen Alternaria-Pilzes entdeckt wurden“,Viren, 14(11), S. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

    Wei, J. et al. (2022) „Parallele Metatranskriptomanalyse zeigt den Abbau pflanzlicher Sekundärmetaboliten durch Käfer und ihre Darmsymbionten“,Molekular Ökologie, 31(15), S. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.

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