● rRNA-Depletion, gefolgt von der gerichteten Vorbereitung der mRNA-Bibliothek.
● Sequenzierung auf Illumina NovaSeq.
●Studieren Sie die Veränderungen komplexer mikrobieller Gemeinschaften:Dies geschieht auf Transkriptionsebene und erforscht potenzielle neue Gene.
●Erklären der Interaktionen der mikrobiellen Gemeinschaft mit dem Wirt oder der Umwelt.
●Umfassende bioinformatische Analyse: Dies bietet Einblicke in die taxonomische und funktionelle Zusammensetzung der Gemeinschaft sowie in die Analyse der differentiellen Genexpression.
●Umfangreiche Genannotation:Nutzung aktueller Genfunktionsdatenbanken für informative Informationen zur Genexpression mikrobieller Gemeinschaften.
●Post-Sales-Support:Unser Engagement geht über den Projektabschluss hinaus und umfasst einen dreimonatigen Kundendienstzeitraum. Während dieser Zeit bieten wir Projektnachverfolgung, Unterstützung bei der Fehlerbehebung und Frage-und-Antwort-Sitzungen an, um alle Fragen zu den Ergebnissen zu beantworten.
Sequenzierungsplattform | Sequenzierungsstrategie | Daten empfohlen | Datenqualitätskontrolle |
Illumina NovaSeq | PE150 | 12 GB | Q30≥85 % |
Konzentration (ng/µL) | Gesamtmenge (µg) | Volumen (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
Beinhaltet die folgende Analyse:
● Qualitätskontrolle der Sequenzierungsdaten
● Transkriptversammlung
● Taxonomische Annotation und Fülle
● Funktionale Annotation und Fülle
● Expressionsquantifizierung und Differentialanalyse
Taxonomische Verteilung jeder Probe:
Beta-Diversitätsanalyse: UPGMA
Funktionale Annotation – GO-Häufigkeit
Differenzielle Taxonomiehäufigkeit – LEFSE
Entdecken Sie die Fortschritte, die durch die Meta-Transkriptomik-Sequenzierungsdienste von BMKGene ermöglicht werden, anhand einer kuratierten Sammlung von Veröffentlichungen.
Lu, Z. et al. (2023) „Säuretoleranz von Laktat verwertenden Bakterien der Ordnung Bacteroidales trägt zur Vorbeugung von Pansenazidose bei Ziegen bei, die an eine hochkonzentrierte Ernährung angepasst sind“,Tierernährung, 14, S. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) „Entschlüsselung funktioneller Kernmikrobiota in der traditionellen Festkörperfermentation durch Hochdurchsatz-Amplifikate und Metatranskriptomik-Sequenzierung“,Grenzen in der Mikrobiologie, 8(JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et al. (2022) „Neuartige Mykoviren, die aus einer Metatranskriptomik-Untersuchung des phytopathogenen Alternaria-Pilzes entdeckt wurden“,Viren, 14(11), S. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) „Parallele Metatranskriptomanalyse zeigt den Abbau pflanzlicher Sekundärmetaboliten durch Käfer und ihre Darmsymbionten“,Molekular Ökologie, 31(15), S. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.